Homolog 1 DNK-oštećenjem inducibilnog proteina 1 (S. cerevisiae) je protein koji je kod ljudi kodiran genom DDI1.[5]

DDI1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3S8I

Identifikatori
AliasiDDI1
Vanjski ID-jeviMGI: 1919079 HomoloGene: 100549 GeneCards: DDI1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za DDI1
Genomska lokacija za DDI1
Bend11q22.3Početak104,036,640 bp[1]
Kraj104,039,196 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za DDI1
Genomska lokacija za DDI1
Bend9|9 A1Početak6,262,733 bp[2]
Kraj6,269,846 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001001711

NM_027942

RefSeq (bjelančevina)

NP_001001711

NP_082218

Lokacija (UCSC)Chr 11: 104.04 – 104.04 MbChr 9: 6.26 – 6.27 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

U nedavnoj studiji, navodi se da je karcinom jednjkačkih pločastih ćelija (ESCC) čest maligni karcinom širom svijeta. Unatoč nedavnim poboljšanjima hirurških tehnika i adjuvantnih terapija, prognoza pacijenata s uznapredovalim ESCC-om i dalje je loša. Otpornost na hemoradioterapiju (CRT) i dalje je glavni uzrok neuspjeha liječenja pacijenata sa uznapredovalim ESCC-om. Konstatira se da NRIP3 (protein 3 u interakciji s jedarnim receptorima) podstiče rast tumorskih ćelijaa ESCC-a i otpornost na CRT u ESCC ćelijama, povećanjem i vezanjem za DDI1 (DNK inducibilni 1 homolog 1) i RTF2 (homologno Schizosaccharomyces pombe Rtf2) i ubrzavanjem uklanjanja RTF2, koji je ključna odrednica sposobnosti ćelijaa da upravljaju stresom replikacije. Osim toga, otkrili su da NRIP3 može povećati ekspresiju DDI1 putem PPARα. Os NRIP3-PPARα-DDI1-RTF2 predstavlja zaštitni molekulski put u ESCC ćelija koji posreduje otpornost na replikacijske stresne signale inducirane hemoradioterapijom. Osim toga, povišeni NRIP3 povezan je s lošim kliničkim ishodom pacijenata s ESCC-om koji primaju radioterapiju i/ili hemoterapiju na bazi cisplatina. Studija stoga otkriva da je NRIP3 prognostički faktor u ESCC -u i da bi mogao imati određenu prediktivnu vrijednost za odabir pacijenata koji imaju koristi od CRT terapije. U ovoj studiji otkriven je i uobičajeni mehanizam koji štiti tumorske ćelije ESCC -a od oštećenja DNK, izazvanog CRT–om.[6]

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 396 aminokiselina, a molekulska težina 44.124 Da.[7]

1020304050
MLITVYCVRRDLSEVTFSLQVSPDFELRNFKVLCEAESRVPVEEIQIIHM
ERLLIEDHCSLGSYGLKDGDIVVLLQKDNVGPRAPGRAPNQPRVDFSGIA
VPGTSSSRPQHPGQQQQRTPAAQRSQGLASGEKVAGLQGLGSPALIRSML
LSNPHDLSLLKERNPPLAEALLSGSLETFSQVLMEQQREKALREQERLRL
YTADPLDREAQAKIEEEIRQQNIEENMNIAIEEAPESFGQVTMLYINCKV
NGHPLKAFVDSGAQMTIMSQACAERCNIMRLVDRRWAGVAKGVGTQRIIG
RVHLAQIQIEGDFLQCSFSILEDQPMDMLLGLDMLRRHQCSIDLKKNVLV
IGTTGTQTYFLPEGELPLCSRMVSGQDESSDKEITHSVMDSGRKEH

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000170967 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000047619 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: DNA-damage inducible 1 homolog 1 (S. cerevisiae)". Pristupljeno 2. 12. 2012.
  6. ^ Daqin Suo, Ling Wang , Tingting Zeng , Hui Zhang , Lei Li 1, Jinyun Liu , Jingping Yun, Xin-Yuan Guan, Yan Li (2020): NRIP3 upregulation confers resistance to chemoradiotherapy in ESCC via RTF2 removal by accelerating ubiquitination and degradation of RTF2. Oncogenesis, 9(8):75; pmid: 32839439; pmcid: pmc7445249; doi: 10.1038/s41389-020-00260-4
  7. ^ "UniProt, Q8WTU0". Pristupljeno 20. 8. 2021.

Dopunska literatura uredi

Vanjski linkovi uredi

  • PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human Protein DDI1 homolog 1