Razlika između verzija stranice "Thermus aquaticus"

'''''Thermus aquaticus''''' je vrsta [[bakterija]] koje podnose visoke [[Temperatura|temperature]] i jedna je od nekoliko termofilnih bakterija iz grupe [[Deinococcus–Thermus]]. Ona je izvor toplotno-otpornog [[enzim]]a [[Taq polimeraza|''Taq'' DNK polimeraze]], jednog od najznačajnijih enzima u [[molekularna biologija|molekularnoj biologiji]]. To je zato što je ključna u [[polimerazna lančana reakcija|polimeraznoj lančanoj reakciji]] (PCR) – tehnici umnožavanjeumnožavanja sekvenci [[DNK]].<ref>Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, {{ISBN|9958-9344-1-8}}.</ref><ref>Kapur Pojskić L., Ed. (2014): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, 2. izdanje. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, {{ISBN|978-9958-9344-8-3}}.</ref>

''Thermus aquaticus'' uspijeva na 70 [[°C]], ali može preživjeti i na temperaturama od 50&nbsp;°C do 80&nbsp;°C. Ova bakterija je [[hemotrof]], jer za dobijanje hrane obavlja [[hemosinteza|hemosintezu]]. Međutim, s obzirom da se njen asortiman temperatura preklapa sa rasponom [[fotosinteza|fotosintetskih]] [[cijanobakterija]], koje s njima dijele to idealno okruženje, ponekad dolazi do toga da žive zajedno dobijajući energiju za rast od [[Fotosinteza|fotosinteze]].<ref>http://bioinfo.bact.wisc.edu/themicrobialworld/LAHT/b1.html Thomas Brock's essay "Life at High Temperatures"</ref><ref name="BrockFreeze1969">{{cite journal |author=Brock TD |author2=Freeze H |last-author-amp=yes |title=''Thermus aquaticus'', a Nonsporulating Extreme Thermophile |journal=J. Bact. |volume=98 |issue=1 |pages=289–97 |date=1969 |pmid=5781580 |pmc=249935}}</ref><ref name="Bryan-Scott">{{cite book |first=T. Scott |last=Bryan |date=2008 |title=Geysers of Yellowstone, The |edition=4th |publisher=University Press of Colorado |isbn=978-0-87081-924-7}}</ref>

''Thermus aquaticus'' je općenito cilindričnog oblika, s promjerom od 0.5 μm do 0,8 μm. Kraći oblik štapićaštapić ima dužinu od 5 μm do 10 μm.

Duži oblik štapićaštapić ima dužinu koja se uvelikeuveliko razlikuje, a u nekim slučajevima prelazi 200&nbsp;µm.

Udruživanje nekoliko štapića može dovesti do stvaranja sfernih tijela u promjeropromjeru od 10 μm do 20 μm, koja se nazivaju obla tijela.

''T. aquaticus'' je bakterija koja je postala poznata kao izvor termostabilnih enzima, posebno ''Taq'' [[DNK polimeraza|DNK polimeraze]].

Većina molekularnih biologa je vjerovatno postala svjesna postojanja bakterije ''Thermus aquaticus'' tokom kasnih 1970-im ili početkom 1980-ih, zbog izolacije korisnih [[Restrikcijski enzim|endonukleaznih restriktaza]] iz ovog organizma. Upotreba izraza ''Taq'' koji se odnosi na ''Thermus aquaticus'' pojavila se u Konvenciji davanja kratkih imena restrikcijskim enzimima, kao što su Sal i Hin, izvedeni iz [[Rod (biologija)|rod]]a i [[Vrsta (biologija)|vrste]] izvornog organizma.<ref>{{cite journal |date=februar 1978 |first=S |last=Sato |title=A single cleavage of Simian virus 40 (SV40) DNA by a site specific endonuclease from Thermus aquaticus, ''Taq'' I |journal=J. Biochem. (Tokyo) |volume=83 |issue=2 |pages=633–5 |pmid=204628}}</ref>

:DNK polymeraza je i ''Thermus aquaticus'', a izdvojena je [[1976]].<ref>{{cite journal |title=Deoxyribonucleic acid polymerase from the extreme thermophile Thermus aquaticus |first=A |last=Chien |author2=Edgar DB |author3=Trela JM |journal=J. Bact. |volume=127 |issue=3 |pages=1550–7 |pmid=8432 |date=1. 9. 1976 |pmc=232952}}</ref> Prvi napredak u ovom pravcu je bilo utvrđivanje termostabilnosti (optimum 80°C) DNK polimeraze, koja je izdvojena u čistom obliku (slobodnu od ostalih enzimskih kontaminanata) kada je DNK polimeraza dobijena iz ostalih izvora. Kasnije su [[Kary Mullis]] i drugi istraživači iz ''Cetus korporacije'' otkrili da bi se mogla upotrijebitri [[PCR|polimeraznoj lančanoj reakciji]] (PCR) – procesu za umnožavanje kratkih segmenata [[DNK]],<ref>{{cite journal |last1=Saiki |first1=RK |displayauthors=etal |url=http://sunsite.berkeley.edu/cgi-bin/ebind2html/pcr/009 |title=Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase |journal=[[Science (journal)|Science]] |year=1988 |volume=239 |pages=487–91 |doi=10.1126/science.2448875 |pmid=2448875 |issue=4839 |date= |access-date=14. 4. 2016 |archive-url=https://web.archive.org/web/20081219151650/http://sunsite.berkeley.edu/cgi-bin/ebind2html/pcr/009 |archive-date=19. 12. 2008 |url-status=dead }}</ref> uklanjajući potrebu za dodavanje enzima nakon svakog ciklusa termo-denaturacuje DNK. Enzim je također i [[Molekularno kloniranje|molekularno kloniran]], [[senciranje DNK|DNK sekvenciran]], izmijenjen (do kraćeg 'Stoffelovog fragmenta') i proizveden u velikim količinama za komercijalnu upotrebu.<ref name="Lawyer et al.">{{cite journal |author=Lawyer FC |last2=Stoffel |first2=S |last3=Saiki |first3=RK |last4=Chang |first4=SY |last5=Landre |first5=PA |last6=Abramson |first6=RD |last7=Gelfand |first7=DH |displayauthors=1 |year=1993 |title=High-level expression, purification, and enzymatic characterization of full-length Thermus aquaticus DNA polymerase. |journal=PCR Methods Appl. |volume=2 |pages=275–87 |pmid=8324500 |issue=4 |doi=10.1101/gr.2.4.275}}</ref> Godine [[1989]]., elitni časopis ''[[Science (časopis)|Science]]'' je ''Taq polimerazu'' imenovao svojom '''molekulom godine''' ("Molecule of the Year").<ref>{{cite journal |author=Guyer RL |author2=Koshland DE |title=The Molecule of the Year |journal=Science |volume=246 |issue=4937 |pages=1543–6 |date=decembar 1989 |pmid=2688087 |url=http://www.sciencemag.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=2688087 |doi=10.1126/science.2688087}}</ref> a [[1993]]., [[Kary Mullis]]<ref>http://www.nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/1993/mullis-lecture.html</ref> Naučnicije naučnik koji suju je otkriliotkrio, dobilii sudobio je [[Nobelova nagrada za hemiju|Nobelovu nagradu za hemiju]] za rad istraživanju [[PCR]].