Inhibitor apoptoznog domena

Inhibitor apoptoznog domena, također poznat kao IAP ponavljanje, Bakulovirus Iinhibitor ponavljanja (R) proteina apoptoze, ili BIR -- je strukturni motiv koji se nalazi u proteinima sa ulogama u apoptozi, proizvodnji citokina i segregaciji hromosoma.[2] Proteini koji sadrže BIR poznati su kao proteini inhibitori poptote (IAP) ili proteini koji sadrže BIR (BIRP ili BIRC), a uključuju BIRC1 (NAIP), BIRC2 (cIAP1), BIRC3 (cIAP2), BIRC4 (xIAP), BIRC5 (survivin) i BIRC6.[2][3]

Inhibitor apoptoznog domena
NMR struktura rastvora BIR domena ljudskog proteina BIRC2.[1] Protein je dijagram duginih boja (N-kraj = plava, C-kraj = crvena), dok je koordinirani cink predstavljen sivom sferom.
Identifikatori
SimbolBIR
PfamPF00653
InterProIPR001370
PROSITEPS50143
SCOP21qbh / SCOPe / SUPFAM
Dostupne proteinske strukture:
Pfam  strukture / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumsažetak strukture
PDB1c9q, 1e31, 1f3h, 1f9x, 1g3f, 1g73, 1i3o, 1jd4, 1jd5, 1jd6, 1m4m, 1nw9, 1oxn, 1oxq, 1oy7, 1q4q, 1qbh, 1sdz, 1se0, 1tfq, 1tft, 1tw6, 1xb0, 1xb1, 1xox, 2i3h, 2i3i

BIR domeni pripadaju porodici domena cinovog prsta i karakteristično imaju niz invarijantnih aminokiselinskih ostataka, uključujući tri konzervirana cisteina i jedan konzervirani histidin, koji koordiniraju cinkov ion.<.[4] Obično se sastoje od 4-5 alfa-heliksa i trolanaca beta-lista.

Reference

uredi
  1. ^ PDB 1QBH;Hinds MG, Norton RS, Vaux DL, Day CL (juli 1999). "Solution structure of a baculoviral inhibitor of apoptosis (IAP) repeat". Nat. Struct. Biol. ]]. 6 (7): 648–51. doi:10.1038/10701. PMID 10404221. S2CID 3194182.
  2. ^ a b Silke J, Vaux DL (maj 2001). "Two kinds of BIR-containing protein - inhibitors of apoptosis, or required for mitosis". J. Cell Sci. 114 (Pt 10): 1821–7. PMID 11329368.
  3. ^ Verhagen AM, Coulson EJ, Vaux DL (2001). "Inhibitor of apoptosis proteins and their relatives: IAPs and other BIRPs". Genome Biol. 2 (7): REVIEWS3009. doi:10.1186/gb-2001-2-7-reviews3009. PMC 139420. PMID 11516343.
  4. ^ Birnbaum MJ, Clem RJ, Miller LK (april 1994). "An apoptosis-inhibiting gene from a nuclear polyhedrosis virus encoding a polypeptide with Cys/His sequence motifs". J. Virol. 68 (4): 2521–8. doi:10.1128/JVI.68.4.2521-2528.1994. PMC 236730. PMID 8139034.

Vanjski linkovi

uredi

Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_II_1

Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_1

Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_2

Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_3

Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_4

Šablon:Proteinski domeni

Ovaj članak uključuje tekst iz javnog domena Pfam i InterPro: IPR001370