Histon H1.5 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom HIST1H1B sa hromosoma 6.[5][6][7][8]

HIST1H1B
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2RHI

Identifikatori
AliasiH1-5
Vanjski ID-jeviOMIM: 142711 MGI: 1861461 HomoloGene: 136789 GeneCards: H1-5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za HIST1H1B
Genomska lokacija za HIST1H1B
Bend6p22.1Početak27,866,792 bp[1]
Kraj27,867,588 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za HIST1H1B
Genomska lokacija za HIST1H1B
Bend13|13 A3.1Početak21,964,053 bp[2]
Kraj21,964,795 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
histone deacetylase binding
chromatin DNA binding
vezivanje sa RNK
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
double-stranded DNA binding
nucleosomal DNA binding
Ćelijska komponenta Nukleosom
Egzosom
hromosom
jedro
Biološki proces establishment of protein localization to chromatin
nucleosome assembly
protein stabilization
positive regulation of cell growth
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
positive regulation of histone H3-K9 methylation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
chromosome condensation
negative regulation of DNA recombination
muscle organ development
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005322

NM_020034

RefSeq (bjelančevina)

NP_005313

NP_064418

Lokacija (UCSC)Chr 6: 27.87 – 27.87 MbChr 13: 21.96 – 21.96 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 226 aminokiselina, a molekulska težina 22.580 Da.[8]

1020304050
MSETAPAETATPAPVEKSPAKKKATKKAAGAGAAKRKATGPPVSELITKA
VAASKERNGLSLAALKKALAAGGYDVEKNNSRIKLGLKSLVSKGTLVQTK
GTGASGSFKLNKKAASGEAKPKAKKAGAAKAKKPAGATPKKAKKAAGAKK
AVKKTPKKAKKPAAAGVKKVAKSPKKAKAAAKPKKATKSPAKPKAVKPKA
AKPKAAKPKAAKPKAAKAKKAAAKKK

Funkcija

uredi

Histoni su osnovni jedarni proteini odgovorni za strukturu nukleosoma hromosomskog vlakna kod eukariota. Dvije molekule svakog od četiri jezgarna histona (H2A, H2B, H3 i H4) formiraju oktamer, oko kojeg je omotano oko 146 bp DNK u ponavljajuće jedinice, zvane nukleosomi. Linkerski histon, H1, stupa u interakciju s DNK povezivača između nukleosoma i funkcionira u zbijanju hromatina u strukture višeg reda. Ovaj gen je bez introna i kodira člana porodice histona H1. Transkripti ovog gena nemaju poliA repove, ali umjesto toga sadrže palindromski terminacijski element. Ovaj gen nalazi se u malom klasteru histonskih gena na hromosomskoj regiji 6p22-p21.3.[8]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000184357 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000058773 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Albig W, Meergans T, Doenecke D (Mar 1997). "Characterization of the H1.5 gene completes the set of human H1 subtype genes". Gene. 184 (2): 141–8. doi:10.1016/S0378-1119(96)00582-3. PMID 9031620.
  6. ^ Albig W, Kioschis P, Poustka A, Meergans K, Doenecke D (Apr 1997). "Human histone gene organization: nonregular arrangement within a large cluster". Genomics. 40 (2): 314–22. doi:10.1006/geno.1996.4592. PMID 9119399.
  7. ^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (Oct 2002). "The human and mouse replication-dependent histone genes". Genomics. 80 (5): 487–98. doi:10.1016/S0888-7543(02)96850-3. PMID 12408966.
  8. ^ a b c "Entrez Gene: HIST1H1B histone cluster 1, H1b".

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi