Regulator SLC2A4 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SLC2A4RG.[3][4]

SLC2A4RG
Identifikatori
AliasiSLC2A4RG
Vanjski ID-jeviOMIM: 609493 HomoloGene: 88865 GeneCards: SLC2A4RG
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 20 (čovjek)
Hrom.Hromosom 20 (čovjek)[1]
Hromosom 20 (čovjek)
Genomska lokacija za SLC2A4RG
Genomska lokacija za SLC2A4RG
Bend20q13.33Početak63,739,776 bp[1]
Kraj63,744,050 bp[1]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
metal ion binding
nucleic acid binding
GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Ćelijska komponenta citoplazma
nuclear speck
Jedro
Biološki proces GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_020062

n/a

RefSeq (bjelančevina)

NP_064446

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 20: 63.74 – 63.74 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Protein koji je kodiran ovim genom je jedarni faktor transkripcije koji je uključen u aktivaciju porodice nosača rastvorne supstance 2, član 4. Kodirani protein u interakciji je s drugim transkripcijskim faktorom, miocitnim pojačivačem faktora 2, da aktivira transkripciju ovog gena.[4]

Kloniranje i ekspresija uredi

Oshel et al. (2000) identificirali su regiju u 5-glavnom UTR-u GLUT4, označenu kao domen I, koji je bila potrebN za punu GLUT4 promotorsku funkciju. Koristeći tri tandemska ponavljanja domena I na 1-hibridnom skriningu kvaščeve biblioteke cDNK skeletnih mišića, klonirali su djelomičnu SLC2A4RG cDNK, koju su označili kao GEF. Izvedeni protein sadrži domen koja veže DNK i signal jedarne lokalizacije (NLS). Western blot analiza srčanog mišića otkrila je GEF proteine od oko 50 i 70 kD. Analizom Northern blot-a, Knight et al. (2003) otkrili su transkript GEF-a od 1,9 kb u srcu, skeletnim mišićima, jetri, bubrezima i gušterači, ali ne i u plućima, posteljici ili mozgu. GEF označen fluorescencijom lokaliziran u jedrima transficiranih COS-7 ćelija. Korištenje promotorske regije HD gena (HTT; 613004) u 1-hibridnom pregledu kvasca u cDNK biblioteci testisa, Tanaka et al. (2004) klonirali su SLC2A4RG, koji su nazvali HDBP1. Izvedeni protein od 387 aminokiselina ima izračunatu molekulsku masu od 46 kD. HDBP1 sadrži središnju regiju bogatu serinima, zatim regiju bogatu prolinom i domen cinkovog prsta, tipa C2H2. Također ima tri regije koje su visoko konzervirane s HDBP2 (ZNF395; 609494) i mišjim induciranim glukokortikoidom gen-1 (Gig1), kao i dva NLS-a i tri jedarna izlasna signala (NES). Northern blot analizom otkriven je transkript od 1,8 kb u svim ispitivanim tkivima. HDBP1, označen fluorescencijom, lokaliziran u citoplazmi HeLa ćelija i ljudskoj neuronskoj ćelijskoj liniji, a lokalizacija je prebačena na jdra, nakon inhibicije jedarnog iznosa. Mutageneza usmjerena na lokaciju pokazala je da su treći NSZ i drugi NLS HDBP1 bili funkcionalni.[5][6][7]

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000125520 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ Oshel KM, Knight JB, Cao KT, Thai MV, Olson AL (Sep 2000). "Identification of a 30-base pair regulatory element and novel DNA binding protein that regulates the human GLUT4 promoter in transgenic mice". J Biol Chem. 275 (31): 23666–73. doi:10.1074/jbc.M001452200. PMID 10825161.
  4. ^ a b "Entrez Gene: SLC2A4RG SLC2A4 regulator".
  5. ^ Knight, J. B., Eyster, C. A., Griesel, B. A., Olson, A. L. Regulation of the human GLUT4 gene promoter: interaction between a transcriptional activator and myocyte enhancer factor 2A. Proc. Nat. Acad. Sci. 100: 14725-14730, 2003. [PubMed]: 14630949,
  6. ^ Oshel, K. M., Knight, J. B., Cao, K. T., Thai, M. V., Olson, A. L. Identification of a 30-base pair regulatory element and novel DNA binding protein that regulates the human GLUT4 promoter in transgenic mice. J. Biol. Chem. 275: 23666-23673, 2000. [PubMed]: 10825161,
  7. ^ Tanaka, K., Shouguchi-Miyata, J., Miyamoto, N., Ikeda, J. Novel nuclear shuttle proteins, HDBP1 and HDBP2, bind to neuronal cell-specific cis-regulatory element in the promoter for the human Huntington's disease gene. J. Biol. Chem. 279: 7275-7286, 2004. [PubMed]: 14625278.

Dopunska literatura uredi