Citohrom b
Citohrom b – u molekulskoj i ćelijskoj biologiji – je protein koji se nalazi u mitohondrijama eukariotskih ćelija. Funkcioniše kao dio lanac transporta elektrona i glavna je podjedinica transmembranskih citohroma bc1 i b6f kompleksa.[1][2]
| Citohrom b | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Mitohondrijski citohrom bc1 kompleks | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | Cyt b | ||||||||
| Pfam | PF00033 | ||||||||
| InterPro | IPR005797 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00171 | ||||||||
| SCOP2 | 3bcc / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.D.3 | ||||||||
| OPM superporodica | 3 | ||||||||
| OPM protein | 3h1j | ||||||||
| CDD | cd00284 | ||||||||
| |||||||||
Funkcija uredi
U mitohondrijama eukariota i kod aerobnih prokariota, citohrom b je komponenta respiratornog lanca kompleksa III (EC 1.10.2.2) — također poznat kao bc1 kompleks ili ubikinol-citohrom c-reduktaza. U hloroplastima biljkama i cijanobakterija, postoji analogni protein, citohrom b6, komponenta plastokinon-plastocijanin reduktaze (EC 1.10.99.1), također poznat kao b6f kompleks . Ovi kompleksi uključeni su u transport elektrona, pumpanje protona da bi se stvorila proton-motorna sila (PMF). Ovaj protonski gradijent koristi se za stvaranje ATP-a. Ovi kompleksi imaju vitalnu ulogu u ćelijama.[3]
Struktura uredi
Citohrom b/b6[4][5] je integralni membranski protein od približno 400 aminokiselinski ostataka koji vjerovatno ima 8 transmembranske segmente. U biljkama i cijanobakterijama, citohrom b6 sastoji se od dvije proteinske podjedinice koje kodiraju geni petB i petD. Citohrom b/b6 nekovalentno vezuje dve hemske grupe, poznate kao b562 i b566. Pretpostavlja se da su četiri konzervirana histidinska ostatka ligandi atoma gvožđa ove dvije hem grupe.
Upotreba u filogenetici uredi
Citohrom b se obično koristi kao region mitohondrijske DNK za određivanje filogenetskih odnosa između organizama, zbog njegove varijabilnosti sekvence. Smatra se najkorisnijim u određivanju odnosa unutar porodica i rodova. Komparativna istraživanja koja uključuju citohrom b rezultirala su novim klasifikacionim shemama i korištena su za dodjeljivanje novoopisanih vrsta u rod, kao i za produbljivanje razumijevanja evolucijskih odnosa.[6]
Klinički značaj uredi
Mutacije u citohromu b prvenstveno rezultiraju netolerancijom na vježbanje kod pacijenata; iako su rjeđe, prijavljene su i teške multisistemske patološke promjene.[7]
Mutacije u jednoj tački u citokromu b Plasmodium falciparum i P. berghei povezane su s rezistencijom na lijek protiv malarije atovaquone.[8]
Ljudski geni uredi
Ljudski geni koji kodiraju proteine citokroma b uključuju:
- CYB5A – citohrom b5 tip A (mikrosomski)
- CYB5B – citohrom b5 tip B (vanjska mitohondrijska membrana)
- CYBASC3 – citohrom b, zavisan od askorbata 3
- MT-CYB – mitohondrijski kodirani citohrom b
Cilj fungicida uredi
Cyt b je meta [[QoI|QŠablon:SubI]] klase fungicida, Akcijski komitet za otpornosti na fungicide grupa 11. cyt b mutacije Šablon:Visible anchor i Šablon:Visible anchor pruža otpor prema glavnom tijelu grupe 11, iako G143A ne djeluje protiv metiltetraprola (11A).[9] G143A je značajan u Botrytis cinerea u proizvodnji jagoda u Kaliforniji.[10] [11]
Reference uredi
- ^ Howell N (august 1989). "Evolutionary conservation of protein regions in the proton motive cytochrome b and their possible roles in redox catalysis". J. Mol. Evol. 29 (2): 157–69. Bibcode:1989JMolE..29..157H. doi:10.1007/BF02100114. PMID 2509716. S2CID 7298013.
- ^ Esposti MD, De Vries S, Crimi M, Ghelli A, Patarnello T, Meyer A (juli 1993). "Mitochondrial cytochrome b: evolution and structure of the protein" (PDF). Biochim. Biophys. Acta. 1143 (3): 243–71. doi:10.1016/0005-2728(93)90197-N. PMID 8329437.
- ^ Blankenship, Robert (2009). Molecular Mechanisms of Photosynthesis. Blackwell Publishing. str. 124–132.
- ^ Howell N (1989). "Evolutionary conservation of protein regions in the protonmotive cytochrome b and their possible roles in redox catalysis". J. Mol. Evol. 29 (2): 157–169. Bibcode:1989JMolE..29..157H. doi:10.1007/BF02100114. PMID 2509716. S2CID 7298013.
- ^ Esposti MD, Crimi M, Ghelli A, Patarnello T, Meyer A, De Vries S (1993). "Mitochondrial cytochrome b: evolution and structure of the protein" (PDF). Biochim. Biophys. Acta. 1143 (3): 243–271. doi:10.1016/0005-2728(93)90197-N. PMID 8329437.
- ^ Castresana, J. (2001). "Cytochrome b Phylogeny and the Taxonomy of Great Apes and Mammals". Molecular Biology and Evolution. 18 (4): 465–471. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a003825. PMID 11264397.
- ^ Blakely EL, Mitchell AL, Fisher N, Meunier B, Nijtmans LG, Schaefer AM, Jackson MJ, Turnbull DM, Taylor RW (juli 2005). "A mitochondrial cytochrome b mutation causing severe respiratory chain enzyme deficiency in humans and yeast". FEBS J. 272 (14): 3583–92. doi:10.1111/j.1742-4658.2005.04779.x. PMID 16008558. S2CID 13938075.
- ^ Siregar JE, Syafruddin D, Matsuoka H, Kita K, Marzuki S (juni 2008). "Mutation underlying resistance of Plasmodium berghei to atovaquone in the quinone binding domain 2 (Qo(2)) of the cytochrome b gene". Parasitology International. 57 (2): 229–32. doi:10.1016/j.parint.2007.12.002. PMID 18248769.
- ^ FRAC (Fungicide Resistance Action Committee) (mart 2021). "FRAC Code List ©*2021: Fungal control agents sorted by cross resistance pattern and mode of action (including coding for FRAC Groups on product labels)" (PDF). Arhivirano s originala (PDF), 5. 11. 2021. Pristupljeno 1. 10. 2022.
- ^ Petrasch, Stefan; Knapp, Steven J.; van Kan, Jan A. L.; Blanco‐Ulate, Barbara (4. 4. 2019). "Grey mould of strawberry, a devastating disease caused by the ubiquitous necrotrophic fungal pathogen Botrytis cinerea". Molecular Plant Pathology. British Society for Plant Pathology (Wiley-Blackwell). 20 (6): 877–892. doi:10.1111/mpp.12794. ISSN 1464-6722.
- ^ Cosseboom, Scott D.; Ivors, Kelly L.; Schnabel, Guido; Bryson, Patricia K.; Holmes, Gerald J. (2019). "Within-Season Shift in Fungicide Resistance Profiles of Botrytis cinerea in California Strawberry Fields". Plant Disease. American Phytopathological Society. 103 (1): 59–64. doi:10.1094/pdis-03-18-0406-re. ISSN 0191-2917. PMID 30422743. S2CID 205345358.
Vanjski linkovi uredi
- Cytochromes b na US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)