SOX2OT
SOX2 preklapajući trankript (SOX2OT) je dugolančana nekodirajuća RNK, koja sadrži najmanje pet egzona. SOX2 gen, važan regulator neurogeneze, leži unutar jednog od introna SOX2OT, koji se kod ljudi nalazi na hromosoma 3.[3]SOX2OT i SOX2DOT (izoforma SOXOT transkribovana sa distalnog visoko konzerviranog elementa) su izraženi u zonama neurogeneze unutar mozga. Povezan je sa strukturama centralnog nervnog sistema u mozgu zebrica i kokošijih embriona i dinamički se reguliše tokom embriogeneze. SOX2OT može imati ulogu u razvoju kičmenjaka.[4]
| SOX2OT | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | SOX2-OT | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 616338 GeneCards: SOX2-OT | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez |
| ||||||||||||||||||||||||
| Ensembl |
| ||||||||||||||||||||||||
| UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) |
|
| |||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) |
|
| |||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 3: 180.99 – 181.84 Mb | n/a | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [2] | n/a | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Također pogledajte
urediReference
uredi- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000242808 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Fantes J, Ragge NK, Lynch SA, et al. (April 2003). "Mutations in SOX2 cause anophthalmia". Nat. Genet. 33 (4): 461–3. doi:10.1038/ng1120. PMID 12612584.
- ^ Amaral PP, Neyt C, Wilkins SJ, et al. (November 2009). "Complex architecture and regulated expression of the Sox2ot locus during vertebrate development". RNA. 15 (11): 2013–27. doi:10.1261/rna.1705309. PMC 2764477. PMID 19767420.
Dopunska literatura
uredi- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.