1904. godine je osnovan Naples Foot-Ball & Cricket Club od strane engleskog mornara Williama Pothsa i njegov saradnika M. Bayona. 1926. godine mijenja ime u Associazione Calcio Napoli, da bi 1964. godine usvoji sadašnji naziv. Većinu svog postojanja je proveo u vrhu italijanskog nogometa. U sezoni 1961-62. po prvi put osvaja nacionalni kup, dok je u sezoni 1986-87. osvojio domaće prvenstvo po prvi put. Napoli je najuspješniji klub u južnoj Italiji.[2] 2004. godine klub je bankrotirao, ali ga je ponovo osnovao filmski producent Aurelio De Laurentiis kao Napoli Soccer. Potom je otkupio svu njihovu historiju i vratio staro ime klubu.
U periodu od 1984. do 1991. za klub je nastupao Diego Maradona, jedan od najboljih nogometaša svih vremena. On je u Napoli došao iz Barcelone za 6.9 miliona funti.
Tradicionalne boje kluba su plava i bijela. Najveći rivali kluba su Hellas Verona, Lazio i Roma. Od 1959. godine domaće utakmice igra na stadionu San Paolo.