BRAT1

BRAT1
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	4IFI
Identifikatori
Aliasi	BRAT1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 614506 MGI: 1891679 HomoloGene: 16776 GeneCards: BRAT1
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 7 (čovjek)
Kraj	2,555,694 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 5 (miš)
Kraj	140,705,134 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • membrana; • jedro; • nukleoplazma;
Biološki proces	• mitochondrion localization; • response to ionizing radiation; • Ćelijski rast; • positive regulation of protein phosphorylation; • Ćelijska proliferacija; • Ćelijska migracija; • glucose metabolic process; • cellular response to DNA damage stimulus; • GO:0097285 apoptoza; • positive regulation of cell growth;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	221927
	231841
	ENSG00000106009
	ENSMUSG00000000148
	Q6PJG6
	Q8C3R1
	NM_152743; NM_001350626; NM_001350627
	NM_001276287; NM_172724; NM_181066
	NP_689956; NP_001337555; NP_001337556
	NP_001263216; NP_851411
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

BRCA1-pridruženi ATM aktivator 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom BRAT1.^[5]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 821 aminokiselina, а molekulska težina 88.119 Da.^[6]

10	20	30	40	50
MDPECAQLLP	ALCAVLVDPR	QPVADDTCLE	KLLDWFKTVT	EGESSVVLLQ
EHPCLVELLS	HVLKVQDLSS	GVLSFSLRLA	GTFAAQENCF	QYLQQGELLP
GLFGEPGPLG	RATWAVPTVR	SGWIQGLRSL	AQHPSALRFL	ADHGAVDTIF
SLQGDSSLFV	ASAASQLLVH	VLALSMRGGA	EGQPCLPGGD	WPACAQKIMD
HVEESLCSAA	TPKVTQALNV	LTTTFGRCQS	PWTEALWVRL	SPRVACLLER
DPIPAAHSFV	DLLLCVARSP	VFSSSDGSLW	ETVARALSCL	GPTHMGPLAL
GILKLEHCPQ	ALRTQAFQVL	LQPLACVLKA	TVQAPGPPGL	LDGTADDATT
VDTLLASKSS	CAGLLCRTLA	HLEELQPLPQ	RPSPWPQASL	LGATVTVLRL
CDGSAAPASS	VGGHLCGTLA	GCVRVQRAAL	DFLGTLSQGT	GPQELVTQAL
AVLLECLESP	GSSPTVLKKA	FQATLRWLLS	SPKTPGCSDL	GPLIPQFLRE
LFPVLQKRLC	HPCWEVRDSA	LEFLTQLSRH	WGGQADFRCA	LLASEVPQLA
LQLLQDPESY	VRASAVTAMG	QLSSQGLHAP	TSPEHAEARQ	SLFLELLHIL
SVDSEGFPRR	AVMQVFTEWL	RDGHADAAQD	TEQFVATVLQ	AASRDLDWEV
RAQGLELALV	FLGQTLGPPR	THCPYAVALP	EVAPAQPLTE	ALRALCHVGL
FDFAFCALFD	CDRPVAQKSC	DLLLFLRDKI	ASYSSLREAR	GSPNTASAEA
TLPRWRAGEQ	AQPPGDQEPE	AVLAMLRSLD	LEGLRSTLAE	SSDHVEKSPQ
SLLQDMLATG	GFLQGDEADC	Y

Funkcija

Protein kodiran ovim sveprisutno izraženim genom stupa u interakciju s proteinom koji potiskuje tumor BRCA1 (rak dojke 1) i ATM (ataksija telangiektazija) mutiranim proteinom. Smatra se da je ATM glavni kontrolor signalnih puteva kontrolni punkt ćelijskog ciklusa koji su potrebni za ćelijske odgovore na oštećenje DNK, kao što su dvolančani prekidi koji su inducirani ionizirajućim zračenjem i kompleksima sa BRCA1 u multiproteinskom kompleksu BASC (kompleks za nadzor genoma povezan sa BRAC1). Smatra se da protein kodiran ovim genom ima ulogu u putu oštećenja DNK, koji reguliraju BRCA1 i ATM.^[5]

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000106009 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000148 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ ^a ^b "Entrez Gene: BRCA1-associated ATM activator 1".
^ "UniProt, Q6PJG6" (jezik: engleski). Pristupljeno 23. 9. 2021.

Vanjski linkovi

Lokacija ljudskog genoma BRAT1 i stranica sa detaljima o genu BRAT1 u UCSC Genome Browseru.
PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human BRCA1-associated ATM activator

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000106009 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000148 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: BRCA1-associated ATM activator 1".

[UniProt-6] "UniProt, Q6PJG6" (jezik: engleski). Pristupljeno 23. 9. 2021.

[5]

[1]

[2]

[3]

[4]

[6]