Razlika između verzija stranice "Krebsov ciklus"

[pregledana izmjena][pregledana izmjena]
Uklonjeni sadržaj Dodani sadržaj
No edit summary
m ISBN magic link > {{ISBN}}; razne ispravke
Red 4:
Ciklus limunske kiseline je [[anfibolički]] metabolički put, jer sudjeluje i u degradaciji organskih [[molekula]] ([[katabolizam]]) i u njihovoj biosintezi ([[anabolizam]]). Najvažniji metabolički putevi koji se vežu na Krebsov ciklus su prethodna [[glikoliza]] i [[oksidativna dekarboksilacija piruvata]] i naredna [[oksidativna fosforilacija]]. Krebsov ciklus je važan i kao izvorni oblik pri nastanku [[aminokiselina]] (acetil CoA, α-ketoglutarat, sukcinil CoA, sukcinat, fumarat, oksalacetat).
 
Ciklus nosi ime po [[Hans Adolf Krebs|Hansu Adolfu Krebsu]], britanskom biologu njemačkog porijekla koji je otkrio ključne elemente procesa limunske kiseline i za to dobio [[Nobelova nagrada|Nobelovu nagradu za medicinu]] [[1953]].<ref name="Hall J. E. 2006">Hall J. E., Guyton A. C. (2006): Textbook of medical physiology, 11th edition. Elsevier Saunders, St. Louis, Mo, {{ISBN |0-7216-0240-1}}.</ref><ref name="Međedović S. 2000">Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, {{ISBN |9958-10-222-6}}.</ref><ref>Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, {{ISBN |9958-9344-1-8}}.</ref><ref>Kornberg A. (1989): For the love of enzymes – The Odyssay of a biochemist. Harvard University Press, Cambridge (Mass.), London,{{ISBN |0-674-30775-5}}, {{ISBN |0-674-30776-3}}.</ref><ref>Hunter G. K. (2000): Vital Forces. The discovery of the molecular basis of life. Academic Press, London 2000, {{ISBN |0-12-361811-8}}.</ref>
 
== Osnovne reakcije ==
Krebsov ciklus se odvija u [[mitohondrija]]ma [[eukarioti|eukariotskih]] i [[citoplazma|citoplazmi]] [[prokarioti|prokariotskih]] ćelija.
Katabolizam ugljikohidrata i masti stvara [[acetil-CoA]] – molekulu sastavljenu od jedne acetilne grupe koja je vezana na [[koenzim A]]. Acetil-CoA je osnovni [[Supstrat (biohemija)|supstrat]] Krebsovog ciklusa. Dvije molekule acetil-CoA oslobađaju svoje acetilne grupe, koje se spajaju s [[oksalacetat]]om i tvore [[limunska kiselina|limunsku kiselinu]]. Ona prolazi kroz niz metaboličkih procesa, oslobađajući dvije molekule [[Ugljikov (IV) oksid|ugljendioksida]] (CO<sub>2</sub>) i ponovo se obnavlja u [[oksalacetat]] koji je spreman za naredni ciklus. U bioenergetici tog procesa, najbitnije su reakcije stvaranja molekule [[guanozin trifosfat]]a (GTP), koja odmah obnavlja jednu molekulu [[Adenozinadenozin-trifosfat|adenozin-trifosfata]]a ([[ATP]]) i nastanak tri molekule [[nikotinamid adenin dinukleotid]]a (NADH) i jedne [[flavin adenin dinukleotid]]a (FADH<sub>2</sub>). Ključne [[Hemijska reakcija|hemijske reakcije]] i uključeni [[enzim]]i u Krebsovom ciklusu, kao i njihovi glavni proizvodi prikazani su u tabeli koja slijedi.<ref>Barnes S. J., Weitzman P. D. (1986): Organization of citric acid cycle enzymes into a multienzyme cluster. FEBS Lett., 201 (2): 267–270.</ref>
 
Reducirani kofaktori NADH i FADH<sub>2</sub> su prijelazne molekule u procesima [[Redoks reakcija|oksidacije]] i redukcije. U reduciranom obliku prenose [[elektron]]e sa oksidiranih molekula iz samog Krebsovog ciklusa i [[glikoliza|glikolize]] na molekule prve faze [[oksidativna fosforilacija|oksidativne fosforilacije]], tzv. [[#Lanac prijenosa elektrona kod eukariota|lanca prijenosa elektrona]]. Tada se oksidiraju u NAD<sup>+</sup> i FAD i daju elektrone, koji će se, tokom oksidacijske [[fosforilacija|fosforilacije]], iskoristiti za obnavljanje [[ATP]] iz [[Adenozinadenozin-difosfat|adenozin-difosfata]]a (ADP).<ref>Berg J. M., Tymoczko J. L., Stryer L. (2002): Biochemistry, 5th edition. W. H. Freeman and Company, {{ISBN |978-0-7167-4684-3}}.</ref> –
 
