Protein 878 cinkovog prsta je protein koji je kod ljudi kodiran genom ZNF878.[5][6]

ZNF878
Identifikatori
AliasiZNF878
Vanjski ID-jeviMGI: 2684459 HomoloGene: 135689 GeneCards: ZNF878
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za ZNF878
Genomska lokacija za ZNF878
Bend19p13.2Početak12,043,805 bp[1]
Kraj12,052,961 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za ZNF878
Genomska lokacija za ZNF878
Bend8|8 B3.3Početak72,662,479 bp[2]
Kraj72,688,473 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleic acid binding
vezivanje iona metala
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta jedro
intracellular anatomical structure
Biološki proces GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001080404

NM_133358

RefSeq (bjelančevina)

NP_001073873

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 19: 12.04 – 12.05 MbChr 8: 72.66 – 72.69 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Pokazatelji egzonskih obilježja

uredi
Struktura egzona (Ensembl)[7] Egzonski ID Start egzona Kraj egzona
ENSG00000257446 ENSG00000257446 ENSG00000257446 ENSG00000257446
ENSE00003544954 ENSE00003476818 ENSE00003499367 ENSE00002351857
12043805 12046368 12046634 12052799
12045209 12046428 12046760 12052939

Interakcije

uredi

Pokazalo se da proteini cinkovog prsta ulaze u interakciju s nukleinskim kiselinama i imaju različite funkcije. Domen cinkovog prsta je konzervirani motiv aminokiselinske sekvence koji sadrži po dva posebno postavljena cisteina i histidina, koji su uključeni u koordinaciju cinka. Proteini povezani sa Kruppelom čine jednu porodicu proteina cinkovih prstiju.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000257446 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000066880 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Marine JC, Bellefroid EJ, Bourguignon C, Riviere M, Lecoq PJ, Poncelet DA, Szpirer J, Martial JA, Szpirer C (Oct 1994). "Assignment of the human ZNF83 (HPF1) zinc finger gene to chromosome 19q13.3-q13.4". Genomics. 21 (1): 285–6. doi:10.1006/geno.1994.1262. PMID 8088807.
  6. ^ "Entrez Gene: ZNF83 zinc finger protein 83".
  7. ^ https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=GeneLoc Integrated Map for Chromosome 19: Exon structure for ZNF878 (weizmann.ac.il)

Vanjski linkovi

uredi