Dekapiranje informacijske RNK

Proces dekapiranja informacijske RNK uključuje hidroliza strukture 5' cap na RNK izlažući 5' monofosfat. Kod eukariota, ovaj 5' monofosfat je supstrat za 5' egzonukleazu Xrn1^[1] i iRNK se brzo uništava. Postoje mnoge situacije koje mogu dovesti do uklanjanja poklopca, od kojih su neke razmotrene u nastavku.^[2]

Kod prokariota, primarni transkript iRNK prirodno posjeduje 5'-trifosfatnu grupu nakon bakterijske transkripcije; enzim RppH uklanja pirofosfatnu molekulu sa 5' kraja, pretvarajući 5'-trifosfat u 5'-monofosfat, pokrećući degradaciju iRNK pomoću ribonukleaza.^[3]^[4]

Translacija i raspadanje

Unutar ćelija postoji ravnoteža između procesa translacija i raspada iRNK.^[2] Poruke koje se aktivno prevode su vezane polisomima i eukariotski inicijacijski faktori eIF-4E i eIF-4G (kod eukariota). Ovo blokira pristup kapi enzima za dekapiranje DCP2 i štiti molekulu iRNK. U uslovima gladovanja nutritijenata ili virusnih infekcija, translacija može biti ugrožena i dekapiranje se stimuliše. Ova ravnoteža se ogleda u veličini i obilju citoplazmatskih struktura poznatih kao P-tijela.^[5]^[6]

Specifični putevi raspadanja

Postoji niz specifičnih puteva propadanja koji prepoznaju aberantne poruke i promoviraju njihovo uklanjanje. nonsens-posredovano propadanje iRNK prepoznaje preuranjene stop kodone i promoviše dekapiranje kao i propadanje egzosoma. Pokazalo se da određene klase miRNK stimulišu dekapiranje.

Reference

^ Poole, Toni L.; Stevens, Audrey (juni 1997). "Structural Modifications of RNA Influence the 5′ Exoribonucleolytic Hydrolysis by XRN1 and HKE1 ofSaccharomyces cerevisiae". Biochemical and Biophysical Research Communications. 235 (3): 799–805. doi:10.1006/bbrc.1997.6877. PMID 9207242.
^ ^a ^b Meyer, Sylke; Temme, Claudia; Wahle, Elmar (januar 2004). "Messenger RNA Turnover in Eukaryotes: Pathways and Enzymes". Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology. 39 (4): 197–216. doi:10.1080/10409230490513991. PMID 15596551. S2CID 21227254.
^ Deana, Atilio; Celesnik, Helena; Belasco, Joel G. (17. 1. 2008). "The bacterial enzyme RppH triggers messenger RNA degradation by 5′ pyrophosphate removal". Nature. 451 (7176): 355–358. Bibcode:2008Natur.451..355D. doi:10.1038/nature06475. PMID 18202662. S2CID 4321451.
^ Hsieh, Ping-kun; Richards, Jamie; Liu, Quansheng; Belasco, Joel G. (22. 4. 2013). "Specificity of RppH-dependent RNA degradation in Bacillus subtilis". Proceedings of the National Academy of Sciences. 110 (22): 8864–8869. Bibcode:2013PNAS..110.8864H. doi:10.1073/pnas.1222670110. PMC 3670361. PMID 23610425.
^ Sheth, Ujwal; Parker, Roy (2. 5. 2003). "Decapping and Decay of Messenger RNA Occur in Cytoplasmic Processing Bodies". Science. 300 (5620): 805–808. Bibcode:2003Sci...300..805S. doi:10.1126/science.1082320. PMC 1876714. PMID 12730603.
^ Parker, Roy; Sheth, Ujwal (mart 2007). "P Bodies and the Control of mRNA Translation and Degradation". Molecular Cell. 25 (5): 635–646. doi:10.1016/j.molcel.2007.02.011. PMID 17349952.

Šablon:Posttrsnslscijska modifikacija

[1] Poole, Toni L.; Stevens, Audrey (juni 1997). "Structural Modifications of RNA Influence the 5′ Exoribonucleolytic Hydrolysis by XRN1 and HKE1 ofSaccharomyces cerevisiae". Biochemical and Biophysical Research Communications. 235 (3): 799–805. doi:10.1006/bbrc.1997.6877. PMID 9207242.

[meyer-2] Meyer, Sylke; Temme, Claudia; Wahle, Elmar (januar 2004). "Messenger RNA Turnover in Eukaryotes: Pathways and Enzymes". Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology. 39 (4): 197–216. doi:10.1080/10409230490513991. PMID 15596551. S2CID 21227254.

[3] Deana, Atilio; Celesnik, Helena; Belasco, Joel G. (17. 1. 2008). "The bacterial enzyme RppH triggers messenger RNA degradation by 5′ pyrophosphate removal". Nature. 451 (7176): 355–358. Bibcode:2008Natur.451..355D. doi:10.1038/nature06475. PMID 18202662. S2CID 4321451.

[4] Hsieh, Ping-kun; Richards, Jamie; Liu, Quansheng; Belasco, Joel G. (22. 4. 2013). "Specificity of RppH-dependent RNA degradation in Bacillus subtilis". Proceedings of the National Academy of Sciences. 110 (22): 8864–8869. Bibcode:2013PNAS..110.8864H. doi:10.1073/pnas.1222670110. PMC 3670361. PMID 23610425.

[5] Sheth, Ujwal; Parker, Roy (2. 5. 2003). "Decapping and Decay of Messenger RNA Occur in Cytoplasmic Processing Bodies". Science. 300 (5620): 805–808. Bibcode:2003Sci...300..805S. doi:10.1126/science.1082320. PMC 1876714. PMID 12730603.

[6] Parker, Roy; Sheth, Ujwal (mart 2007). "P Bodies and the Control of mRNA Translation and Degradation". Molecular Cell. 25 (5): 635–646. doi:10.1016/j.molcel.2007.02.011. PMID 17349952.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]