Član A porodice sa sličnošću sekvence 49, znan i kao FAM49A, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FAM49A sa hromosoma 2.[5]

FAM49A
Identifikatori
AliasiFAM49A
Vanjski ID-jeviMGI: 1261783 HomoloGene: 12657 GeneCards: FAM49A
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za FAM49A
Genomska lokacija za FAM49A
Bend2p24.2Početak16,549,459 bp[1]
Kraj16,666,331 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 12 (miš)
Hrom.Hromosom 12 (miš)[2]
Hromosom 12 (miš)
Genomska lokacija za FAM49A
Genomska lokacija za FAM49A
Bend12 A1.1|12 5.63 cMPočetak12,312,140 bp[2]
Kraj12,430,966 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_030797

NM_001146119
NM_029758
NM_001364432

RefSeq (bjelančevina)

NP_110424

NP_001139591
NP_084034
NP_001351361

Lokacija (UCSC)Chr 2: 16.55 – 16.67 MbChr 12: 12.31 – 12.43 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Amiokiselininska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 323 aminokiseline, a molkekulska iežina 37.313 Da.[6]

1020304050
MGNLLKVLTREIENYPHFFLDFENAQPTEGEREIWNQISAVLQDSESILA
DLQAYKGAGPEIRDAIQNPNDIQLQEKAWNAVCPLVVRLKRFYEFSIRLE
KALQSLLESLTCPPYTPTQHLEREQALAKEFAEILHFTLRFDELKMRNPA
IQNDFSYYRRTISRNRINNMHLDIENEVNNEMANRMSLFYAEATPMLKTL
SNATMHFVSENKTLPIENTTDCLSTMTSVCKVMLETPEYRSRFTSEETLM
FCMRVMVGVIILYDHVHPVGAFCKTSKIDMKGCIKVLKEQAPDSVEGLLN
ALRFTTKHLNDESTSKQIRAMLQ

Fam49A se nalazi na ljudskom hromosomu 2, na poziciji 2p24.3. Ima 1512 parova baza u transkriptu referentne sekvence iRNK.[7]

Protein

uredi

Gen Fam49A proizvodi potein dužine 323 aminokiseline. Protein ima domene: ostaci 15-319 čine domen nepoznate funkcije (DUF1394, PF07159). Ostaci 67 → 281 čine natporodicu regije interaktivnog citoplazmatskog fragmenta fragilnog X, člana A porodice sa sličnošću sekvence 49.[8]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197872 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020589 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: FAM49A family with sequence similarity 49, member A".
  6. ^ "UniProt, Q9H0Q0" (jezik: engleski). Pristupljeno 12. 11. 2021.
  7. ^ "Nucleotide - family with sequence similarity 49, member A [Homo sapiens]". Nucleotide. National Center for Biotechnology Information, United States National Institutes of Health. Pristupljeno 9. 5. 2009.
  8. ^ "Protein - family with sequence similarity 49, member A [Homo sapiens]". Protein. National Center for Biotechnology Information, United States National Institutes of Health. Pristupljeno 9. 5. 2009.

Dopunska literatura

uredi