Protein 157 pridružen cilijama i flagelama (CFAP157), znan i kao otvoreni okvir čitanja 117 hromosoma 9 (c9orf117) jest protein loji je kod ljudi kodiran genomt CFAP157 .

CFAP157
Identifikatori
Aliasi
Vanjski ID-jeviGeneCards: [1]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

n/a

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)n/an/a
PubMed pretragan/an/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Prema UniProt-u, gen CFAP157 je "specifično potreban tokom spermatogeneze za morfogenezu flagela i pokretljivost sperme, a može biti potreban i za suzbijanje stvaranja prekobrojnih aksonema i osiguravanje ispravne ultrastrukture".[1]

Lokacija

uredi

CFAP157 se kod ljudi nalazi na hromosomu 9, sekvenca 9q34.11 od baznog para 127.706.989 do baZNOG PARA 127.716.002.[2]

 
Lokacija CFAP157 na hromosomu 9

Obilježja

uredi

Veličina gena je 9.013 baza, a orijentacija je plus lanac.[2] Gen sadrži 9 egzona.[3]

Najčešća varijanta iRNK CFAP157 sadrži 1.722 parova baza.[3]

Ekspresija

uredi

CFAP157 se eksprimira u mnogim tkivima ljudskog tijela, kao što su grlić maternice, pluća, sjemenici i materica. Žeme koje imaju tumor maternice vjerovatno imaju ekspresiju u CFAP157. Ovaj gen je ehsprimiran je i kod odraslih i kod fetusa.[4]

Protein

uredi

Kod čovjeka, u CFAP157 ima 520 aminokiselina.[5] Protein je izuzetno bogat glutaminom, a siromašan glicinom. Prilično je neutralan sa izoelektrična tačka pri pH 7,4.[6] Prosječna molekulska masa proteina procijenjena je na 60,531.748 Da, a koeficijent apsorpcije 25.440 M−1 cm−1.

CFAP157 se prvenstveno sastoji od α-heliksa, a ne postoji transmembranska spirala. Za kreiranje predviđene strukture CFAP157.Program za izradu strukture proteina koristi se program pod nazivom Phyre

 
Predviđena struktura CFAP157 prema Phyre-u

Homologija

uredi

Ne postoji poznati paralog za CFAP157 kod ljudi. CFAP157 ima brojne ortologe. Sljedeća tabela sadrži neke od ortologa, uključujući čovjeka, običnog čimpanzu, rezus-makaka, govedo, psa, miša, pacova, tropsku kandžastu žabu i zebricu.[7]

Vrsta Uobičajeno ime Pristupni broj Identitet sekvence Sličnost sekvence
Homo sapiens Čovjek NP_001012520 100% 100%
Pan troglodytes Obični čimpanza XP_001143084 98,5% 99,0%
Macaca mulatta Reus makak XP_001095281 95,2% 96,4%
Bos taurus Govedo XP_005213477 70,5% 84,0%
Canis lupus familiaris Pas XP_005625392 71,5% 80,9%
Mus musculus Miš NP_079895 64,6% 79,0%
Rattus norvegicus Pacov NP_001094339 64,2% 78,4%
Xenopus tropicalis Tropska kandžasta žaba NP_001072774 41,5% 60,5%
Danio rerio Zebrica NP_001103638 34,0% 54,9%

Interaktivni proteini

uredi

P14335 (Kunjin virus soj MRM61C) je virus koji stupa u interakciju s CFAP157 putem dvohibridnog pregleda. Kunjin virus nije tako ozbiljan kao drugi virusi, ali ovo je zapaženo otkriće jer je moguće iskoristiti interakciju za razvoj novih tipova lijekova. Istraživači sa Univerziteta u Queenslandu otkrili su novu medicinsku upotrebu virusa kunjin 2005. godine, a mogući tretmani uključuju vakcine protiv HIV-a/kancera.[8]

Reference

uredi
  1. ^ "CFAP157 - Cilia- and flagella-associated protein 157 - Homo sapiens (Human) - CFAP157 gene & protein". www.uniprot.org (jezik: engleski). Pristupljeno 5. 2. 2018.
  2. ^ a b Database, GeneCards Human Gene. "CFAP157 Gene - GeneCards | CF157 Protein | CF157 Antibody". www.genecards.org. Pristupljeno 20. 2. 2018.
  3. ^ a b "Homo sapiens cilia and flagella associated protein 157 (CFAP157), tran - Nucleotide - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 23. 4. 2018.
  4. ^ Group, Schuler. "EST Profile - Hs.652519". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 23. 4. 2018.
  5. ^ "cilia- and flagella-associated protein 157 [Homo sapiens] - Protein - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 20. 2. 2018.
  6. ^ "Prot pi | Bioinformatics Calculator". www.protpi.ch (jezik: engleski). Pristupljeno 23. 4. 2018.
  7. ^ "BLAST: Basic Local Alignment Search Tool". blast.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 23. 4. 2018.
  8. ^ "New medical uses for the Kunjin virus". News-Medical.net (jezik: engleski). 12. 4. 2005. Pristupljeno 6. 5. 2018.