CREBZF

Transkripcijski faktor CREB/ATF bZIP je protein koji je kod ljudi kodiran genom CREBZF.

CREBZF
Identifikatori
Aliasi	CREBZF
Vanjski ID-jevi	OMIM: 606444 MGI: 2675296 HomoloGene: 10926 GeneCards: CREBZF
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 11 (čovjek) Bend 11q14.1 Početak 85,659,708 bp Kraj 85,682,908 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 7 (miš) Bend 7|7 E1 Početak 90,091,937 bp Kraj 90,097,202 bp
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • vezivanje sa DNK • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • vezivanje identičnih proteina • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Ćelijska komponenta • jedro • mitohondrija Biološki proces • response to virus • negative regulation of gene expression, epigenetic • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	58487	233490
Ensembl	ENSG00000137504	ENSMUSG00000051451
UniProt	Q9NS37	Q91ZR3
RefSeq (mRNK)	NM_001039618 NM_021212	NM_145151
RefSeq (bjelančevina)	NP_001034707	NP_660133
Lokacija (UCSC)	Chr 11: 85.66 – 85.68 Mb	Chr 7: 90.09 – 90.1 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Pregled

Tokom razgrađujuće infekcije u epitelnim ćelijama, ekspresija gena virusa herpes simplex tipa 1 (HSV-1) neposredno-rano (IE) inicira multiproteinski kompleks koji sadrži virion-pridruženi protein VP16 i dva ćelijska proteina, ćelijskii faktor domaćina (HCF) i oct-1. Oct-1 izravno prepoznaje TAATGARAT elemente u promotorima IE gena. Uloga HCF -a nije jasna. HSV-1 također inficira senzorne neurone koji inerviraju mjesto produktivne infekcije i uspostavlja latentnu infekciju u tim ćelijama. Vrlo je vjerojatno da neki nukleokapsid HSV-1 zadržava dio VP16, kada dođe do neuronskog jedra. Stoga se njegova aktivnost mora suzbiti za uspješno uspostavljanje virusne latencije.

Nedavno je otkriven HCF-vezujući ćelijski protein zvan Zhangfei. Zhangfei, na način ovisan o HCF-u, inhibira Luman/LZIP/CREB3, još jedan ćelijski transkripcijski faktor koji veže HCF. Pokazano je da se Zhangfei selektivno eksprimira u ljudskim neuronima. Kada se isporučuje u kultivirane ćelije koje normalno ne eksprimiraju protein, Zhangfei je inhibirao sposobnost VP16 da aktivira ekspresiju HSV-1 IE. Inhibicija je bila specifična za HCF-ovisnu transkripcijsku aktivaciju pomoću VP16, budući da je himerni protein Gal4-VP16 inhibiran samo na promotoru koji sadrži sekvencu TAATGARAT, a ne na promotoru koji sadrži Gal4. Zhangfei povezan s VP16 i inhibirao stvaranje kompleksa VP16-HCF-Oct-1 na motivima TAATGARAT-a. Također je potisnuo HSV-1-induciranu ekspresiju nekoliko ćelijskih gena, uključujući topoizomerazu II alfa, što sugerira da osim što potiskuje ekspresiju IE, može imati inhibitorni učinak na replikaciju DNK HSV-1 i kasnu ekspresiju gena.

Faktor ćelije domaćina (HCF) inicijalno je otkriven kao ćelijski kofaktor, potreban za aktivaciju rane ekspresije gena virusom herpes simplex, putem transaktivatora VP16 povezanog s virionom. HCF također sudjeluje u raznim ćelijskim procesima, iako mehanizam njegovog djelovanja nije poznat. VP16 se veže za HCF preko 4-aminokiselinskog motiva (EHAY), koji jako podsjeća na domen vezanja HCF-a dva osnovna ćelijska proteina s leucinskim zatvaračem, zvanim Luman i Zhangfei. Luman je moćan transkripcijski faktor koji, u testovima prolazne ekspresije, aktivira promotore koji sadrže cAMP ili rasklopljene proteinske elemente odgovora (UPRE). Nasuprot tome, Zhangfei niti veže elemente prepoznavanja konsenzusa za osnovne proteine s patentnim leucinskog zatvarača, niti aktivira promotore koji ih sadrže.

