U studiji pridruživanja širom genoma na 3.259 pacijenata s rakom pluća i 4.159 kontrola, McKay et al. (2008) otkrili su značajnu povezanost između raka pluća i dva jednonukleotidna polimorfizma, rs402710 i rs2736100 na hromosomu 5p15,33 (p = 2 x 10 (c –7), odnosno p = 4 x 10 (–6). Nalazi su ponovljeni u 2.899 slučajeva i 5.573 kontrole (p = 7 x 10 (–5) i p = 0,016 za dva SNP-a). Područje osjetljivosti u hromosomskoj regiji 5p15 sadrži dva gena, TERT i CLPTM1L, što ukazuje da jedan ili oba mogu imati ulogu u etiologiji raka pluća.[3]
Wang et al. (2008) otkrili su značajnu povezanost između rs401681 na hromosomskoj sekvenci 5p15.33 i osjetljivosti na rak pluća u studiji pruživanja u cijelom genomu na 5.095 slučajeva raka pluća i 5.200 kontrola. Nalazi su ponovljeni u dodatnih 2.448 slučajeva i 3.036 kontrola (p = 7,90 x 10 (–9). Alel A rs401681 povezan je sa smanjenim rizikom od raka pluća. SNP nalazi se unutar introna 13 gena CLPTM1L.[4]
S obzirom na važnost regije 5p15.33 za biologiju raka i nakon potvrde povezanosti SNP-a unutar regije s rizikom od karcinoma baznih ćelija, Rafnar et al. (2009) procijenili su povezanost SNP rs401681 sa 16 dodatnih tipova raka u preko 30.000 slučajeva raka i 45.000 kontrola. Utvrdili su povezanost alela C s rakom pluća (OR = 1,15, p = 7,2 x 10 (–8) i slabiju povezanost s rakom mokraćnog mjehura, prostate i grlića maternice. Značajno je da većina ovih tipova raka ima snažnu ekološku komponentu rizika. Studija raka pluća obuhvatila je 4.265 pacijenata i 34.666 kontrola.
U studiji pridruživanja širom genoma za karcinom pluća i njegove glavne histološke tipove koji su uključivali 515.922 SNP-a i 5.739 slučajeva raka pluća i 5.848 kontrola, Landi et al. (2009) pronašli su povezanost između TERT SNP rs2736100 i rizika od adenokarcinoma (omjer vjerovatnoće, 1,23; korigirano p = 3,02 x 10 (–7). Metaanaliza kombiniranjem njihovih rezultata sa zbirnim podacima iz 10 prethodnih studija za ukupno 13.300 slučajeva i 19.666 kontrola ponovila je nalaz (omjer vjerovatnoće, 1,24; korigirani p = 3.74 x 10 (–14). Zaključili su da je prethodno identificirana povezanost rs2736100 u hromosomskoj refiji 5p15.33 s rizikom od raka pluća ograničena na histološki tip adenokarcinoma, te su primijetili da se rs2736100 nalazi u intronu 2 TERT -a unutar pretpostavljene regulatorne regije.[5]
Hu et al. (2011) izvršili su skeniranje pridruživanja u genomu za 5.408 ispitanika (2.331 sa karcinomom pluća i 3.077 kontrola), nakon čega je uslijedila dvofazna validacija među 12.722ispitanika (6.313 slučajeva i 6.409 kontrola). Kombinirane analize identifikovale su šest dobro repliciranih SNP-ova sa nezavisnim efektima i značajnim pridruživanjima za rak pluća. Potvrdili su lokus na 5p15,33 u regiji TERT-CLPTM1L koju karakteriziraju rs465498 i rs2736100 (p = 1,2 x 10 (–20), odnosno p = 1,0 x 10 (–27). Autori su također potvrdili povezani SNP, rs4488809, koji se nalazi u prvom intronu TP63 na hromosomu 3, regija 3q28 (p = 7,2 x 10 (–26).[6][7]
^McKay, J. D., Hung, R. J., Gaborieau, V., Boffetta, P., Chabreier, A., Byrnes, G., Zaridze, D., Mukeria, A., Szeszenia-Dabrowska, N., Lissowska, J., Rudnai, P., Fabianova, E., and 62 others. Lung cancer susceptibility locus at 5p15.33. Nature Genet. 40: 1404-1406, 2008. PubMed: 18978790
^Wang, Y., Broderick, P., Webb, E., Wu, X., Vijayakrishnan, J., Matakidou, A., Qureshi, M., Dong, Q., Gu, X., Chen, W. V., Spitz, M. R., Eisen, T., Amos, C. I., Houlston, R. S. Common 5p15.33 and 6p21.33 variants influence lung cancer risk. Nature Genet. 40: 1407-1409, 2008. PubMed: 18978787
^Landi, M. T., Chatterjee, N., Yu, K., Goldin, L. R., Goldstein, A. M., Rotunno, M., Mirabello, L., Jacobs, K., Wheeler, W., Yeager, M., Bergen, A. W., Li, Q. {and 55 others}: A genome-wide association study of lung cancer identifies a region of chromosome 5p15 associated with risk for adenocarcinoma. Am. J. Hum. Genet. 85: 679-691, 2009. Note: Erratum: Am. J. Hum. Genet. 88: 861 only, 2011. PubMed: 19836008
^Hu, Z., Wu, C., Shi, Y., Guo, H., Zhao, X., Yin, Z., Yang, L., Dai, J., Hu, L., Tan, W., Li, Z., Deng, Q., and 33 others. A genome-wide association study identifies two new lung cancer susceptibility loci at 13q12.12 and 22q12.2 in Han Chinese. Nature Genet. 43: 792-796, 2011. PubMed: 21725308
^Rafnar, T., Sulem, P., Stacey, S. N., Geller, F., Gudmundsson, J., Sigurdsson, A., Jakobsdottir, M., Helgadottir, H., Thorlacius, S., Aben, K. K. H., Blondal, T., Thorgeirsson, T. E., and 73 others. Sequence variants at the TERT-CLPTM1L locus associate with many cancer types. Nature Genet. 41: 221-227, 2009. PubMed: 19151717
