SPT20

Transkripcijski faktor SPT20 je regulator transkripcije. Može regrutovati TATA vezujući protein (TBP) i moguće druge bazne faktore da se vežu za TATA-kutiju. Model njegovog djelovanja proučen je na primjeru Saccharomyces cerevisiae.^[1] Funkcionira kao komponenta kompleksa transkripcijske regulatorne acetilacije histona (HAT) SAGA, SALSA i SLIK. SAGA je uključen u regulaciju transkripcije zavisne od RNK-polimeraze II oko 10% gena kvasca.. Kod promotora, SAGA je potreban za angažovanje mehanizama za baznu transkripciju. Utiče na aktivnost transkripcije RNK polimeraze II putem različitih aktivnosti, kao što su interakcija TBP (SPT3, SPT8 i SPT20) i selektivnost promotora, interakcija s aktivatorima transkripcije (GCN5, ADA2, ADA3 i TRA1) i modifikacija hromatina acetilacijom histona (GCN5) i deubikvitinacijom (UBP8). SAGA acetilira nukleosomni histon H3 u određenoj mjeri (da formira H3K9ac, H3K14ac, H3K18ac i H3K23ac).

SAGA stupa u interakciju sa DNK putem uzvodnih aktivirajućih sekvenci (UAS). SALSA, a izmijenjeni oblik SAGA, može biti uključen u pozitivnu regulaciju transkripcije. Predlaže se da SLIK ima djelimično preklapajuće funkcije sa SAGA-om. Poželjno acetilira metilirani histon H3, barem nakon aktivacije na GAL1-10 lokusu. "ADA5 / SPT20 povezuje ADA i SPT gene, koji su uključeni u transkripciju kvasca".^[2]^[3]^[4]

Reference

^ Casamayor A., Aldea M., Casas C., Herrero E., Gamo F.-J., Lafuente M.J., Gancedo C., Arino J. (1995) DNA sequence analysis of a 13 kbp fragment of the left arm of yeast chromosome XV containing seven new open reading frames. Yeast 11:1281-1288 PubMed
^ Roberts S.M., Winston F. (1996): SPT20/ADA5 encodes a novel protein functionally related to the TATA-binding protein and important for transcription in Saccharomyces cerevisiae. Mol. Cell. Biol. 16:3206-3213(1996) PubMed
^ Kleine K. Dujon B., Albermann K., Aldea M., Alexandraki D., Ansorge W., Arino J., Benes V., Bohn C., Bolotin-Fukuhara M., Bordonne R., Boyer J., Camasses A., Casamayor A., Casas C., Cheret G., Cziepluch C., Daignan-Fornier B., Dang V.-D. (1997): The nucleotide sequence of Saccharomyces cerevisiae chromosome XV. Nature 387:98-102(1997) [PubMed]
^ Engel S.R., Dietrich F.S., Fisk D.G., Binkley G., Balakrishnan R., Costanzo M.C., Dwight S.S., Hitz B.C., Karra K., Nash R.S., Weng S., Wong E.D., Lloyd P., Skrzypek M.S., Miyasato S.R., Simison M., Cherry J.M. (2014): The reference genome sequence of Saccharomyces cerevisiae: Then and now. G3 (Bethesda) 4:389-398(2014) PubMed

Vanjski linkovi

[1] Casamayor A., Aldea M., Casas C., Herrero E., Gamo F.-J., Lafuente M.J., Gancedo C., Arino J. (1995) DNA sequence analysis of a 13 kbp fragment of the left arm of yeast chromosome XV containing seven new open reading frames. Yeast 11:1281-1288 PubMed

[2] Roberts S.M., Winston F. (1996): SPT20/ADA5 encodes a novel protein functionally related to the TATA-binding protein and important for transcription in Saccharomyces cerevisiae. Mol. Cell. Biol. 16:3206-3213(1996) PubMed

[3] Kleine K. Dujon B., Albermann K., Aldea M., Alexandraki D., Ansorge W., Arino J., Benes V., Bohn C., Bolotin-Fukuhara M., Bordonne R., Boyer J., Camasses A., Casamayor A., Casas C., Cheret G., Cziepluch C., Daignan-Fornier B., Dang V.-D. (1997): The nucleotide sequence of Saccharomyces cerevisiae chromosome XV. Nature 387:98-102(1997) [PubMed]

[4] Engel S.R., Dietrich F.S., Fisk D.G., Binkley G., Balakrishnan R., Costanzo M.C., Dwight S.S., Hitz B.C., Karra K., Nash R.S., Weng S., Wong E.D., Lloyd P., Skrzypek M.S., Miyasato S.R., Simison M., Cherry J.M. (2014): The reference genome sequence of Saccharomyces cerevisiae: Then and now. G3 (Bethesda) 4:389-398(2014) PubMed

[1]

[2]

[3]

[4]