Deletirani protein limfocitne leukemije 1 (nekodirani protein), znan i kao DLEU – u molekulskoj biologiji – je duga nekodirajuća RNK. Odgovarajući gen kod ljudi nalazi se na hromosomu 13, sekvenca q14. Gen DLEU1 je izvorno identificiran kao potencijalni tumor supresorski gen i često se deletira kod pacijenata sa hroničnom limfocitnom leukemojom B-ćelija.[3] Kasnije je otkriveno da je to dugolančana nekodirajuća RNK sa preko 20 različitih varijanti prerade.[4]

DLEU1
Identifikatori
AliasiDLEU1
Vanjski ID-jeviOMIM: 605765 GeneCards: DLEU1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 13 (čovjek)
Hrom.Hromosom 13 (čovjek)[1]
Hromosom 13 (čovjek)
Genomska lokacija za DLEU1
Genomska lokacija za DLEU1
Bend13q14.2-q14.3Početak50,082,169 bp[1]
Kraj50,906,856 bp[1]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005887

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 13: 50.08 – 50.91 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Kloniranje i ekspresija uredi

Gubitak (delecija) hromosomskog segmenta 13q14 česta je citogenetička promjena u hroničnoj limfocitnoj leukemiji B-ćelija (BCLL), što ukazuje na prisutnost navodnog gena za supresiju tumora na ovom mjestu. Izgradnjom detaljne restrikcije i transkripcijske karte minimalno deletirane regije od 130 kb, skriningom panela primarnih klonova BCLL, pretraživanjem baze podataka EST i mapiranjem delecije, Liu et al. (1997) identificirali su dva gena, DLEU1 i DLEU2, koje su nazvali Leu1 i Leu2, u minimalno deletiranom području od 10 kb. Gen DLEU1 kodira izvedeni protein od 72 aminokiseline. Northern blot analiza otkrila je ekspresiju transkripta od 1,1 kb, sa snažnom ekspresijom u sjemenicima, timusu i tankom crijevu i nižom ekspresijom u prostati, slezeni, limfocitima periferne krvi i jajnicima.[5]

Wolf et al. (2001) utvrdili su da je DLEU1 samo mali dio velikog gena, koji su označili genom povezanim s B-ćelijskom neoplazijom s višestrukim preradama (BCMS), koji obuhvata sve kritične podregije za BCLL, uključujući distalnu. Otkrili su da se gen eksprimira u više od 20 alternativno prerađenih varijanti RNK. Iako je opažena specifična ekspresija varijanti RNK, nije bilo dokaza za ekspresiju varijante specifične za BCLL. Analiza sekvence varijanti RNK pokazala je da BCMS transkripti pripadaju grupi nekodirajućih RNK.[6]

Struktura gena uredi

Liu et al (1997) utvrdili su da gen DLEU1 nema TATA-kutiju, ali ima nekoliko potencijalnih cis-djelujućih elemenata DNK. Analizom genomskih sekvenci utvrđeno je da su DLEU1 i DLEU2 udaljeni približno 300 bp, raspoređeni na način "lice-u-glavu" i transkribirani u suprotnim smjerovima. Analiza mutacije nije uspjela otkriti bilo kakve intragene ili tačkaste mutacije, ali je prvi egzon svakog gena bio deletiran u svim ispitivanim slučajevima gubitka 13q14. Predložili su da su DLEU1 i DLEU2 geni kandidati za supresiju tumora u BCLL.<ref name =

Wolf et al (2001) utvrdili su da BCMS gen sadrži najmanje 50 egzona koji obuhvataju 560 kb ili više genomske DNK. Poravnavanje gena sa svim kritičnim podregijama za BCLL bilo je u skladu s BCMS -om koji je najvjerojatniji kandidat za gen supresor tumora u sekvenci 13q14, uključenoj u leukemogenezu BCLL-a.

Također pogledajte uredi

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000176124 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ Liu Y, Corcoran M, Rasool O, Ivanova G, Ibbotson R, Grandér D, Iyengar A, Baranova A, Kashuba V, Merup M, Wu X, Gardiner A, Mullenbach R, Poltaraus A, Hultström AL, Juliusson G, Chapman R, Tiller M, Cotter F, Gahrton G, Yankovsky N, Zabarovsky E, Einhorn S, Oscier D (Nov 1997). "Cloning of two candidate tumor suppressor genes within a 10 kb region on chromosome 13q14, frequently deleted in chronic lymphocytic leukemia". Oncogene. 15 (20): 2463–2473. doi:10.1038/sj.onc.1201643. PMID 9395242. S2CID 21133945.
  4. ^ Wolf S, Mertens D, Schaffner C, Korz C, Döhner H, Stilgenbauer S, Lichter P (Jun 2001). "B-cell neoplasia associated gene with multiple splicing (BCMS): the candidate B-CLL gene on 13q14 comprises more than 560 kb covering all critical regions". Human Molecular Genetics. 10 (12): 1275–1285. doi:10.1093/hmg/10.12.1275. PMID 11406609.
  5. ^ Liu, Y., Corcoran, M., Rasool, O., Ivanova, G., Ibbotson, R., Grander, D., Iyengar, A., Baranova, A., Kashuba, V., Merup, M., Wu, X., Gardiner, A., and 12 others. Cloning of two candidate tumor suppressor genes within a 10 kb region on chromosome 13q14, frequently deleted in chronic lymphocytic leukemia. Oncogene 15: 2463-2473, 1997. PubMed: 9395242
  6. ^ Wolf, S., Mertens, D., Schaffner, C., Korz, C., Dohner, H., Stilgenbauer, S., Lichter, P. B-cell neoplasia associated gene with multiple splicing (BCMS): the candidate B-CLL gene on 13q14 comprises more than 560 kb covering all critical regions. Hum. Molec. Genet. 10: 1275-1285, 2001. [[PubMed]: 11406609

Dopunska literatura uredi

  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (Sep 2005). "A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome". Cell. 122 (6): 957–968. doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl:11858/00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
  • Kapanadze B, Makeeva N, Corcoran M, Jareborg N, Hammarsund M, Baranova A, Zabarovsky E, Vorontsova O, Merup M, Gahrton G, Jansson M, Yankovsky N, Einhorn S, Oscier D, Grandér D, Sangfelt O (Dec 2000). "Comparative sequence analysis of a region on human chromosome 13q14, frequently deleted in B-cell chronic lymphocytic leukemia, and its homologous region on mouse chromosome 14". Genomics. 70 (3): 327–334. doi:10.1006/geno.2000.6386. PMID 11161783.
  • Mertens D, Philippen A, Ruppel M, Allegra D, Bhattacharya N, Tschuch C, Wolf S, Idler I, Zenz T, Stilgenbauer S (Mar 2009). "Chronic lymphocytic leukemia and 13q14: miRs and more". Leukemia & Lymphoma. 50 (3): 502–505. doi:10.1080/10428190902763509. PMID 19347735. S2CID 9204581.
  • Polasek O, Marusić A, Rotim K, Hayward C, Vitart V, Huffman J, Campbell S, Janković S, Boban M, Biloglav Z, Kolcić I, Krzelj V, Terzić J, Matec L, Tometić G, Nonković D, Nincević J, Pehlić M, Zedelj J, Velagić V, Juricić D, Kirac I, Belak Kovacević S, Wright AF, Campbell H, Rudan I (Feb 2009). "Genome-wide association study of anthropometric traits in Korcula Island, Croatia". Croatian Medical Journal. 50 (1): 7–16. doi:10.3325/cmj.2009.50.7. PMC 2657571. PMID 19260139.

Vanjski linkovi uredi