Pokazano je da Zhangfei potiskuje sposobnost Lumana da aktivira transkripciju. Čini se da je HCF potreban za efikasno suzbijanje. Mutant Zhangfei-ja, koji nije mogao vezati HCF, bio je oslabljen u sposobnosti da potisne Luman. Zhangfei nije potisnuo ATF6, transkripcijski faktor blisko povezan s Lumanom, ali one veže HCF, osim ako na njega nije nakalemljen motiv vezivanja HCF -a iz Lumana. Zhangfei je inhibirao HCF-ovisnu aktivaciju promotora koji sadrži UPRE pomoću Gal4-Luman fuzijskog proteina, ali nije uspio inhibirati HCF-nezavisnu aktivaciju Gal4-Luman promotora koji je sadržavao motive vezanja Gal4. Vezivanje HCF-a putem Zhangfeija bilo je potrebno za kolokalizaciju Lumana i Zhangfeija na jedarne domene, što sugerira da bi HCF mogao ciljati proteine na zajedničku lokaciju.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 354 aminokiseline, a molekulska težina 37.134 Da.

10		20		30		40		50
MRHSLTKLLA		ASGSNSPTRS		ESPEPAATCS		LPSDLTRAAA		GEEETAAAGS
PGRKQQFGDE		GELEAGRGSR		GGVAVRAPSP		EEMEEEAIAS		LPGEETEDMD
FLSGLELADL		LDPRQPDWHL		DPGLSSPGPL		SSSGGGSDSG		GLWRGDDDDE
AAAAEMQRFS		DLLQRLLNGI		GGCSSSSDSG		SAEKRRRKSP		GGGGGGGSGN
DNNQAATKSP		RKAAAAAARL		NRLKKKEYVM		GLESRVRGLA		AENQELRAEN
RELGKRVQAL		QEESRYLRAV		LANETGLARL		LSRLSGVGLR		LTTSLFRDSP
AGDHDYALPV		GKQKQDLLEE		DDSAGGVCLH		VDKDKVSVEF		CSACARKASS
SLKM

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

Dopunska literatura

• Misra V, Rapin N, Akhova O, Bainbridge M, Korchinski P (2005). "Zhangfei is a potent and specific inhibitor of the host cell factor-binding transcription factor Luman". J. Biol. Chem. 280 (15): 15257–66. doi:10.1074/jbc.M500728200. PMID 15705566.
• Akhova O, Bainbridge M, Misra V (2005). "The neuronal host cell factor-binding protein Zhangfei inhibits herpes simplex virus replication". J. Virol. 79 (23): 14708–18. doi:10.1128/JVI.79.23.14708-14718.2005. PMC 1287584. PMID 16282471.
• Hogan MR, Cockram GP, Lu R (2006). "Cooperative interaction of Zhangfei and ATF4 in transactivation of the cyclic AMP response element". FEBS Lett. 580 (1): 58–62. doi:10.1016/j.febslet.2005.11.046. PMID 16343488. S2CID 34571628.
• Xie YB, Lee OH, Nedumaran B, Seong HA, Lee KM, Ha H, Lee IK, Yun Y, Choi HS (2008). "SMILE, a new orphan nuclear receptor SHP-interacting protein, regulates SHP-repressed estrogen receptor transactivation". Biochem. J. 416 (3): 463–73. doi:10.1042/BJ20080782. PMID 18657049.
• Valderrama X, Rapin N, Verge VM, Misra V (2009). "Zhangfei induces the expression of the nerve growth factor receptor, trkA, in medulloblastoma cells and causes their differentiation or apoptosis". J. Neurooncol. 91 (1): 7–17. doi:10.1007/s11060-008-9682-6. PMID 18719857. S2CID 25560950.
• Valderrama X, Rapin N, Verge VM, Misra V (2009). "Zhangfei induces the expression of the nerve growth factor receptor, trkA, in medulloblastoma cells and causes their differentiation or apoptosis". J. Neurooncol. 91 (1): 7–17. doi:10.1007/s11060-008-9682-6. PMID 18719857. S2CID 25560950.
• Valderrama X, Rapin N, Misra V (2008). "Zhangfei, a novel regulator of the human nerve growth factor receptor, trkA". J. Neurovirol. 14 (5): 425–36. doi:10.1080/13550280802275904. PMID 19016376. S2CID 20896925.
• Xie YB, Park JH, Kim DK, Hwang JH, Oh S, Park SB, Shong M, Lee IK, Choi HS (2009). "Transcriptional corepressor SMILE recruits SIRT1 to inhibit nuclear receptor estrogen receptor-related receptor gamma transactivation". J. Biol. Chem. 284 (42): 28762–74. doi:10.1074/jbc.M109.034165. PMC 2781422. PMID 19690166.
• Racapé M, Duong Van Huyen JP, Danger R, Giral M, Bleicher F, Foucher Y, Pallier A, Pilet P, Tafelmeyer P, Ashton-Chess J, Dugast E, Pettré S, Charreau B, Soulillou JP, Brouard S (2011). "The involvement of SMILE/TMTC3 in endoplasmic reticulum stress response". PLOS ONE. 6 (5): e19321. doi:10.1371/journal.pone.0019321. PMC 3095597. PMID 21603654.