Transmembranski p24 prometni protein 3 je protein koji je kod ljudi kodiran genom TMED3.[5]

TMED3
Identifikatori
AliasiTMED3
Vanjski ID-jeviMGI: 1913361 HomoloGene: 7213 GeneCards: TMED3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 15 (čovjek)
Hrom.Hromosom 15 (čovjek)[1]
Hromosom 15 (čovjek)
Genomska lokacija za TMED3
Genomska lokacija za TMED3
Bend15q25.1Početak79,311,112 bp[1]
Kraj79,427,432 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za TMED3
Genomska lokacija za TMED3
Bend9|9 E3.1Početak89,581,259 bp[2]
Kraj89,587,121 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001301203
NM_007364
NM_001330376
NM_001363735

NM_025360

RefSeq (bjelančevina)

NP_001288132
NP_001317305
NP_031390
NP_001350664

NP_079636

Lokacija (UCSC)Chr 15: 79.31 – 79.43 MbChr 9: 89.58 – 89.59 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 217 aminokiselina, a molekulska težina 24.777 Da.[6].

1020304050
MGSTVPRSASVLLLLLLLRRAEQPCGAELTFELPDNAKQCFHEEVEQGVK
FSLDYQVITGGHYDVDCYVEDPQGNTIYRETKKQYDSFTYRAEVKGVYQF
CFSNEFSTFSHKTVYFDFQVGDEPPILPDMGNRVTALTQMESACVTIHEA
LKTVIDSQTHYRLREAQDRARAEDLNSRVSYWSVGETIALFVVSFSQVLL
LKSFFTEKRPISRAVHS

Funkcija uredi

U jednoj studiji polazi se od činjenice da je rak prostate heterogena grupa bolesti i postoji potreba za efikasnijim i ciljanijim metodama liječenja. Potencijal podataka o ekspresiji gena i tehnike interferencije RNK kombinirani su, kako bi se unaprijedili budući personalizirani lijekovi za rak prostate. Da bi se razlikovale najperspektivnije in vivo validirane mete lijekova za rak prostate, izvršena je bioinformatička analiza, korištenjem podataka o ekspresiji gena za čitav genom iz 9.873 uzorka ljudskog tkiva. Za daljnje funkcionalne studije u kultiviranim čelijama raka prostate ukupno je odabrano 295 gena zbog visoke ekspresije njihove iRNK u prostati, raku prostate ili u metastatskim uzorcima raka prostate. DTest održivosti ćelija zasnovan na RNKi izveden je u VCaP i LNCaP ćelijama karcinoma prostate. za daljnju validaciju odabrani rezultati siRNK, uzorci ekspresije gena u ljudskim tkivima i neoplazijama, ciljevi povezani s funkcijom endoplazmatskog retikuluma: AIM1, ERGIC1 i TMED3, kao i mitoza koja regulira TPX2.

Pokazalo se da su AIM1, ERGIC1 i TPX2 visoko eksprimirani, posebno u tkivima karcinoma prostate, i visoka ekspresija iRNK za ERGIC1 i TMED3 povezana sa ekspresijom onkogenog AR i ERG. Utišavanje ERGIC1 posebno je reguliralo proliferaciju ERG onkogenih pozitivnih ćelija karcinoma prostate i inhibiralo je ekspresiju ERG iRNK u tim ćelijama, što ukazuje da je moćan cilj lijeka u ERG pozitivnoj podskupini karcinoma prostate. Ekspresija TPX2 povezana s neuspjehom PSA i utišavanjem TPX2 smanjila je ekspresiju PSA, što ukazuje da TPX2 regulira signalizaciju posredovanu androgenim receptorima. Zaključeno je da kombinacijska upotreba tehnika mikrotalasa i RNKi daje velik broj potencijalnih novih biomarkera i terapijskih ciljeva za budući razvoj ciljanih i personaliziranih pristupa za upravljanje karcinomom prostate.[7]

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000166557 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032353 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Transmembrane p24 trafficking protein 3". Pristupljeno 30. 5. 2017.
  6. ^ "UniProt, Q9Y3Q3". Pristupljeno 20. 7. 2021.
  7. ^ Paula Vainio, John-Patrick Mpindi,Pekka Kohonen,Vidal Fey,Tuomas Mirtti, Kalle A. Alanen, Merja Perälä, Olli Kallioniemi, Kristiina Iljin (2012): High-Throughput Transcriptomic and RNAi Analysis Identifies AIM1, ERGIC1, TMED3 and TPX2 as Potential Drug Targets in Prostate Cancer. PLOS ONE: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0039801

Dopunska literatura uredi