Dombrock sistem antigena

Dombrock sistem antigena pripada velikoj skupini supstanci u čiju determinaciju je uključena velika porodica gena ART4. U novijoj nomenklaturi to je Ekto-ADP-riboziltransferaza 4, po enzimu koji je kod ljudi kodiran ART4 genom.[5][6] ART4 je također označen i kao CD297 (Cluster of Diferentiation 297; klaster diferencijacije).

Dombrock sistem antigena
Identifikatori
AliasiART4
Vanjski ID-jeviOMIM: 110600 MGI: 1202710 HomoloGene: 10883 GeneCards: ART4
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za Dombrock sistem antigena
Genomska lokacija za Dombrock sistem antigena
Bend12p12.3Početak14,825,569 bp[1]
Kraj14,843,526 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za Dombrock sistem antigena
Genomska lokacija za Dombrock sistem antigena
Bend6 G1|6 66.72 cMPočetak136,825,449 bp[2]
Kraj136,834,731 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost sa transferazom
GO:0106274 NAD+-protein-arginine ADP-ribosyltransferase activity
glycosyltransferase activity
NAD+ ADP-ribosyltransferase activity
Ćelijska komponenta anchored component of membrane
membrana
extracellular region
ćelijska membrana
Biološki proces protein ADP-ribosylation
arginine metabolic process
peptidyl-arginine ADP-ribosylation
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_021071
NM_001354646

NM_026639

RefSeq (bjelančevina)

NP_066549
NP_001341575

NP_080915

Lokacija (UCSC)Chr 12: 14.83 – 14.84 MbChr 6: 136.83 – 136.83 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovaj gen kodira protein koji sadrži mono-ADP-ribozilacijski (ART) motiv. Član je ADP-riboziltransferazne porodice gena, ali enzimska aktivnost nije demonstrirana u sprovedenim eksperimentima. Antigeni Dombrock sistema krvnih grupa su locirani na genskom produktu koji je glikozilfosfatidilinositol-petlja za eritrocitnu membranu. Poznate su alelne variante, od kojih neke izazivaju ransfuzijske reakcijere.[6]

Antigeni

uredi

U ovoj porodici gena prepoznato je nekoliko onih koji, prema novijoj nomenklaturi, kodiraju antigene: DO*A, DO*JO1, DO*A-WL, DO*DOYA, DO*B, DO*B-WL, DO*B-SH-Q149K, DO*B-(WL)-I175N, DO*HY1, DO*HY2 i DO*DOMR.

Većina njih ima svoje analoge i u pojednostavljenoj klasifikaciji (idi ispod).

Mišji mutant Art4
Simbol markera za mišji gen, kojise označava genomski.m lokusom.MGI Art4
Mišji mutant kloniranih embrijskih matičnih ćelija. To su poznate ciljane mutacije za ovaj gen miša. Art4tm1aWTSI(KOMP)
Primjer strukture ciljanog mogućeg mutantnog alela za ovaj gen (ispod)
Ove mutantne ES ćelije mogu se proučavati i direktno ili preko genetički generiranih miševa s knockout genom. Studije ovih miševa mogu osvijetliti funkciju Art4:

Dombrock sistem antigena je klasifikacija ljudske krvi na osnovu prisustva određenih glikoproteina, izvorno zvanih Do antigen. Nalaze se na površini crvenih krvnih zrnaca. Antitijela na antigen Dombrock (ustvarianti-Doa), otkrivena su 1965. godine kod pacijenta koji je primio transfuziju krvi. Antigen je imenovan po izvornom davatelju krvi. U 1973. identificiran je i Dombrock antigenDob, koji je označen slijedećim slovom (b) u abecedi. Ovaj sistem krvnih grupa je proširen 1990-ih, kada su uključena još tri nova antigena: Gya (Gregory antigen), Hy (Holley antigen), i Joa (Joseph antigen), koji se javljaju na istom proteinu kao prva dva Do antigena.

Dombrockantigeni su locirani na glikozilfosfatidilinozitolu (GPI)–petlji proteina koji je kodiran genom ART4 (ADP-riboziltransferaza 4). GPI je ugrađen u membranama ćelija koje ispoljavaju Dombrock fenotip, čime omogućava ostatku koji sadrži antigen da ostane izložen na vanjskoj površini ćelije. Genetički varijacije u ART4, koje rezultiraju izmjenjenom aminokiselinske sekvence kodiranih proteina, koji dovode do pojave različitih Dombrock antigena. Doa antigen sadrži sekvencu aminokiselina poznatu kao arginin-glicin-asparaginska kiselina (RGD) motiv, za kojeg se zna da ima ulogu u međućelijskim reakcijama.

Istraživanja su pokazala da je oko 65% sjevernih Evropljana nose Doa antigen i da Dob antigen ima povećanu učestalost u afričkim i azijskim populacijama. Procjenjuje se da se u svim proučavanim populacijama Gya, Hy i Joa antigeni javljaju u više od 99% osoba. Pored ispoljavanja na eritrocitima Doa antigen se nalazi i na limfocitima i limfnih čvorovima, u koštanoj srži, u tkivu slezine, jajnicima, testisima, crijevu, i srcu fetusa. Izražajnost Dombrock antigena je najveća u fetalnoj jetri. U vrlo rijetkim slučajevima, nijedan od pet Dombrock antigena sa ne ispoljava na crvenim krvnim zrnacima, što je rezultiralo pojavom Dombrock-nula fenotip.

Antitijela na antigene Dombrock su povezani s teškim transfuzijskom reakcijom, Pored toga, odsustvo Dombrock antigena može javiti kao rezultat gubitka GPI-vezanih proteina na površini crvenih krvnih zrnaca. Gubitak tih proteina u osnovi je rijetka bolest, poznata kao paroksizmalna noćna hemoglobinurija, u kojoj crvena krvna zrnaca prerabudu prerano destruirana djelovanjem imunih ćelija.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000111339 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030217 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Koch-Nolte F., Haag F., Braren R., Kuhl M., Hoovers J., Balasubramanian S., Bazan F,, Thiele H. G. (1997): Two novel human members of an emerging mammalian gene family related to mono-ADP-ribosylating bacterial toxins. Genomics, 39 (3): 370–376.
  6. ^ a b "Entrez Gene: ART4 ADP-ribosyltransferase 4 (Dombrock blood group)".

Također pogledajte

uredi