CHRDL1

(Preusmjereno sa VOPT)

Hordinoliki protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom CHRDL1.[5] CHRDL1 je strukturni glikoprotein koji se nalazi na X hromozomu i specifično kodira venotropin, koji je antagonistički protein morfogenom proteinu kostiju 4.[6]

CHRDL1
Identifikatori
AliasiCHRDL1
Vanjski ID-jeviOMIM: 300350 MGI: 1933172 HomoloGene: 12834 GeneCards: CHRDL1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom X
Hrom.Hromosom X[1]
Hromosom X
Genomska lokacija za CHRDL1
Genomska lokacija za CHRDL1
BendXq23Početak110,673,856 bp[1]
Kraj110,795,819 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom X (miš)
Hrom.Hromosom X (miš)[2]
Hromosom X (miš)
Genomska lokacija za CHRDL1
Genomska lokacija za CHRDL1
BendX|X F2Početak142,068,670 bp[2]
Kraj142,177,258 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001143981
NM_001143982
NM_001143983
NM_145234

NM_001114385
NM_031258
NM_001358592

RefSeq (bjelančevina)
NP_001137453
NP_001137454
NP_001137455
NP_660277
NP_001354133

NP_001354134
NP_001354135
NP_001354136
NP_001354137
NP_001354138

NP_001107857
NP_112548
NP_001345521

Lokacija (UCSC)Chr X: 110.67 – 110.8 MbChr X: 142.07 – 142.18 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira antagonist morfogenetskog proteina kosti 4. Kodirani protein može iati ulogu u topografskoj retinotektumskoj projekciji i regulaciji mrežnjačine angiogeneza, kao odgovor na hipoksiju. Opisane su [[alternativna prerada RNK]|alternativno prerađene]] varijante transkripata koje kodiraju različite izoforme

CHRDL1 iMa važnu ulogu u procesima kao što su diferencijacije embrionskih ćelija, osteogeneze, neurogeneze, suzbijanja tumora i metastaza, te formiranja mrežnjače.[7][8] Najjača ekspresija ovog gena je u prednjem segmentu oka i mrežnjači, kao i u malom mozgu i neokorteksu. U nerekorteksu vrhunac dostiže u vrijeme sazrijevanja sinapsi, kako bi se omogućilo pravilno stvaranje sinapsnih formacija.[9] Zato je ovaj gen važan za pravilno formiranje dijelova centralnog nervnog sistema i očiju.

Klinički značaj

uredi

Mutacije u CHRDL1 povezane su sa Neuhäuserovim sindromom, X-vezanom megalocorneom i centralnom debljinom rožnjače.[10] Mutacije ovog gena mogu prouzrokovati razne efekte na gore spomenute procese. Jedan potencijalni ishod mutacije CHRDL1 je nesindromna X-vezana megalokornea (XMC), koja je posljedica ili missens ili nonsens mutacije ili mutacije gena sa pomicanjem okvira čitanja. <Ref name XMC je proširenje prednjeg segmenta oka koje može dovesti do drugih problema, kao što su katarakt i glaukom. Drugi potencijalni ishod je kancerogena formacija. Budući da je CHRDL1 supresor tumora i metastaza, mutacija ovog gena može izazvati stvaranje tumorskih ćelija. Najvažniji učinak koji bi mutacija mogla imati je na stabilizaciju sinapsi. Budući da gen ograničava plastičnost sinapsi, mutacija može uzrokovati probleme u njihovom pravilnom sazrijevanju, što dovodi do različitih neuroloških poremećaja. Još uvijek ne postoji nokaut model za ovaj gen koji bi pokazao da li poremećaj može uzrokovati promjene sinapsninih događaja i smanjenje sinapsnih GluA2 AMPAR-i koji dovode do smanjene plastičnosti.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000101938 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031283 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Chordin-like 1". Pristupljeno 6. 8. 2014.
  6. ^ Pfirrmann T, Emmerich D, Ruokonen P, Quandt D, Buchen R, Fischer-Zirnsak B, et al. (juni 2015). "Molecular mechanism of CHRDL1-mediated X-linked megalocornea in humans and in Xenopus model". Human Molecular Genetics. 24 (11): 3119–32. doi:10.1093/hmg/ddv063. PMID 25712132.
  7. ^ Liu T, Li B, Zheng XF, Jiang SD, Zhou ZZ, Xu WN, et al. (2019). "Chordin-Like 1 Improves Osteogenesis of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Through Enhancing BMP4-SMAD Pathway". Frontiers in Endocrinology (jezik: engleski). 10: 360. doi:10.3389/fendo.2019.00360. PMC 6582276. PMID 31249554.
  8. ^ Pei YF, Zhang YJ, Lei Y, Wu WD, Ma TH, Liu XQ (april 2017). "Hypermethylation of the CHRDL1 promoter induces proliferation and metastasis by activating Akt and Erk in gastric cancer". Oncotarget. 8 (14): 23155–23166. doi:10.18632/oncotarget.15513. PMC 5410293. PMID 28423564.
  9. ^ Blanco-Suarez E, Liu TF, Kopelevich A, Allen NJ (decembar 2018). "Astrocyte-Secreted Chordin-like 1 Drives Synapse Maturation and Limits Plasticity by Increasing Synaptic GluA2 AMPA Receptors". Neuron. 100 (5): 1116–1132.e13. doi:10.1016/j.neuron.2018.09.043. PMC 6382071. PMID 30344043.
  10. ^ Davidson AE, Cheong SS, Hysi PG, Venturini C, Plagnol V, Ruddle JB, et al. (2014). "Association of CHRDL1 mutations and variants with X-linked megalocornea, Neuhäuser syndrome and central corneal thickness". PLOS ONE. 9 (8): e104163. Bibcode:2014PLoSO...9j4163D. doi:10.1371/journal.pone.0104163. PMC 4122416. PMID 25093588.

Dopunska literatura

uredi