Konektom
Konektom je sveobuhvatna karta neuronskih veza u mozgu, pa se i može smatrati njegovim "dijagramom ožičenja". U širem smislu, konektom bi uključivao mapiranje svih neuronske veze unutar nervnog sistema organizma.
Proizvodnja i proučavanje konektoma, poznat ikao konektomika, mogu se se kretati u rasponu od detaljne karte sa punim setom neurona i sinapsi unutar dijela ili čitavog nervnog sistema organizma, za opis na makro skali funkcionalne i strukturne povezanosti između svih korteksnim područjima i [[mozak|subkoprteksnih ljudskih struktura. Izraz "konektom" se prvenstveno koristi u naučnim naporima da se uoči, mapira i razumije organizacija neuronskih interakcija u mozgu.
Istraživanja su uspješno izgradila punu konektom jedne životinje: oble gliste Caenorhabditis elegans, a parcijalni konetomi mišje mrežnjače i mišjeg primarnog vidnog korteksa su također uspješno izgrađeni.[2] and mouse primary visual cortex[3] Komplet 12TB podataka je javno dostupan na Open konektom Project Arhivirano 18. 4. 2011. na Wayback Machine.[4] Varshney et al., 2011[5]).
Krajnji cilj konnektomike je mapiranje ljudskog mozga. Ovaj napor se sprovodi istraživanjima u pkviru Projekta ljudski konektom, pod pokroviteljstvom Nacionalnog instituta za zdravlje, čiji je fokus je da se izgradi mrežna mapa ljudskog mozga u ži vih, zdravih, odraslih osoba.
Nastanak i upotreba termina "konektom"
urediU 2005. godini, Olaf Sporns na Indiana University i Patric Hagmann u Lausanne University Hospital nezavisno i istovremeno su predložili termin "konektom" koji se odnosi na kartu neuronskih veza u mozgu. Ovaj termin je nastao po uzoru na tekuće napora za sekvenciranje ljudskog genetičkog koda za izgradnju genoma.
Konnectomika (Hagmann, 2005) je definirana kao znanost koja se bavi sastavljanjem i analizom konektomskih skupova podataka U svom radu o strukturnom opisu ljudskog mozga (The Human Connectome, a structural description of the human brain), Sporns et al. navode:
- Da bismo razumjeli funkcioniranje mreže, moraju se znati njeni elemenata i međusobne veze. Svrha ovog članka je kako bi razgovarali o strategijama istraživanja u cilju sveobuhvatnog strukturnoh opis mreže elemenata i priključaka za formiranje ljudskog mozga. Predlažemo da to zovemo skup ljudskih "konektoma" i tvrdimo da je suštinski važno u kognitivnoj neuroznanosti i neuropsihologiji. Konektom će značajno povećati naše razumijevanje o tome kako funkcionalna stanja mozga izađu iz svojih strukturnih podloga, te će pružiti novi mehanistički uvid u to kako to utiče na funkcije mozga, ako su ove strukturne podloge poremećene.[6][7]
Putevi kroz cerebralnu bijelu tvar može biti ucrtan po histološkoj disekciji i bojenju, metodama degeneracije, a prema aksonskim pretragama. Metodi praćenja aksona čine primarnu osnov za sistematsko kartiranje međumoždanih puteva u opsežne, specifične anatomske veze između matrice sive mase regija. Orijentirne studije su uključene u područja i veze u vidnog kortrks majmuna (Felleman i Van Essen, 1991)[8] i talamo-korteksni sistem mačjeg mozga. (Scannell et al., 1999).[9] Razvoj neuroinformatičke baze podataka za anatomska povezivanja omogućuju kontinuirano ažuriranje i profinjenost tih anatomskih karata veze. Povezivanje korteksa majmuna Maccaca alata za online CoCoMac (Kötter, 2004).[10] je prominentni primjer takve baze podataka. U ljudskom mozgu, značaj konektoma proizlazi iz spoznaje da se struktura i funkcija ljudskog mozga neraskidivo povezane, kroz više razina i načina povezivanja. Postoje snažna prirodna ograničenja po kojima neuroni ili neuronska grupa mogu komunicirati, ili koliko je jaka ili usmjerena njihova interakcija. Zaista, temelj ljudske spoznaje leži u obrascu dinamičke interakcije koju oblikuju konektomi.
Međutim, strukturai funkcija u mozgu su vjerojatno smanjene na jednostavno jedan-na-jedan mapiranje. U stvari, konektom može očigledno podržati veliki broj varijabli dinamičkih stanja, ovisno o trenutnim senzornim inputima, globalno stanje mozga, učenje i razvoj. Neke promjene u funkcijskom stanju mogu uključivati brze promjene strukturnih povezivanja na sinapsnoj razini , kao što je razjašnjena dva-fotonska eksperimenta snimanja pokazuju brzu pojavu i nestanak dendritskih nastavaka (Bonhoeffer and Yuste, 2002).[11] (Bonhoeffer i Yuste, 2002).
Unatoč tako složenom i varijabilnom strukturno-funkcijskom mapiranju, konektom je neophodan temelj za mehanicistička tumačenje dinamičkih podataka mozga, iz snimka jedne funkcionalne ćelije neuroimidžinga.[12] U 2012., Seung je objavio knjigu Connectome: How the Brain's Wiring Makes Us Who We Are.
Također pogledajte
urediReference
uredi- ^ Horn, Andreas; Ostwald, Dirk; Reisert, Marco; Blankenburg, Felix (2013). "The structural-functional connectome and the default mode network of the human brain". NeuroImage. 102: 142–151. doi:10.1016/j.neuroimage.2013.09.069. PMID 24099851.
- ^ Briggman, K. L.; Helmstaedter, M.; Denk, W. (Mar 10, 2011). "Wiring specificity in the direction-selectivity circuit of the retina". Nature. 471 (7337): 183–8. Bibcode:2011Natur.471..183B. doi:10.1038/nature09818. PMID 21390125.
- ^ Bock, Davi D.; Lee, Wei-Chung Allen; Kerlin, Aaron M.; Andermann, Mark L.; Hood, Greg; Wetzel, Arthur W.; Yurgenson, Sergey; Soucy, Edward R.; Kim, Hyon Suk; Reid, R. Clay (2011). "Network anatomy and in vivo physiology of visual cortical neurons". Nature. 471 (7337): 177–182. Bibcode:2011Natur.471..177B. doi:10.1038/nature09802. PMC 3095821. PMID 21390124.
- ^ White, J. G.; Southgate, E.; Thomson, J. N.; Brenner, S. (1986). "The Structure of the Nervous System of the Nematode Caenorhabditis elegans". Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 314 (1165): 1–340. Bibcode:1986RSPTB.314....1W. doi:10.1098/rstb.1986.0056. PMID 22462104.
- ^ Varshney, L. R.; Chen, B. L.; Paniagua, E.; Hall, D. H.; Chklovskii, D. B. (2011). Sporns, Olaf (ured.). "Structural Properties of the Caenorhabditis elegans Neuronal Network". PLoS Computational Biology. 7 (2): e1001066. Bibcode:2011PLSCB...7E0010V. doi:10.1371/journal.pcbi.1001066. PMC 3033362. PMID 21304930.
- ^ Hagmann, Patric (2005). From diffusion MRI to brain connectomics (Thesis). Lausanne: EPFL. doi:10.5075/epfl-thesis-3230. Pristupljeno 16. 1. 2014.
- ^ Sporns, Olaf; Tononi, Giulio; Kötter, Rolf (2005). "The Human Connectome: A Structural Description of the Human Brain". PLoS Computational Biology. 1 (4): e42. Bibcode:2005PLSCB...1...42S. doi:10.1371/journal.pcbi.0010042. PMC 1239902. PMID 16201007..
- ^ Felleman, Daniel J.; Rakic, David C. (1991). "Distributed Hierarchical Processing in the Primate Cerebral Cortex". Cerebral Cortex. 1 (1): 1–47. doi:10.1093/cercor/1.1.1-a. PMID 1822724.
- ^ Scannell, J.W.; Burns, GA; Hilgetag, CC; O'Neil, MA; Young, MP (1999). "The Connectional Organization of the Cortico-thalamic System of the Cat". Cerebral Cortex. 9 (3): 277–99. doi:10.1093/cercor/9.3.277. PMID 10355908.
- ^ Kötter, Rolf (2004). "Online Retrieval, Processing, and Visualization of Primate Connectivity Data From the CoCoMac Database". Neuroinformatics. 2 (2): 127–44. doi:10.1385/NI:2:2:127. PMID 15319511.
- ^ Bonhoeffer, Tobias; Yuste, Rafael (2002). "Spine MotilityPhenomenology, Mechanisms, and Function". Neuron (journal). 35 (6): 1019–27. doi:10.1016/S0896-6273(02)00906-6. PMID 12354393. Zanemaren tekst "Neuron" (pomoć)
- ^ Seung, Sebastian (septembar 2010) [recorded July 2010]. "Sebastian Seung: I am my connectome". TEDTalks. Pristupljeno 7. 8. 2011. CS1 održavanje: nepreporučeni parametar (link)
Vanjski linkovi
uredi- Open Connectome Project Arhivirano 18. 4. 2011. na Wayback Machine
- The Connectome Project at Harvard
- The official site for the NIH-sponsored Human Connectome Project
- The NITRC Human Connectome Project Site
- Connectome Research by EPFL/CHUV, Lausanne, Switzerland
- The NIH Blueprint for Neuroscience Research
- Connectome Research led by Dr. Shawn Mikula
- TED talk by Sebastian Seung: I am my connectome
- EyeWire, a citizen science game to map the retinal connectome
- Connectome on Scholarpedia
- MITK Diffusion: Free software for the processing of diffusion-weighted MR data including connectomics Arhivirano 13. 9. 2014. na Wayback Machine