Ribonukleoprotein
Ribonukleoproteini (RNP) su takvi nukleoproteini koji sadrže RNK, tj. nastaju spajanjem RNK i proteina (poznati i kao protein-RNK kompleksi). Nekoliko poznatih primjera uključuju ribosome, enzim telomerazu, skladišne ribonukleoproteine, RNazu P, hnRNP i male jedarne RNP (snRNP), koji su uključeni u pre-iRNK preradu RNK (splajsosomi), a spadaju u glavne komponente nukleosoma.
Dosad je zabilježeno preko 2000 RNP, koji se mogu naći u PDB bazi podataka. Na temelju poznatih struktura, postoje neke zajedničke karakteristike proteina-RNK kompleksa.[1][2][3]
Naprimjer, RNP u snRNP-ovima ima RNK-vezujući strukturni motiv u RNK-vezujućem proteinu. Ostaci aromatskih aminokiselina u ovom motivu su rezultat slaganja interakcije s RNK. Lizinski ostatak u spiralnom dijelu RNK-vezujućeg proteina pomažu da se stabilizira interakcija s nukleinskom kiselinom. Ovo vezivanje je ojačano elektrostskom privlačnošću između pozitivnog lizinskih bočnih lanaca i negativne nukleinske kiseline fosfatne okosnice. Na osnovu toga, moguće je računarsko modeliranje homologije ribonukleoproteina (RNP).[4] RNP među mnogim mogu imati važnu ulogu u replikaciji virusa gripe A. U virusnoj RNK se transkribira u iRNK pomoću RNK polimeraze pričvršćene na RNP.
'RNP' se također može odnositi i na ribonukleoproteinske čestice, odvojene unutarćelijske fokuse za posttanskripcijsku regulaciju.
Anti-RNP antitijela
urediAnti-RNP antitijela su autoantitijela udružena mješovitom bolešću vezivnog tkiva, a otkrivena su u približno 40% pacijenata sa Lupus erythematosus. Dva tipa anti-RNP antitijela su blisko vezana za s Sjögrenov sindrom: SS-A (Ro) i SS-B (La).
Lista ribonukleoproteina
urediOvo je djelimična lista poznatih članova ribonuleoproteinskih familiija:
- hnRNP
- Ribosom
- snRNP
- Ribozim
- Telomeraza
- Skladišna (svodna) organela.
Također pogledajte
urediReference
uredi- ^ Kornberg A. (1989): For the love of enzymes – The Odyssay of a biochemist. Harvard University Press, Cambridge (Mass.), London,ISBN 0-674-30775-5, ISBN 0-674-30776-3.
- ^ Graeme K. Hunter G. K. (2000): Vital Forces. The discovery of the molecular basis of life. Academic Press, London 2000, ISBN 0-12-361811-8.
- ^ Nelson D. L., Michael M. Cox M. M. (2013): Lehninger Principles of Biochemistry. W. H. Freeman, 2013.ISBN 978-1-4641-0962-1.
- ^ Tuszynska, I.; Matelska, D.; Magnus, M.; Chojnowski, G.; Kasprzak, J. M.; Kozlowski, L. P.; Dunin-Horkawicz, S.; Bujnicki, J. M. (2014). "Computational modeling of protein-RNA complex structures". Methods. 65 (3): 310–9. doi:10.1016/j.ymeth.2013.09.014. PMID 24083976.
Vanjski linkovi
uredi- Ribonukleoproteini na US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- PRIDB Protein-RNA Interface Database