OTUD5

OTU-deubikvitinaza 5 je enzimski protein koji je kod ljudi kodiran genom OTUD5.

OTUD5
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 3PFY, 3TMO, 3TMP
Identifikatori
Aliasi	OTUD5
Vanjski ID-jevi	OMIM: 300713 MGI: 1859615 HomoloGene: 136483 GeneCards: OTUD5
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom X Bend Xp11.23 Početak 48,922,024 bp Kraj 48,958,386 bp
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom X (miš) Bend X A1.1|X 3.54 cM Početak 7,707,603 bp Kraj 7,742,865 bp
Ontologija gena Molekularna funkcija • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • Lys63-specific deubiquitinase activity • GO:1904265 deubiquitinase activity • Lys48-specific deubiquitinase activity Ćelijska komponenta • citosol Biološki proces • negative regulation of type I interferon production • response to lipopolysaccharide • protein K63-linked deubiquitination • protein K48-linked deubiquitination • Proteoliza • protein deubiquitination Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	55593	54644
Ensembl	ENSG00000068308	ENSMUSG00000031154
UniProt	Q96G74	Q3U2S4
RefSeq (mRNK)	NM_001136157 NM_001136158 NM_001136159 NM_017602	NM_001290536 NM_001290537 NM_138604
RefSeq (bjelančevina)	NP_001129629 NP_001129630 NP_001129631 NP_060072	NP_001277465 NP_001277466 NP_613070
Lokacija (UCSC)	Chr X: 48.92 – 48.96 Mb	Chr X: 7.71 – 7.74 Mb
PubMed pretraga
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Funkcija

Ovaj gen kodira člana natporodice cisteinskih proteaze, koje sadrži domen OTU (tumor jajnika). OTU-domen imaa aktivnost deubikvitinaze, a pokazalo se da kodirani protein potiskuje urođeni imunski interferon-ovisni odgovor tipa I, cijepanjem lanca poliubikvitina od esencijalnog proteinskog adaptera interferona tipa I. Cijepanje rezultira razdvajanjem adapterskog proteina iz nizvodnog signalnog kompleksa i poremećajem signalne interferonske kaskade tipa I. Opisane su alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.

Dopunska literatura

• Kayagaki N, Phung Q, Chan S, Chaudhari R, Quan C, O'Rourke KM, Eby M, Pietras E, Cheng G, Bazan JF, Zhang Z, Arnott D, Dixit VM (2007). "DUBA: a deubiquitinase that regulates type I interferon production". Science. 318 (5856): 1628–32. doi:10.1126/science.1145918. PMID 17991829.
• Huang OW, Ma X, Yin J, Flinders J, Maurer T, Kayagaki N, Phung Q, Bosanac I, Arnott D, Dixit VM, Hymowitz SG, Starovasnik MA, Cochran AG (2012). "Phosphorylation-dependent activity of the deubiquitinase DUBA". Nat. Struct. Mol. Biol. 19 (2): 171–5. doi:10.1038/nsmb.2206. PMID 22245969.
• Luo J, Lu Z, Lu X, Chen L, Cao J, Zhang S, Ling Y, Zhou X (2013). "OTUD5 regulates p53 stability by deubiquitinating p53". PLoS ONE. 8 (10): e77682. doi:10.1371/journal.pone.0077682. PMC 3797110. PMID 24143256.

Vanjski linkovi

• Q96G74