Katepsin F

gen koji kodira protein u vrsti Homo sapiens

Katepsin F (EC 3.4.22.41 je enzim iz familije papaina, koji je kod čovjeka kodiran iz gena CTSF.[5][6][7][8][9][10][11]

CTSF
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1M6D

Identifikatori
AliasiCTSF, CATSF, CLN13, katepsin F
Vanjski ID-jeviOMIM: 603539 MGI: 1861434 HomoloGene: 31194 GeneCards: CTSF
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za CTSF
Genomska lokacija za CTSF
Bend11q13.2Početak66,563,464 bp[1]
Kraj66,568,879 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 19 (miš)
Hrom.Hromosom 19 (miš)[2]
Hromosom 19 (miš)
Genomska lokacija za CTSF
Genomska lokacija za CTSF
Bend19|19 APočetak4,905,158 bp[2]
Kraj4,910,946 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0070122 peptidase activity
cysteine-type peptidase activity
hydrolase activity
cysteine-type endopeptidase activity
Ćelijska komponenta extracellular vesicle
Lizozom
lysosomal lumen
Egzosom
Vanćelijsko
collagen-containing extracellular matrix
Biološki proces proteolysis involved in cellular protein catabolic process
antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
Proteoliza
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_003793

NM_019861

RefSeq (bjelančevina)

NP_003784

NP_063914

Lokacija (UCSC)Chr 11: 66.56 – 66.57 MbChr 19: 4.91 – 4.91 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Katepsin F, kao rekombinantni enzim, katalizira sledeću hemijsku reakciju:

razlaže sintetske supstrate sa fenilalaninom (Phe) i leucinom (Leu) (u većoj mjeri nego valinom (Val) u P2, sa visokom specifičnošću, sličnom kao i katepsin L.

Katepsini su papainska porodice cistein proteinaza koje predstavljaju glavnu komponentu lizosomnih proteolitskih sistema. U principu, sadrže signalne sekvence, praćene propeptidima, a zatim katalitski aktivnu zrelu regiju. Veoma su dug (ostaci 251 aminokiseline). Prekursor za regiju katepsina F sadrži domene C-kraja koje su slične pro-segmentu katepsina L, sa 50 ostataka fleksibilnog linker peptida, domena N-kraja, izgleda da ima put sličan cistatinskom savijanju. Proregikja katepsin F je jedinstvena u cistein proteaznoj porodici papain u tome što sadrži taj dodatni N-terminalni segment predviđen da dijeli strukturnu sličnosti sa inhibitorima cistein proteaza cistatinske superfamilije C1. Ova cisteinolika domena sadrži neke elemente za koje je poznato da su važne za inhibicijske aktivnosti. CTSF kodira predvidivi protein od 484 aminokiselinae, koji, u signalnom peptidu, sadrži 19 ostataka. Katepsin F sadrži pet potencijalnih lokacija N-glikozilacije, može biti usmjeren na endosomno/lizosomne pregrade preko receptorskog puta manoza 6-fosfata. Gen za katepsin F se sveprisutno ispoljava, a mapiran je na hromosomu 11: *pozicija 11q13, u neposrednoj blizini gena koji kodira katepsin W.

Također pogledajte

uredi

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174080 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000083282 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Cornish-Bowden A. (2004): Fundamentals of enzyme kinetics, 3rd Ed. Portland Press. ISBN 9781855781580; ISBN 1855781581.
  6. ^ Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-222-6.
  7. ^ Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-1-8.
  8. ^ Santamaría, I., Velasco, G., Pendás, A.M., Paz, A. and López-Otín, C. (1999). "Molecular cloning and structural and functional chararcterization of cathepsin F, a new cysteine proteinase of the papain family with a long propeptide domain". J. Biol. Chem. 274: 13800–13809. PMID 10318784.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)
  9. ^ Nägler, D.K. Sulea, T. and Ménard, R. (1999). "Full length cDNA of human cathepsin F predicts the presence of a cystatin domain at the N-terminus of the cysteine protease zymogen". Biochem. Biophys. Res. Commun. 257: 313–318. PMID 10198209.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)
  10. ^ Wex, T., Levy, B., Wex, H. and Brömme, D. (1999). "Human cathepsins F and W: A new subgroup of cathepsins". Biochem. Biophys. Res. Commun. 259: 401–407. PMID 10362521.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)
  11. ^ Wang, B., Shi, G.-P., Yao, P.M., Li, Z., Chapman, H.A. and Brömme, D. (1998). "Human cathepsin F. Molecular cloning, functional expression, tissue localization, and enzymatic characterization". J. Biol. Chem. 273: 32000–32008. PMID 9822672.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)

Vanjski linkovi

uredi