HNF1A antisensna RNK 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom HNF1A-AS1.[3]

HNF1A-AS1
Identifikatori
AliasiHNF1A-AS1
Vanjski ID-jeviGeneCards: HNF1A-AS1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za HNF1A-AS1
Genomska lokacija za HNF1A-AS1
Bend12q24.31Početak120,941,728 bp[1]
Kraj120,980,965 bp[1]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

n/a

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 12: 120.94 – 120.98 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Dugolančane nekodirajuće RNK (lncRNA) pojavile su se kao ključni regulatori razvoja i progresije tumora. LncRNA HNF1A-antisens 1 (HNF1A-AS1) je 2455-bp transkript gena na hromosomu 12 sa potencijalnom onkogenom ulogom u adenokarcinomu jednjaka. Ipak, razumijevanje uključenosti HNF1A-AS1 u tumorigenezu adenokarcinoma pluća ostaje ograničeno. U jednom istraživanju analizirana je uloga HNF1A-AS1 u 40 tkiva adenokarcinoma pluća i pet ćelijskih linija raka pluća. Rezultati su pokazali da je HNF1A-AS1 značajno povišeno reguliran u tkivima adenokarcinoma pluća u usporedbi s odgovarajućim ne-tumorskim tkivima, a njegova razina ekspresije značajno je povezana s stadijem TNM-a, veličinom tumora i metastazama u limfnim čvorovima. Kaplan-Meierov prikaz UCSC Cancer Genomics Browser preglednika sugerirao je da su pacijenti u podgrupi s visokom ekspresijom HNF1A-AS1 imali lošije ukupno preživljavanje u poređenju s podgrupom sa niskom ekspresijom. Osim toga, utvrđeno je da HNF1A-AS1 podstiče proliferaciju tumora i metastaze, i in vitro i in vivo, regulirajući ekspresiju ciklina D1, E-kadherina, N-kadherina i β-katenina. Osim toga, vezivanje HNF1A-AS1 za DNMT1 može objasniti njegovu regulaciju E-kadherina. U zaključku su pokazali da povećana ekspresija HNF1A-AS1 može regulirati ćelijsku proliferaciju i metastaze i identificirali je kao loš prognostički biomarker u adenokarcinomu pluća.[4]

U drugoj studiji konstatira se da su dugolančane nekodirajuće RNK (lncRNK) važni regulacijski faktori u razvoju i progresiji tumora. LncRNA CASC9.5 nalazi se na hromosomu 8 i ima ukupnu dužinu od 1316 bp. CASC9.5 ima ulogu promocije tumora u razvoju i progresiji tumora mozga i raka debelog crijeva. Međutim, ograničeno je istraživanje provedeno o ulozi ove lncRNK u adenokarcinomu pluća. Ova studija analizirala je 44 uzorka adenokarcinoma pluća i dvije ćelijske linije raka pluća. Utvrđeno je da su nivoi ekspresije CASC9.5 bili značajno veći u tkivima i ćelijama raka pluća u poređenju sa normalnim tkivima pluća. Osim toga, nivo ekspresije CASC9.5 bio je usko povezan sa stadijem TNM (tumor, čvorovi i metastaze) plućnih adenokarcinoma, veličinom tumora, tumorskim metastazama i metabolizmom tumora. Osim toga, rezultati eksperimenata in vivo i in vitro pokazali su da CASC9.5 podstiče proliferaciju i metabolizam ćelija adenokarcinoma pluća, reguliranjem razina ekspresije ciklina D1, E-kadherina, N-kadherina i β-katenina. Ukratko, ova studija pokazala je da visoki nivoi ekspresije CASC9.5 podstiču proliferaciju, metastaze i ćelijski metabolizam adenokarcinoma pluća i mogu poslužiti kao prognostički pokazatelj. Pruža i nove nalaze u vezi s dijagnosticiranjem i liječenjem adenokarcinoma pluća[5]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000241388 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Entrez Gene: HNF1A antisense RNA 1".
  4. ^ Ying Wu 1, Hongbing Liu 1, Xuefei Shi 1, Yanwen Yao 1, Wen Yang 1, Yong Song (2015) The long non-coding RNA HNF1A-AS1 regulates proliferation and metastasis in lung adenocarcinoma. Oncotarget 6(11):9160-72
  5. ^ Jianlong Zhou 1 2, Haiping Xiao 3, Xinglong Yang 1 2, Hao Tian 4, Zhiyong Xu 4, Yu Zhong 4, Limin Ma 4, Weimin Zhang 5, Guibin Qiao 6, Jing Liang 7(2018) Long noncoding RNA CASC9.5 promotes the proliferation and metastasis of lung adenocarcinoma. Sci Rep, 8(1):37

Dopunska literatura

uredi