Jedini F-kutijski protein 9 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FBXO9.[5][6][7]

FBXO9
Identifikatori
AliasiFBXO9
Vanjski ID-jeviOMIM: 609091 MGI: 1918788 HomoloGene: 8217 GeneCards: FBXO9
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za FBXO9
Genomska lokacija za FBXO9
Bend6p12.1Početak53,051,991 bp[1]
Kraj53,100,873 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za FBXO9
Genomska lokacija za FBXO9
Bend9|9 E1Početak77,988,781 bp[2]
Kraj78,016,347 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
GO:0050372 aktivnost sa transferazom ubikvitina
Ćelijska komponenta citoplazma
kompleks ubikvitin-ligaze
SCF ubiquitin ligase complex
citosol
Biološki proces SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
Urođeni imunski sistem
regulation of TOR signaling
fat cell differentiation
protein ubiquitination
protein polyubiquitination
Posttranslacione modifikacije
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_012347
NM_033480
NM_033481

NM_001081490
NM_023605

RefSeq (bjelančevina)

NP_036479
NP_258441
NP_258442

NP_001074959
NP_076094

Lokacija (UCSC)Chr 6: 53.05 – 53.1 MbChr 9: 77.99 – 78.02 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 447 aminokiselina, а molekulska težina 52.329 Da.[8]

1020304050
MPDIIWVFPPQAEAEEDCHSDTVRADDDEENESPAETDLQAQLQMFRAQW
MFELAPGVSSSNLENRPCRAARGSLQKTSADTKGKQEQAKEEKARELFLK
AVEEEQNGALYEAIKFYRRAMQLVPDIEFKITYTRSPDGDGVGNSYIEDN
DDDSKMADLLSYFQQQLTFQESVLKLCQPELESSQIHISVLPMEVLMYIF
RWVVSSDLDLRSLEQLSLVCRGFYICARDPEIWRLACLKVWGRSCIKLVP
YTSWREMFLERPRVRFDGVYISKTTYIRQGEQSLDGFYRAWHQVEYYRYI
RFFPDGHVMMLTTPEEPQSIVPRLRTRNTRTDAILLGHYRLSQDTDNQTK
VFAVITKKKEEKPLDYKYRYFRRVPVQEADQSFHVGLQLCSSGHQRFNKL
IWIHHSCHITYKSTGETAVSAFEIDKMYTPLFFARVRSYTAFSERPL

Funkcija uredi

Ovaj gen kodira člana F-kutije porodice proteina koju karakterizira približno 40-aminokiselinski motiv F-kutija. Proteini F-kutije čine jednu od četiri podjedinice kompleksa proteinske ubikvitin-ligaze zvane SCF (SKP1-kulin-F-kutija), koje funkcioniraju u ubikvitinaciji zavisnoj o fosforilaciji. Proteini F-kutije podijeljeni su u tri klase: Fbws koji sadrže domene WD-40, Fbls sa ponavljanjima bogatim leucinom, i Fbxs koji sadrže ili različite module interakcije protein-protein ili ne prepoznaju motive. Protein kodiran ovim genom pripada klasi Fbx. Alternativna prerada ovog gena stvara najmanje tri varijante transkripta koje se razlikuju na 5' terminalu.[7]

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000112146 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001366 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (Dec 1999). "Identification of a family of human F-box proteins". Curr Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016/S0960-9822(00)80020-2. PMID 10531035. S2CID 7467493.
  6. ^ Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (Dec 1999). "A family of mammalian F-box proteins". Curr Biol. 9 (20): 1180–2. doi:10.1016/S0960-9822(00)80021-4. PMID 10531037. S2CID 14341845.
  7. ^ a b "Entrez Gene: FBXO9 F-box protein 9".
  8. ^ "UniProt, Q9UK97" (jezik: engleski). Pristupljeno 2. 10. 2021.

Dopunska literatura uredi