Konačna [[Stehiometrija|stehiometrijska]] formula svih reakcija je kako slijedi:
Red 75:
[[Datoteka:Citrate Sinthase (rec).jpg|thumb|Svaka podjedinica citrat sintetaze veže jednu molekulu oksalacetata (ljubičasto) i jednu acetil-CoA (sivo).]]
=== Reakcija 1: Citrat sintetaza ===
[[Datoteka:Krebs_cycle_1_OxAc_and_AcCoA_to_citrate.svg|mini|300px|Citratna reakcija oksalacetat-AcCoA: ''ΔG'°=-31.4 kJ/mol'']]
[[Datoteka:Aconitase (rec).jpg|mini|Struktura akonitaze]]
Prvi enzim u Krebsovom ciklusu, [[citrat sintetaza]] – [[katalizator|katalizira]] reakciju kondenzacije [[acetil-CoA]] s [[oksalacetat]]om iz kojeg nastaje [[citrati|citrat]] ([[limunska kiselina]]). [[Enzim]] ima dvije strukturne podjedinice, od kojih je svaka sposobna vezati oba [[Supstrat (biohemija)|supstrata]] za svoje [[aktivno mjesto]].<ref name="Hall J. E. 2006"/><ref name="Međedović S. 2000"/><ref>Nelson D. L., Cox M. M. (2013): Lehninger Principles of Biochemistry. W. H. Freeman and Co., {{ISBN |978-1-4641-0962-1.</ref><ref>Hall J. E., Guyton A. C. (2006): Textbook of medical physiology, 11th edition. Elsevier Saunders, St. Louis, Mo, ISBN 0-7216-0240-1}}.</ref><ref>Kapur Pojskić L., Ed. (2014): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, 2. izdanje. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, {{ISBN |978-9958-9344-8-3.</ref><ref>Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-222-6}}.</ref>
 
Ovaj enzim katalizira aktivaciju acetil-CoA, kako bi se povećala sklonost prema oksalacetatu. Nakon vezanja acetilne skupine za oksalacetat, [[tioester]]na se grupa (CoA) odvaja [[hidroliza|hidrolizom]] i oslobađa se [[limunska kiselina]].
Red 121:
'''Jednadžba reakcije:''' sukcinat-CоА + Pi + GDP → sukcinat + GTP + CоА-SH
 
GTP kao molekulu visoke energije (GTP ima ulogu signalne molekule), organizam ne koristi direktno. U Krebsovom ciklusu da posluži kao međuspoj koji prebacuje fosfatnu grupu na [[adenozin difosfat|ADP]] kako bi se stvorio [[adenozin trifosfat|ATP]]. Tu reakciju katalizira enzim [[nukleozid difosfokinaza]].
 
U završnim fazama Krebsovog ciklusa dolazi do preraspodjele molekula s četiri atoma ugljika do ponovne obnavljanja oksalacetata. Da bi to bilo moguće, [[metilna grupa]] na sukcinatu mora proći pretvaranje u [[karbonilna grupa|karbonilnu grupu]], koja se odvija u tri prijelazna koraka: prva [[oksidacija]], [[hidracija]], pa druga [[oksidacija]]. Osim što obnavljaju oksalacetat, ovi prijelazi omogućavaju izvlačenje dodatne hemijske energije preko flavin adenin [[dinukleotid|FADH<sub>2</sub>]] i [[nikotinamid adenin dinukleotid|NADH]].
Red 184:
** Degradacija [[valin]]a i [[izoleucin]]a
** Metabolizam [[fenilalanin]]a
 
* '''α-ketoglutarat:'''
** Biosinteza [[lizin]]a
** Metabolizam [[vitamin C|askorbinske kiseline]]
** Metabolizam [[glutamat]]a
 
* '''Sukcinil CoA:'''
** Metabolizam propanoata
Line 195 ⟶ 193:
** Degradacija [[leucin]]a i [[izoleucin]]a
** Metabolizam [[fenilalanin]]a
 
* '''Sukcinat:'''
** Metabolizam butanoata
** Metabolizam [[tirozin]]a
 
* '''Fumarat:'''
** [[Ciklus ureje]]
** Metabolizam [[arginin]]a i [[prolin]]a
** Metabolizam tirozina
 
* '''Oksalacetat:'''
** [[Glukoneogeneza]]
Line 231 ⟶ 226:
*[http://www.pitt.edu/AFShome/j/b/jbrodsky/public/html/1820/tca.htm A citric-acid cycle self quiz flash applet] at University of Pittsburgh
* [https://web.archive.org/web/20060213194815/http://www2.ufp.pt/~pedros/bq/tca.htm The chemical logic behind the citric acid cycle]
 
 
{{Commonscat|Citric acid cycle}}