Wikipedia

P-tijelo

Razlikovati: P-element.

U citologiji, P-tijela ili preradna tijela, razlikuju se od fokusa koji su formirani faznom separacijom u citoplazmi eukariotskih ćelija koje sadrže mnoge enzime uključene u promet iRNK.[1] P-tijela su visoko konzervirane strukture i primijećena su u somatskim ćelijama kičmenjaka i beskičmenjaka, biljaka i kvasca. Do danas je dokazano da P-tijela imaju fundamentalne uloge u cjelini raspada iRNK, nonsensno posredovano raspadanje iRNK, adenilat-uridilatom bogati element je posredovao raspad iRNK, a mikroRNK (miRNK) inducira utišavanje iRNK.[2] Nisu sve iRNK koje ulaze u P-tijela degradirane, jer je pokazano da neke iRNK mogu izaći iz P-tijela i ponovo pokrenuti translaciju.[3][4] Prečišćavanje i sekvenciranje iRNK iz prečišćenih tijela za preradu pokazalo je da su ove iRNK u velikoj mjeri translativno potisnute uzvodno od translacijske inicijacije i da su zaštićene od raspada 5' iRNK.[5]

P-tijela uključena su u dekapiranje i degradaciju neželjenih iRNK,[6] storing mRNA until needed for translation,[5] i pomaganje u translacijskoj represiji miRNK (povezano sa siRNK).

U neuronima, P-tijela pokreću motorni protein kao odgovor na stimulaciju. Ovo je vjerovatno vezano za lokalnu translaciju u dendritima.[7]

