UQCC

Ubikvinol-citohrom c reduktazni komplekbni šaperonski homolog CBP3 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom UQCC. Ovaj proteinski enzim ima jednoznačni gen, koji je kod ljudi dugi polipeptidni lancac od 299 aminokislina, molekulske mase od 34 600 kDa.

UQCC
Identifikatori
Aliasi	UQCC1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 611797 MGI: 1929472 HomoloGene: 14709 GeneCards: UQCC1
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 20 (čovjek) Bend 20q11.22 Početak 35,302,566 bp Kraj 35,412,031 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 2 (miš) Bend 2|2 H1 Početak 155,688,814 bp Kraj 155,772,230 bp
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine Ćelijska komponenta • mitochondrial inner membrane • membrana • mitohondrija • GO:0016023 citoplazmatska vezikula Biološki proces • mitochondrial respiratory chain complex III assembly • positive regulation of mitochondrial translation Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	55245	56046
Ensembl	ENSG00000101019	ENSMUSG00000005882
UniProt	Q9NVA1	Q9CWU6
RefSeq (mRNK)	NM_001184977 NM_018244 NM_199487 NM_199513	NM_018888 NM_001355441 NM_001355442 NM_001355443
RefSeq (bjelančevina)	NP_001171906 NP_060714 NP_955781	NP_061376 NP_001342370 NP_001342371 NP_001342372
Lokacija (UCSC)	Chr 20: 35.3 – 35.41 Mb	Chr 2: 155.69 – 155.77 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Podložan je u takvom biološkom procesu, kao što je alternativna prerada RNK. Lokaliziran je u membranama, mitohondrijama, unutrašnjim membranama mitohondrija, citoplazmatskim vezikulama.

Kloniranje i ekspresija

Vetter i Wurst (2001) klonirali su miša Uqcc, kojeg su nazvali Bfzb i identificirali njegov ljudski homolog, analizom baze podataka. Izvedeni ljudski i mišji proteini imaju po jedan transmembranski domen i dijele 94% aminokiselinskog identiteta. fluorescentna in situ hibridizacija mišjih embriona otkrila je Bfzb pretežno u nervnom sistemu u razvoju, s najvećom ekspresijom u proliferirajućim neuroepitelima mozga i nervne cijevi, ganglijama kranijskih živaca V, VII, VIII, IX i X, te ganglijima leđnog korijena. Transkripti su takođe otkriveni kod stvaranja oka i smeđe masti. U mozgu odraslog miša snažna ekspresija bila je ograničena na mirisni bulbus, hipokampus, piriformni korteks i Purkinjeove ćelije malog mozga. Protein Bfzb lokaliziran je u citoplazmatskim vezikulskim strukturama.

Aminokiselinska sekvenca

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MALLVRVLRN		QTSISQWVPV		CSRLIPVSPT		QGQGDRALSR		TSQWPQMSQS
RACGGSEQIP		GIDIQLNRKY		HTTRKLSTTK		DSPQPVEEKV		GAFTKIIEAM
GFTGPLKYSK		WKIKIAALRM		YTSCVEKTDF		EEFFLRCQMP		DTFNSWFLIT
LLHVWMCLVR		MKQEGRSGKY		MCRIIVHFMW		EDVQQRGRVM		GVNPYILKKN
MILMTNHFYA		AILGYDEGIL		SDDHGLAAAL		WRTFFNRKCE		DPRHLELLVE
YVRKQIQYLD		SMNGEDLLLT		GEVSWRPLVE		KNPQSILKPH		SPTYNDEGL

Dopunska literatura

• Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "DNA cloning using in vitro site-specific recombination". Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
• Vetter K, Wurst W (2001). "Expression of a novel mouse gene 'mbFZb' in distinct regions of the developing nervous system and the adult brain". Mech. Dev. 100 (1): 123–5. doi:10.1016/S0925-4773(00)00511-6. PMID 11118897. S2CID 16316354.
• Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). "The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 20". Nature. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038/414865a. PMID 11780052.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
• Imabayashi H, Mori T, Gojo S, et al. (2003). "Redifferentiation of dedifferentiated chondrocytes and chondrogenesis of human bone marrow stromal cells via chondrosphere formation with expression profiling by large-scale cDNA analysis". Exp. Cell Res. 288 (1): 35–50. doi:10.1016/S0014-4827(03)00130-7. PMID 12878157.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). "From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline". Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
• Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). "The LIFEdb database in 2006". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D415–8. doi:10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.