Ctoplazmatski 4-liki poly(A) vezujući protein jest protein koji je kod ljudi kodiran genom PABPC4L sa hromosoma 4.[5]

PABPC4L
Identifikatori
AliasiPABPC4L
Vanjski ID-jeviMGI: 3643087 HomoloGene: 66336 GeneCards: PABPC4L
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 4 (čovjek)
Hrom.Hromosom 4 (čovjek)[1]
Hromosom 4 (čovjek)
Genomska lokacija za PABPC4L
Genomska lokacija za PABPC4L
Bend4q28.3Početak134,196,333 bp[1]
Kraj134,201,789 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 3 (miš)
Hrom.Hromosom 3 (miš)[2]
Hromosom 3 (miš)
Genomska lokacija za PABPC4L
Genomska lokacija za PABPC4L
Bend3|3 BPočetak46,396,632 bp[2]
Kraj46,402,654 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001114734
NM_001363585

NM_001101479

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 4: 134.2 – 134.2 MbChr 3: 46.4 – 46.4 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

U jenom od radova iz 2019., saopćava se da atipski parkinsonizamski poremećaji (APD) čine grupu neurodegenerativnih bolesti sa heterogenim kliničkim i patološkim karakteristikama. Većina APD-a je sporadična, ali su prijavljeni i rijetki porodični oblici. Epidemiološke i postmortem studije povezivale su APD sa oksidativnim stresom i ćelijskim proteinskim agregatima. Identificiranje molekulnih mehanizama koji stres pretvaraju u agregaciju toksičnih proteina i neurodegeneraciju u APD je aktivno područje istraživanja. Također se kaže da se nedavno se raspravljalo o putevima stresnih granula (SG) ribonukleinske kiseline (RNK) da su patogeni relevantni za nekoliko neurodegenerativnih poremećaja, uključujući APD.

Koristeći sekvenciranje cijelog genoma, analizu ekspresije iRNK, testove transfekcije i snimanje ćelija, istražili su genetičku i molekulsku osnovu porodičnog neurodegenerativnog atipskog parkinsonovskog poremećaja. Istraživali su porodicu sa šest živih članova u dvije generacije koji su ispoljili kliničke simptome u skladu s atipskim parkinsonizmom. Dva pogođena člana porodice patila su od parkinsonizma koji je bio povezan sa ataksijom. Magnetna rezonanca (MRI) ovih pacijenata pokazala je atrofiju moždanog stabla i malog mozga. Sekvenciranjem cijelog genoma identificirana je heterozigotna stop-gain varijanta u poli(A) vezujućem proteinu, citoplazmatskom 4-sličnom (PABPC4L) genu, koji se kosegregirao sa bolešću u porodici. Flurescentna in situ hibridizacija pokazala je da je mišji pabpc4l eksprimiran u nekoliko regija mozga, a posebno u malom mozgu i moždanom stablu. Da bismo odredili funkcionalni uticaj stop-gain varijante u genu PABPC4L, istražili smo subćelijsku lokalizaciju PABPC4L u heterolognim ćelijama. PABPC4L protein divljeg tipa lokaliziran pretežno na ćelijskom jedru, za razliku od skraćenog proteina kodiranog stop-gain varijantom p.R271X, koji je pronađen homogeno u cijeloj ćeliji. Zanimljivo je da je divlji tip, ali ne i skraćeni protein lokaliziran na citoplazmatske granule obilježene RasGAP SH3 domenom (G3BP), kao odgovor na indukciju oksidativnog stresa. Ovo sugerira da varijanta PABPC4L mijenja unutarćelijsku distribuciju i možda funkciju proteina povezanu sa granulama stresa, što može biti u osnovi APD-a u ovoj porodici.

U zaključku, predstavljeni su genetički i molekulski dokazi koji podržavaju ulogu stop-gain PABPC4L varijante u rijetkom porodičnom APD-u. Dobijeni podaci pokazuju da ta varijanta dovodi do njene pogrešne ćelijske lokacije i nesposobnosti proteina da se poveže sa granulama stresa.[6]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000254535 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000090919 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Poly(A) binding protein, cytoplasmic 4-like". Pristupljeno 10. 10. 2013.
  6. ^ Muhammad Aslam, Anwar Ullah, Nagarajan Paramasivam, Nirosiya Kandasamy, Saima Naureen, Mazhar Badshah, Kafaitullah Khan, Muhammad Wajid, Rashda Abbasi, Roland Eils, Marc A Brockmann, Matthias Schlesner, Nafees Ahmad, Jakob von Engelhardt (2019) Segregation and potential functional impact of a rare stop-gain PABPC4L variant in familial atypical Parkinsonism. Sci Rep, 9 (1):13576; pmid: 31537871; pmcid: pmc6753086; doi: 10.1038/s41598-019-50102-6.