Genski ID Protein Reference Prisustvo u
stresnim
granulama (?)
MOV10 MOV10 [5][8] Da
EDC3 EDC3 [8] Da
EDC4 EDC4 [5] Da
ZCCHC11 TUT4 [5] Ne
DHX9 DHX9 [5] Ne
RPS27A RS27A [5] Ne
UPF1 RENT1 [5] Da
ZCCHC3 ZCHC3 [5] Ne
SMARCA5 SMCA5 [5] Ne
TOP2A TOP2A [5] Ne
HSPA2 HSP72 [5] Ne
SPTAN1 SPTN1 [5] Ne
SMC1A SMC1A [5] Ne
ACTBL2 ACTBL [5] Da
SPTBN1 SPTB2 [5] Ne
DHX15 DHX15 [5] Ne
ARG1 ARGI1 [5] Ne
TOP2B TOP2B [5] Ne
APOBEC3F ABC3F [5] Ne
NOP58 NOP58 [5] Da
RPF2 RPF2 [5] Ne
S100A9 S10A9 [5] Da
DDX41 DDX41 [5] Ne
KIF23 KIF23 [5] Da
AZGP1 ZA2G [5] Ne
DDX50 DDX50 [5] Da
SERPINB3 SPB3 [5] Ne
SBSN SBSN [5] Ne
BAZ1B BAZ1B [5] Ne
MYO1C MYO1C [5] Ne
EIF4A3 IF4A3 [5] Ne
SERPINB12 SPB12 [5] Ne
EFTUD2 U5S1 [5] Ne
RBM15B RB15B [5] Ne
AGO2 AGO2 [5] Da
MYH10 MYH10 [5] Ne
DDX10 DDX10 [5] Ne
FABP5 FABP5 [5] Ne
SLC25A5 ADT2 [5] Ne
DMKN DMKN [5] Ne
DCP2 DCP2 [5][9][10] Ne
S100A8 S10A8 [5] Ne
NCBP1 NCBP1 [5] Ne
YTHDC2 YTDC2 [5] Ne
NOL6 NOL6 [5] Ne
XAB2 SYF1 [5] Ne
PUF60 PUF60 [5] Ne
RBM19 RBM19 [5] Ne
WDR33 WDR33 [5] Ne
PNRC1 PNRC1 [5] Ne
SLC25A6 ADT3 [5] Ne
MCM7 MCM7 [5] Da
GSDMA GSDMA [5] Ne
HSPB1 HSPB1 [5] Da
LYZ LYSC [5] Ne
DHX30 DHX30 [5] Da
BRIX1 BRX1 [5] Ne
MEX3A MEX3A [5] Da
MSI1 MSI1H [5] Da
RBM25 RBM25 [5] Ne
UTP11L UTP11 [5] Ne
UTP15 UTP15 [5] Ne
SMG7 SMG7 [5][8] Da
AGO1 AGO1 [5] Da
LGALS7 LEG7 [5] Ne
MYO1D MYO1D [5] Ne
XRCC5 XRCC5 [5] Ne
DDX6 DDX6/p54/RCK [5][8][11][12] Da
ZC3HAV1 ZCCHV [5] Da
DDX27 DDX27 [5] Ne
NUMA1 NUMA1 [5] Ne
DSG1 DSG1 [5] Ne
NOP56 NOP56 [5] Ne
LSM14B LS14B [5] Da
EIF4E2 EIF4E2 [8] Da
EIF4ENIF1 4ET [5][8] Da
LSM14A LS14A [5][8] Da
IGF2BP2 IF2B2 [5] Da
DDX21 DDX21 [5] Da
DSC1 DSC1 [5] Ne
NKRF NKRF [5] Ne
DCP1B DCP1B [5][12] Ne
SMC3 SMC3 [5] Ne
RPS3 RS3 [5] Da
PUM1 PUM1 [5] Da
PIP PIP [5] Ne
RPL26 RL26 [5] Ne
GTPBP4 NOG1 [5] Ne
PES1 PESC [5] Ne
DCP1A DCP1A [5][9][10][13] Ne
ELAVL2 ELAV2 [5] Da
IGLC2 LAC2 [5] Ne
IGF2BP1 IF2B1 [5] Da
RPS16 RS16 [5] Ne
HNRNPU HNRPU [5] Ne
IGF2BP3 IF2B3 [5] Da
SF3B1 SF3B1 [5] Ne
STAU2 STAU2 [5] Da
ZFR ZFR [5] Ne
HNRNPM HNRPM [5] Ne
ELAVL1 ELAV1 [5] Da
FAM120A F120A [5] Da
STRBP STRBP [5] Ne
RBM15 RBM15 [5] Ne
LMNB2 LMNB2 [5] Ne
NIFK MK67I [5] Ne
TF TRFE [5] Ne
HNRNPR HNRPR [5] Ne
LMNB1 LMNB1 [5] Ne
ILF2 ILF2 [5] Ne
H2AFY H2AY [5] Ne
RBM28 RBM28 [5] Ne
MATR3 MATR3 [5] Ne
SYNCRIP HNRPQ [5] Da
HNRNPCL1 HNRCL [5] Ne
APOA1 APOA1 [5] Ne
XRCC6 XRCC6 [5] Ne
RPS4X RS4X [5] Ne
DDX18 DDX18 [5] Ne
ILF3 ILF3 [5] Da
SAFB2 SAFB2 [5] Da
RBMX RBMX [5] Ne
ATAD3A ATD3A [5] Da
HNRNPC HNRPC [5] Ne
RBMXL1 RMXL1 [5] Ne
IMMT IMMT [5] Ne
ALB ALBU [5] Ne
CSNK1D CK1𝛿 [11] Ne
XRN1 XRN1 [8][9][10] Da
TNRC6A GW182 [8][10][13][14][15] Da
TNRC6B TNRC6B [8] Da
TNRC6C TNRC6C [8] Da
LSM4 LSM4 [9][13] Ne
LSM1 LSM1 [9] Ne
LSM2 LSM2 [9] Ne
LSM3 LSM3 [9][12] Da
LSM5 LSM5 [9] Ne
LSM6 LSM6 [9] Ne
LSM7 LSM7 [9] Ne
CNOT1 CCR4/CNOT1 [8][12] Da
CNOT10 CNOT10 [8] Da
CNOT11 CNOT11 [8] Da
CNOT2 CNOT2 [8] Da
CNOT3 CNOT3 [8] Da
CNOT4 CNOT4 [8] Da
CNOT6 CNOT6 [8] Da
CNOT6L CNOT6L [8] Da
CNOT7 CNOT7 [8] Da
CNOT8 CNOT8 [8] Da
CNOT9 CNOT9 [8] Ne
RBFOX1 RBFOX1 [16] Da
ANKHD1 ANKHD1 [8] Da
ANKRD17 ANKRD17 [8] Da
BTG3 BTG3 [8] Da
CEP192 CEP192 [8] Ne
CPEB4 CPEB4 [8] Da
CPVL CPVL [8] Da
DIS3L DIS3L [8] Ne
DVL3 DVL3 [8] Ne
FAM193A FAM193A [8] Ne
GIGYF2 GIGYF2 [8] Da
HELZ HELZ [8] Da
KIAA0232 KIAA0232 [8] Da
KIAA0355 KIAA0355 [8] Ne
MARF1 MARF1 [8] Da
N4BP2 N4BP2 [8] Ne
PATL1 PATL1 [8] Da
RNF219 RNF219 [8] Da
ST7 ST7 [8] Da
TMEM131 TMEM131 [8] Da
TNKS1BP1 TNKS1BP1 [8] Da
TTC17 TTC17 [8] Da

