Jakoba
Jakoba je rod u taksonu Excavata[1] i ima samo jednu opisanu vrstu, Jakoba libera. (Ranije opisana Jakoba incarcerata preimenovano je u Andalucia incarcerata, a Jakoba bahamensis/Jakoba bahamiensis nije formalno opisana).[2]
| Jakoba (Rod u taksonu Excavata) | |
|---|---|
 Četiri jakobidne vrste, sa utorima i bičevima: Jakoba libera (ventralo), Stygiella incarcerata (ventralno), Reclinomonas americana (dorzalno) i Histiona aroides (vanjski izgled) | |
| Sistematika | |
| Domena | Eukarioti |
| Razred | Jakobea |
| Red | Jakobida |
| Porodica | Jakobidae Patterson 1990 |
| Rod | Jakoba Patterson 1990 |
| Vrste | |
| |
| Sinonimi | |
| |
Opis
urediJakoba je mala bakterivorna morska zooflagellata (jakobid),[3] nađena i u hipersalinskom okruženju.[2]. One su slobodne plivajuće trofičke ćelije s dva biča i dužine između pet i deset mikrometara. Okreću se duž svoje uzdužne osi kako bi omogućile plivanje u pravim linijama [3] osim ako se zbog kompresije u krhotinama ne dogodi deformacija i „škljocanje“. Za vrijeme hranjenja, bakterije se izlaze iz vodenog stuba strujom koju stvara zadnji bič. Ova struja uzrokuje da se bakterije sakupe u brazdi [4] on the right ventral side of the cell [3] – pomažući u gutanju i stvaranju hranjive vakuole.[4]
Ultrastrultura
urediĆelijske komponente kod Jakoba nisu naročito jedinstvene. Sadrže jedno jedro koje se nalazi u blizini baze biča, jedno Golgijevo tijelo, a mitohondrijske organele su spljoštene.
Međutim, mitohondrije kod Jakoba posebno su evolucijski zanimljive zbog jedinstvene bakteriolikosti – poput mitohondrijskog genoma. Utvrđeno je da njihovi mitohondrijski genomi sadrže znatno više funkcionalnih gena drugih eukariotskih grupa i čini se da su zadržali eubakterijsku predačku RNK polimerazu, koja je zamijenjena polimerazom virusa tipa u svim ostalim mitohondrijskim eukariotima. Sve u svemu, jakobidni mitohondrijski genomi su primitivno složeni po tome što više nalikuju svojim proteobakterijskim precima nego što je to kod bilo kojih drugih mitohondrija.[5]
Životni ciklus
urediJakobe karakterizira aseksualna reprodukcija putem binarne fisije. Nije primijećena spolna reprodukcija ili stvaranje cista.[3]
Molekulske sekvence
urediKružni mitohondrijski genom Jakoba libera ATCC 50422 veličine je 96.6 kbp. Sekvenciranje je gotovo završeno. Dosad je identificirano 77 gena, od kojih nijedan nije uključivao intron. Intergenične regije čine ~ 30% genoma i sadrže nakupine tandemskih ponavljanja čija je jedinična dužina ~ 20 bp. Transkribirani geni nalaze se na oba lanca nukleotida u DNK. Za translaciju koristi se standardni genetički kod.
Enkodirani geni uključuju one koji se obično nalaze u mtDNK, uključujući gene koji kodiraju proteine iznad 1,2,2,4,4L, 5,6, cob, cox1,2,3 i atp 6,8,9. kao velike podjedinice (rnl) i male podjedinice (rns) rRNK geni i >22 gema za tRNK. Prisutni su i brojni proteinski geni tipski za protist, ali ne i životinjske ili gljivične mtDNK. Oni uključuju nad7,9,11, atp1, rpl2,5,6,14,16 i rps2-4,11-14,19. Mnogo jedinstvenih ORF-ova je također kodirano s mtDNK u J. libera.
Nekolikomitohondrijskih gena J. libera su rijetki ili ih nema u drugim mitohondrijskim genima, ali su prisutni u bakterijama. Među tim rijetkim ili jedinstvenim kodirajućim mtDNK genima su dpo, rpoB, C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W i nekoliko gena ribosomskog proteina.
Poređenje sekvenci gena u mtDNK J. libera pokazuje klastere koji se inače ne nalaze u bakterijama, ali koji su se očito pojavili tokom evolucije mitohondrijskog genoma, nakon divergencije protomitohondrija iz bakterijske loze. Primjeri su klasteri dpo, rpoB,C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W.[6]
Kulture
urediDanas su dostupne tri kultivirane linije „Jakoba libera“. Ne mogu se uzgajati posebno, već se lahko uzgajaju u minimalnom mediju s dodatkom bakterija (Klebsiella aerogene )[3]
Slični rodovi
urediJakobids (Jakobida ili Jakobea)
- Histiona: 2-3 vrste
- Reclinomonas: 1 vrsta [7]
Malawimonas: 1 opisana vrsta.
Također pogledajte
urediReference
uredi- ^ Rodriquez-Ezpeleta, Naiara; Henner Brinkmann; Gertraud Burger; Andrew J. Roger; Michael W. Gray; Herve Philippe; B. Franz Lang (august 2007). "Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans". Current Biology. 17 (16): 1420–1425. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961.
- ^ a b "Jakoba libera". The Tree of Life Web Project. Arhivirano s originala, 27. 9. 2011. Pristupljeno 3. 4. 2012.
- ^ a b c d e f "Jakoba". Protist Image Database. Arhivirano s originala, 22. 9. 2006. Pristupljeno 3. 4. 2012.
- ^ a b "Jakoba libera". Encyclopedia of Life. Pristupljeno 3. 4. 2012.
- ^ "Jakobida". The Tree of Life Web Project. Arhivirano s originala, 29. 11. 2019. Pristupljeno 10. 2. 2020.
- ^ "Jakoba libera Mitochondria genome organization, gene content, genetic code". Pristupljeno 3. 4. 2012.
- ^ "Introduction to the jakobid flagellates". Protist Image Database. Pristupljeno 12. 4. 2012.
