Kalcij-vezujući tirozinski protein za regulaciji fosforilacije je protein koji je kod ljudi kodiran genom CABYR.[5][6][7][8]

CABYR
Identifikatori
AliasiCABYR
Vanjski ID-jeviOMIM: 612135 MGI: 1918382 HomoloGene: 49299 GeneCards: CABYR
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 18 (čovjek)
Hrom.Hromosom 18 (čovjek)[1]
Hromosom 18 (čovjek)
Genomska lokacija za CABYR
Genomska lokacija za CABYR
Bend18q11.2Početak24,138,987 bp[1]
Kraj24,161,600 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 18 (miš)
Hrom.Hromosom 18 (miš)[2]
Hromosom 18 (miš)
Genomska lokacija za CABYR
Genomska lokacija za CABYR
Bend18|18 A1Početak12,873,379 bp[2]
Kraj12,888,317 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija SH3 domain binding
vezivanje enzima
calcium ion binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
protein domain specific binding
vezivanje iona metala
protein heterodimerization activity
Ćelijska komponenta citoplazma
sperm principal piece
projekcija ćelije
motile cilium
Treplja
sperm fibrous sheath
citoskelet
jedro
sperm end piece
citosol
extracellular region
Biološki proces sperm capacitation
epithelial cilium movement involved in extracellular fluid movement
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001308231
NM_012189
NM_138643
NM_138644
NM_153768

NM_153769
NM_153770

NM_001042418
NM_001042419
NM_001042420
NM_027687
NM_181731

RefSeq (bjelančevina)
NP_001295160
NP_036321
NP_619584
NP_619585
NP_722452

NP_722453
NP_722454
NP_001295160.1

NP_001035883
NP_001035884
NP_001035885
NP_081963
NP_859420

Lokacija (UCSC)Chr 18: 24.14 – 24.16 MbChr 18: 12.87 – 12.89 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Dužina polipeptidnog lanca je 493 aminokiseline, a molekulska masa— 52 774.

Da bi postigli sposobnost oplodnje, spermatozoidi prolaze kroz niz morfoloških i molekulskih procesa sazrijevanja, zvanih kapacitacija, koji uključuju fosforilaciju tirozinskih proteina i povećani unutarćelijski kalcij. Protein koji kodira ovaj gen lokaliziran je na glavnom komadu biča spermatozoida, zajedno sa vlaknastom ovojnicom, sa vezanjem kalcija kada se fosforilizita tokom kapacitacije. Za ovaj gen je identifikovan pseudogen na hromosomu 3. Varijante transkripta ovog gena kodiraju višestruke proteinske izoforme. Dodatni transkript i izoforme nisu u potpunosti okarakterizirani.[8]

Aminokiselinska sekvenca

uredi
Simboli
1020304050
MISSKPRLVVPYGLKTLLEGISRAVLKTNPSNINQFAAAYFQELTMYRGN
TTMDIKDLVKQFHQIKVEKWSEGTTPQKKLECLKEPGKTSVESKVPTQME
KSTDTDEDNVTRTEYSDKTTQFPSVYAVPGTEQTEAVGGLSSKPATPKTT
TPPSSPPPTAVSPEFAYVPADPAQLAAQMLGKVSSIHSDQSDVLMVDVAT
SMPVVIKEVPSSEAAEDVMVAAPLVCSGKVLEVQVVNQTSVHVDLGSQPK
ENEAEPSTASSVPLQDEQEPPAYDQAPEVTLQADIEVMSTVHISSVYNDV
PVTEGVVYIEQLPEQIVIPFTDQVACLKENEQSKENEQSPRVSPKSVVEK
TTSGMSKKSVESVKLAQLEENAKYSSVYMEAEATALLSDTSLKGQPEVPA
QLLDAEGAIKIGSEKSLHLEVEITSIVSDNTGQEESGENSVPQEMEGKPV
LSGEAAEAVHSGTSVKSSSGPFPPAPEGLTAPEIEPEGESTAE

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000154040 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024430 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Naaby-Hansen S, Mandal A, Wolkowicz MJ, Sen B, Westbrook VA, Shetty J, Coonrod SA, Klotz KL, Kim YH, Bush LA, Flickinger CJ, Herr JC (Jan 2002). "CABYR, a novel calcium-binding tyrosine phosphorylation-regulated fibrous sheath protein involved in capacitation". Dev Biol. 242 (2): 236–54. doi:10.1006/dbio.2001.0527. PMID 11820818.
  6. ^ Luo C, Xiao X, Liu D, Chen S, Li M, Xu A, Liu J, Gao S, Wu S, He D (Feb 2007). "CABYR is a novel cancer-testis antigen in lung cancer". Clin Cancer Res. 13 (4): 1288–97. doi:10.1158/1078-0432.CCR-06-1742. PMID 17317841.
  7. ^ Kim YH, Jha KN, Mandal A, Vanage G, Farris E, Snow PL, Klotz K, Naaby-Hansen S, Flickinger CJ, Herr JC (Oct 2005). "Translation and assembly of CABYR coding region B in fibrous sheath and restriction of calcium binding to coding region A". Dev Biol. 286 (1): 46–56. doi:10.1016/j.ydbio.2005.07.005. PMID 16139264.
  8. ^ a b "Entrez Gene: CABYR calcium binding tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated (fibrousheathin 2)".

Vanjski linkovi

uredi

Dopunska literatura

uredi