OTUD5

(Preusmjereno sa MCAND)

OTU-deubikvitinaza 5 je enzimski protein koji je kod ljudi kodiran genom OTUD5. [5]

OTUD5
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3PFY, 3TMO, 3TMP

Identifikatori
AliasiOTUD5
Vanjski ID-jeviOMIM: 300713 MGI: 1859615 HomoloGene: 136483 GeneCards: OTUD5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom X
Hrom.Hromosom X[1]
Hromosom X
Genomska lokacija za OTUD5
Genomska lokacija za OTUD5
BendXp11.23Početak48,922,024 bp[1]
Kraj48,958,386 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom X (miš)
Hrom.Hromosom X (miš)[2]
Hromosom X (miš)
Genomska lokacija za OTUD5
Genomska lokacija za OTUD5
BendX A1.1|X 3.54 cMPočetak7,707,603 bp[2]
Kraj7,742,865 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija thiol-dependent deubiquitinase
GO:0070122 peptidase activity
cysteine-type peptidase activity
hydrolase activity
Lys63-specific deubiquitinase activity
GO:1904265 deubiquitinase activity
Lys48-specific deubiquitinase activity
Ćelijska komponenta citosol
Biološki proces negative regulation of type I interferon production
response to lipopolysaccharide
protein K63-linked deubiquitination
protein K48-linked deubiquitination
Proteoliza
protein deubiquitination
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001136157
NM_001136158
NM_001136159
NM_017602

NM_001290536
NM_001290537
NM_138604

RefSeq (bjelančevina)

NP_001129629
NP_001129630
NP_001129631
NP_060072

NP_001277465
NP_001277466
NP_613070

Lokacija (UCSC)Chr X: 48.92 – 48.96 MbChr X: 7.71 – 7.74 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira člana natporodice cisteinskih proteaze, koje sadrži domen OTU (tumor jajnika). OTU-domen imaa aktivnost deubikvitinaze, a pokazalo se da kodirani protein potiskuje urođeni imunski interferon-ovisni odgovor tipa I, cijepanjem lanca poliubikvitina od esencijalnog proteinskog adaptera interferona tipa I. Cijepanje rezultira razdvajanjem adapterskog proteina iz nizvodnog signalnog kompleksa i poremećajem signalne interferonske kaskade tipa I. Opisane su alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000068308 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031154 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: OTU deubiquitinase 5". Pristupljeno 25. 3. 2017.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi