Međufotoreceptorski matriksni proteoglikan 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom IMPG1.[5]

IMPG1
Identifikatori
AliasiIMPG1
Vanjski ID-jeviOMIM: 602870 MGI: 1926876 HomoloGene: 1201 GeneCards: IMPG1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za IMPG1
Genomska lokacija za IMPG1
Bend6q14.1Početak75,921,114 bp[1]
Kraj76,072,678 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za IMPG1
Genomska lokacija za IMPG1
Bend9 E1|9 43.99 cMPočetak80,220,612 bp[2]
Kraj80,347,534 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija extracellular matrix structural constituent
Ćelijska komponenta extracellular region
GO:0005578 Vanćelijski matriks
Biološki proces Vid
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001563
NM_001282368

NM_022016

RefSeq (bjelančevina)

NP_001269297
NP_001554

NP_071299

Lokacija (UCSC)Chr 6: 75.92 – 76.07 MbChr 9: 80.22 – 80.35 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 797 aminokiselina, а molekulska težina 89.387 Da.[6]

1020304050
MYLETRRAIFVFWIFLQVQGTKDISINIYHSETKDIDNPPRNETTESTEK
MYKMSTMRRIFDLAKHRTKRSAFFPTGVKVCPQESMKQILDSLQAYYRLR
VCQEAVWEAYRIFLDRIPDTGEYQDWVSICQQETFCLFDIGKNFSNSQEH
LDLLQQRIKQRSFPDRKDEISAEKTLGEPGETIVISTDVANVSLGPFPLT
PDDTLLNEILDNTLNDTKMPTTERETEFAVLEEQRVELSVSLVNQKFKAE
LADSQSPYYQELAGKSQLQMQKIFKKLPGFKKIHVLGFRPKKEKDGSSST
EMQLTAIFKRHSAEAKSPASDLLSFDSNKIESEEVYHGTMEEDKQPEIYL
TATDLKRLISKALEEEQSLDVGTIQFTDEIAGSLPAFGPDTQSELPTSFA
VITEDATLSPELPPVEPQLETVDGAEHGLPDTSWSPPAMASTSLSEAPPF
FMASSIFSLTDQGTTDTMATDQTMLVPGLTIPTSDYSAISQLALGISHPP
ASSDDSRSSAGGEDMVRHLDEMDLSDTPAPSEVPELSEYVSVPDHFLEDT
TPVSALQYITTSSMTIAPKGRELVVFFSLRVANMAFSNDLFNKSSLEYRA
LEQQFTQLLVPYLRSNLTGFKQLEILNFRNGSVIVNSKMKFAKSVPYNLT
KAVHGVLEDFRSAAAQQLHLEIDSYSLNIEPADQADPCKFLACGEFAQCV
KNERTEEAECRCKPGYDSQGSLDGLEPGLCGPGTKECEVLQGKGAPCRLP
DHSENQAYKTSVKKFQNQQNNKVISKRNSELLTVEYEEFNHQDWEGN

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000112706 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032343 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: IMPG1 interphotoreceptor matrix proteoglycan 1".
  6. ^ "UniProt, Q17R60" (jezik: engleski). Pristupljeno 8. 10. 2021.

Dopunska literatura uredi