Reference

uredi
  1. ^ Luo Y, Na Z, Slavoff SA (maj 2018). "P-Bodies: Composition, Properties, and Functions". Biochemistry. 57 (17): 2424–2431. doi:10.1021/acs.biochem.7b01162. PMC 6296482. PMID 29381060.
  2. ^ Kulkarni M, Ozgur S, Stoecklin G (februar 2010). "On track with P-bodies". Biochemical Society Transactions. 38 (Pt 1): 242–251. doi:10.1042/BST0380242. PMID 20074068.
  3. ^ Brengues M, Teixeira D, Parker R (oktobar 2005). "Movement of eukaryotic mRNAs between polysomes and cytoplasmic processing bodies". Science. 310 (5747): 486–489. Bibcode:2005Sci...310..486B. doi:10.1126/science.1115791. PMC 1863069. PMID 16141371.
  4. ^ Bhattacharyya SN, Habermacher R, Martine U, Closs EI, Filipowicz W (juni 2006). "Relief of microRNA-mediated translational repression in human cells subjected to stress". Cell. 125 (6): 1111–1124. doi:10.1016/j.cell.2006.04.031. PMID 16777601. S2CID 18353167.
  5. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw ax ay az ba bb bc bd be bf bg bh bi bj bk bl bm bn bo bp bq br bs bt bu bv bw bx by bz ca cb cc cd ce cf cg ch ci cj ck cl cm cn co cp cq cr cs ct cu cv cw cx cy cz da db dc dd de df dg dh di dj dk dl dm dn do dp dq dr ds dt du dv dw Hubstenberger A, Courel M, Bénard M, Souquere S, Ernoult-Lange M, Chouaib R, et al. (oktobar 2017). "P-Body Purification Reveals the Condensation of Repressed mRNA Regulons". Molecular Cell. 68 (1): 144–157.e5. doi:10.1016/j.molcel.2017.09.003. PMID 28965817.
  6. ^ Sheth U, Parker R (maj 2003). "Decapping and decay of messenger RNA occur in cytoplasmic processing bodies". Science. 300 (5620): 805–808. Bibcode:2003Sci...300..805S. doi:10.1126/science.1082320. PMC 1876714. PMID 12730603.
  7. ^ Cougot N, Bhattacharyya SN, Tapia-Arancibia L, Bordonné R, Filipowicz W, Bertrand E, Rage F (decembar 2008). "Dendrites of mammalian neurons contain specialized P-body-like structures that respond to neuronal activation". The Journal of Neuroscience. 28 (51): 13793–13804. doi:10.1523/JNEUROSCI.4155-08.2008. PMC 6671906. PMID 19091970.
  8. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq Youn JY, Dunham WH, Hong SJ, Knight JD, Bashkurov M, Chen GI, et al. (februar 2018). "High-Density Proximity Mapping Reveals the Subcellular Organization of mRNA-Associated Granules and Bodies". Molecular Cell. 69 (3): 517–532.e11. doi:10.1016/j.molcel.2017.12.020. PMID 29395067.
  9. ^ a b c d e f g h i j Ingelfinger D, Arndt-Jovin DJ, Lührmann R, Achsel T (decembar 2002). "The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci". RNA. 8 (12): 1489–1501. doi:10.1017/S1355838202021726. PMC 1370355. PMID 12515382.
  10. ^ a b c d Kedersha N, Stoecklin G, Ayodele M, Yacono P, Lykke-Andersen J, Fritzler MJ, et al. (juni 2005). "Stress granules and processing bodies are dynamically linked sites of mRNP remodeling". The Journal of Cell Biology. 169 (6): 871–884. doi:10.1083/jcb.200502088. PMC 2171635. PMID 15967811.
  11. ^ a b Zhang B, Shi Q, Varia SN, Xing S, Klett BM, Cook LA, Herman PK (juli 2016). "The Activity-Dependent Regulation of Protein Kinase Stability by the Localization to P-Bodies". Genetics. 203 (3): 1191–1202. doi:10.1534/genetics.116.187419. PMC 4937477. PMID 27182950.
  12. ^ a b c d Cougot N, Babajko S, Séraphin B (april 2004). "Cytoplasmic foci are sites of mRNA decay in human cells". The Journal of Cell Biology. 165 (1): 31–40. doi:10.1083/jcb.200309008. PMC 2172085. PMID 15067023.
  13. ^ a b c Eystathioy T, Jakymiw A, Chan EK, Séraphin B, Cougot N, Fritzler MJ (oktobar 2003). "The GW182 protein colocalizes with mRNA degradation associated proteins hDcp1 and hLSm4 in cytoplasmic GW bodies". RNA. 9 (10): 1171–1173. doi:10.1261/rna.5810203. PMC 1370480. PMID 13130130.
  14. ^ Eystathioy T, Chan EK, Tenenbaum SA, Keene JD, Griffith K, Fritzler MJ (april 2002). "A phosphorylated cytoplasmic autoantigen, GW182, associates with a unique population of human mRNAs within novel cytoplasmic speckles". Molecular Biology of the Cell. 13 (4): 1338–1351. doi:10.1091/mbc.01-11-0544. PMC 102273. PMID 11950943.
  15. ^ Yang Z, Jakymiw A, Wood MR, Eystathioy T, Rubin RL, Fritzler MJ, Chan EK (novembar 2004). "GW182 is critical for the stability of GW bodies expressed during the cell cycle and cell proliferation". Journal of Cell Science. 117 (Pt 23): 5567–5578. doi:10.1242/jcs.01477. PMID 15494374.
  16. ^ Kucherenko MM, Shcherbata HR (januar 2018). "Stress-dependent miR-980 regulation of Rbfox1/A2bp1 promotes ribonucleoprotein granule formation and cell survival". Nature Communications. 9 (1): 312. Bibcode:2018NatCo...9..312K. doi:10.1038/s41467-017-02757-w. PMC 5778076. PMID 29358748.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi
Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=P-tijelo&oldid=3482634"