Ćelijskospecifični protein marginalne zone B i B1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom MZB1 sa hromosoma 5.[5]

MZB1
Identifikatori
AliasiMZB1
Vanjski ID-jeviOMIM: 609447 MGI: 1917066 HomoloGene: 12333 GeneCards: MZB1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 5 (čovjek)
Hrom.Hromosom 5 (čovjek)[1]
Hromosom 5 (čovjek)
Genomska lokacija za MZB1
Genomska lokacija za MZB1
Bend5q31.2Početak139,387,467 bp[1]
Kraj139,390,081 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 18 (miš)
Hrom.Hromosom 18 (miš)[2]
Hromosom 18 (miš)
Genomska lokacija za MZB1
Genomska lokacija za MZB1
Bend18|18 B2Početak35,780,320 bp[2]
Kraj35,782,420 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta citoplazma
extracellular region
endoplasmic reticulum lumen
Endoplazmatski retikulum
endoplasmic reticulum chaperone complex
Biološki proces integrin activation
regulation of cell population proliferation
positive regulation of cell population proliferation
GO:0097285 apoptoza
regulation of B cell proliferation
GO:1903104 regulation of insulin receptor signaling pathway
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_016459

NM_027222

RefSeq (bjelančevina)

NP_057543

NP_081498

Lokacija (UCSC)Chr 5: 139.39 – 139.39 MbChr 18: 35.78 – 35.78 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Povezujući ove zone sa kaspazama, u jednom radu iz 2001., navodi se da one imaju važnu ulogu u regulaciji apoptotskih signalnih puteva. Objaviliili su podatke o kloniranju, dvohibridnim sistemom kvasca, s dominantnom negativnom kaspazom-2 kao "mamcem", proapoptotske molekule zvane proapoptotski protein kaspaznog adaptora (PACAP), kodirane otvorenim okvirom čitanja od 372 parova baza. Vezivanje ovog novog proteina za kaspazu-2 (kasp-2) potvrđeno je u dva hibridna testa kvasca, in vitro i in vivo. Zaključena aminokiselinska sekvenca otkrila je homologiju funkcionalnih motiva, uključujući ATP i mjesta vezanja citohroma C. iRNK bila je široko eksprimirana u većini ljudskih tkiva; u transficiranim ćelijamama, bio je difuzno eksprimiran u citoplazmi. Studije vezivanja sa rekombinantnim proteinom pokazale su specifično vezivanje za casp -2 i casp –9, ali ne i za casp –3, –4,–7 ili –8 u ćelijskim ekstraktima. Eksperimenti kotransfekcije pokazali su da se protrin PACAP veže za casp –2 i –9 u ćelijama 293T. Osim toga, studije sa skraćenim PACAP-om pokazale su potrebu za ostacima 39-72 PACAP-a za specifično vezivanje za casp-2 i –9.

Prolazna transfekcija PACAP-a u 293T ćelije ljudskog bubrega i fibroblaste pacova pokrenula je apoptozu nakon 24 sata, što je barem djelimično spriječeno inhibitorom enzima sličnih casp-3. Transfekcija PACAP a u ljudske B-ćelijske linije korištenjem retrovirusnog sistema, također je pokrenula apoptotsku ćelijsku smrt. Osim toga, transkripcija PACAP-a u primarnim ljudskim B-ćelijama dramatično je smanjena rano nakon ćelijske aktivacije pomoću CD40L i Staphylococcus aureus i značajno povećana kao ćelijska apoptoza. Ovi nalazi identifikuju novi proapoptotski protein adaptora kaspaze.[6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 189 aminokiselina, а molekulska težina 20.694 Da.[7]

1020304050
MRLSLPLLLLLLGAWAIPGGLGDRAPLTATAPQLDDEEMYSAHMPAHLRC
DACRAVAYQMWQNLAKAETKLHTSNSGGRRELSELVYTDVLDRSCSRNWQ
DYGVREVDQVKRLTGPGLSEGPEPSISVMVTGGPWPTRLSRTCLHYLGEF
GEDQIYEAHQQGRGALEALLCGGPQGACSEKVSATREEL

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000170476 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024353 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Marginal zone B and B1 cell-specific protein".
  6. ^ Bonfoco E., Li E., Kolbinger F., Cooper N.R.J. (2001): Characterization of a novel proapoptotic caspase-2- and caspase-9-binding protein. Biol. Chem. 276:29242-29250. PubMed [Europe PMC]
  7. ^ "UniProt, Q8WU39" (jezik: engleski). Pristupljeno 17. 10. 2021.

Dopunska literatura

uredi