CFAP157
Protein 157 pridružen cilijama i flagelama (CFAP157), znan i kao otvoreni okvir čitanja 117 hromosoma 9 (c9orf117) jest protein loji je kod ljudi kodiran genomt CFAP157 .
CFAP157 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||
Aliasi | |||||||
Vanjski ID-jevi | GeneCards: [1] | ||||||
Ortolozi | |||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||
Entrez |
|
| |||||
Ensembl |
|
| |||||
UniProt |
| ||||||
RefSeq (mRNK) |
|
| |||||
RefSeq (bjelančevina) |
|
| |||||
Lokacija (UCSC) | n/a | n/a | |||||
PubMed pretraga | n/a | n/a | |||||
Wikipodaci | |||||||
|
Prema UniProt-u, gen CFAP157 je "specifično potreban tokom spermatogeneze za morfogenezu flagela i pokretljivost sperme, a može biti potreban i za suzbijanje stvaranja prekobrojnih aksonema i osiguravanje ispravne ultrastrukture".[1]
Gen uredi
Lokacija uredi
CFAP157 se kod ljudi nalazi na hromosomu 9, sekvenca 9q34.11 od baznog para 127.706.989 do baZNOG PARA 127.716.002.[2]
Obilježja uredi
Veličina gena je 9.013 baza, a orijentacija je plus lanac.[2] Gen sadrži 9 egzona.[3]
iRNK uredi
Najčešća varijanta iRNK CFAP157 sadrži 1.722 parova baza.[3]
Ekspresija uredi
CFAP157 se eksprimira u mnogim tkivima ljudskog tijela, kao što su grlić maternice, pluća, sjemenici i materica. Žeme koje imaju tumor maternice vjerovatno imaju ekspresiju u CFAP157. Ovaj gen je ehsprimiran je i kod odraslih i kod fetusa.[4]
Protein uredi
Kod čovjeka, u CFAP157 ima 520 aminokiselina.[5] Protein je izuzetno bogat glutaminom, a siromašan glicinom. Prilično je neutralan sa izoelektrična tačka pri pH 7,4.[6] Prosječna molekulska masa proteina procijenjena je na 60,531.748 Da, a koeficijent apsorpcije 25.440 M−1 cm−1.
CFAP157 se prvenstveno sastoji od α-heliksa, a ne postoji transmembranska spirala. Za kreiranje predviđene strukture CFAP157.Program za izradu strukture proteina koristi se program pod nazivom Phyre
Homologija uredi
Ne postoji poznati paralog za CFAP157 kod ljudi. CFAP157 ima brojne ortologe. Sljedeća tabela sadrži neke od ortologa, uključujući čovjeka, običnog čimpanzu, rezus-makaka, govedo, psa, miša, pacova, tropsku kandžastu žabu i zebricu.[7]
Vrsta | Uobičajeno ime | Pristupni broj | Identitet sekvence | Sličnost sekvence |
---|---|---|---|---|
Homo sapiens | Čovjek | NP_001012520 | 100% | 100% |
Pan troglodytes | Obični čimpanza | XP_001143084 | 98,5% | 99,0% |
Macaca mulatta | Reus makak | XP_001095281 | 95,2% | 96,4% |
Bos taurus | Govedo | XP_005213477 | 70,5% | 84,0% |
Canis lupus familiaris | Pas | XP_005625392 | 71,5% | 80,9% |
Mus musculus | Miš | NP_079895 | 64,6% | 79,0% |
Rattus norvegicus | Pacov | NP_001094339 | 64,2% | 78,4% |
Xenopus tropicalis | Tropska kandžasta žaba | NP_001072774 | 41,5% | 60,5% |
Danio rerio | Zebrica | NP_001103638 | 34,0% | 54,9% |
Interaktivni proteini uredi
P14335 (Kunjin virus soj MRM61C) je virus koji stupa u interakciju s CFAP157 putem dvohibridnog pregleda. Kunjin virus nije tako ozbiljan kao drugi virusi, ali ovo je zapaženo otkriće jer je moguće iskoristiti interakciju za razvoj novih tipova lijekova. Istraživači sa Univerziteta u Queenslandu otkrili su novu medicinsku upotrebu virusa kunjin 2005. godine, a mogući tretmani uključuju vakcine protiv HIV-a/kancera.[8]
Reference uredi
- ^ "CFAP157 - Cilia- and flagella-associated protein 157 - Homo sapiens (Human) - CFAP157 gene & protein". www.uniprot.org (jezik: engleski). Pristupljeno 5. 2. 2018.
- ^ a b Database, GeneCards Human Gene. "CFAP157 Gene - GeneCards | CF157 Protein | CF157 Antibody". www.genecards.org. Pristupljeno 20. 2. 2018.
- ^ a b "Homo sapiens cilia and flagella associated protein 157 (CFAP157), tran - Nucleotide - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 23. 4. 2018.
- ^ Group, Schuler. "EST Profile - Hs.652519". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 23. 4. 2018.
- ^ "cilia- and flagella-associated protein 157 [Homo sapiens] - Protein - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 20. 2. 2018.
- ^ "Prot pi | Bioinformatics Calculator". www.protpi.ch (jezik: engleski). Pristupljeno 23. 4. 2018.
- ^ "BLAST: Basic Local Alignment Search Tool". blast.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 23. 4. 2018.
- ^ "New medical uses for the Kunjin virus". News-Medical.net (jezik: engleski). 12. 4. 2005. Pristupljeno 6. 5. 2018.