Inhibitor apoptoznog domena
Inhibitor apoptoznog domena, također poznat kao IAP ponavljanje, Bakulovirus Iinhibitor ponavljanja (R) proteina apoptoze, ili BIR -- je strukturni motiv koji se nalazi u proteinima sa ulogama u apoptozi, proizvodnji citokina i segregaciji hromosoma.[2] Proteini koji sadrže BIR poznati su kao proteini inhibitori poptote (IAP) ili proteini koji sadrže BIR (BIRP ili BIRC), a uključuju BIRC1 (NAIP), BIRC2 (cIAP1), BIRC3 (cIAP2), BIRC4 (xIAP), BIRC5 (survivin) i BIRC6.[2][3]
Inhibitor apoptoznog domena | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||
Simbol | BIR | ||||||||||
Pfam | PF00653 | ||||||||||
InterPro | IPR001370 | ||||||||||
PROSITE | PS50143 | ||||||||||
SCOP2 | 1qbh / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
|
BIR domeni pripadaju porodici domena cinovog prsta i karakteristično imaju niz invarijantnih aminokiselinskih ostataka, uključujući tri konzervirana cisteina i jedan konzervirani histidin, koji koordiniraju cinkov ion.<.[4] Obično se sastoje od 4-5 alfa-heliksa i trolanaca beta-lista.
Reference
uredi- ^ PDB 1QBH;Hinds MG, Norton RS, Vaux DL, Day CL (juli 1999). "Solution structure of a baculoviral inhibitor of apoptosis (IAP) repeat". Nat. Struct. Biol. ]]. 6 (7): 648–51. doi:10.1038/10701. PMID 10404221. S2CID 3194182.
- ^ a b Silke J, Vaux DL (maj 2001). "Two kinds of BIR-containing protein - inhibitors of apoptosis, or required for mitosis". J. Cell Sci. 114 (Pt 10): 1821–7. PMID 11329368.
- ^ Verhagen AM, Coulson EJ, Vaux DL (2001). "Inhibitor of apoptosis proteins and their relatives: IAPs and other BIRPs". Genome Biol. 2 (7): REVIEWS3009. doi:10.1186/gb-2001-2-7-reviews3009. PMC 139420. PMID 11516343.
- ^ Birnbaum MJ, Clem RJ, Miller LK (april 1994). "An apoptosis-inhibiting gene from a nuclear polyhedrosis virus encoding a polypeptide with Cys/His sequence motifs". J. Virol. 68 (4): 2521–8. doi:10.1128/JVI.68.4.2521-2528.1994. PMC 236730. PMID 8139034.
Vanjski linkovi
urediEukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_II_1
Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_1
Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_2
Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_3
Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_4