Genska porodica
Genska porodica je skup nekoliko sličnih gena, nastalih dupliranjem jednog izvornog gena, sa uglavnom sa sličnim biohemijskim funkcijama. Jedna od takvih porodica su geni za podjedinice ljudskog hemoglobina; deset gena nalazi se u dva klastera na različitim hromosomima, koji se nazivaju α-globin i β-globinski lokus. Smatra se da su ova dva genska klastera nastala kao rezultat duplikacije prekursorskog gena, prije otprilike 500 miliona godina.[1]
Geni su kategorizirani u porodice na osnovu zajedničkih nukleotidnih ili proteinskih sekvenci. Kao rigorozniji test, može se koristiti tehnika filogenetske analize. Položaji egzona unutar kodirajuće sekvence mogu se koristiti za zaključivanje o zajedničkom pretka. Poznavanje proteinske sekvence kodirane genom može omogućiti primenu metoda koje pronalaze sličnosti među proteinskim sekvencama, sa više informacija nego sličnosti ili razlike među sekvencama DNK.
Ako geni iz genetske generacije kodiraju proteine, pojam porodica proteina često se koristi na analogan način kao porodica gena .
Širenje ili skupljanje genskih porodica duž određene loze može biti rezultat slučaja ili rezultat prirodnaše selekcije.[2] U praksi je često teško razlikovati ova dva slučaja. Nedavni rad koristi kombinaciju statističkih modela i algoritamskih tehnika za otkrivanje porodica gena koje su pod dejstvom prirodne selekcije.[3] Komitete za gensku nomenklaturu HUGO (HGNC) stvara sheme nomenklature koristeći simbol "drške" (ili "korijen") za članove genetske porodice (prema homologiji ili funkciji), s hijerarhijskim sistemom numeriranja za razlikovanje pojedinih članova.[4][5] Naprimjer, za porodicu peroksiredoksina, PRDX je korijenski simbol, a članovi porodice su PRDX1, PRDX2, PRDX3, PRDX4, PRDX5 i PRDX6.
Takođwer pogledajte
urediReference
uredi- ^ Nussbaum, Robert L.; McInnes, Roderick R.; Willard, ikksiiskHuntington F. (2016). Thompson & Thompson Genetics in Medicine (8th izd.). Philadelphia, PA: Elsevier. str. 25. ISBN 978-1-4377-0696-3.
- ^ Hartl, D.L. and Clark A.G. 2007. Principles of population genetics. Chapter 7, page 372.
- ^ Demuth, Jeffery P.; Bie, Tijl De; Stajich, Jason E.; Cristianini, Nello; Hahn, Matthew W.; Borevitz, Justin (20. 12. 2006). "The Evolution of Mammalian Gene Families". PLOS ONE. 1 (1): e85. Bibcode:2006PLoSO...1...85D. doi:10.1371/journal.pone.0000085. PMC 1762380. PMID 17183716.
- ^ Daugherty, LC; Seal, RL; Wright, MW; Bruford, EA (Jul 5, 2012). "Gene family matters: expanding the HGNC resource". Human Genomics. 6 (1): 4. doi:10.1186/1479-7364-6-4. PMC 3437568. PMID 23245209.
- ^ HGNC. "Gene group help". Pristupljeno 13. 10. 2020.