PSMB8-AS1

PSMB8 antisens RNK 1 (glava do glave) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom PSMB8-AS1.

PSMB8-AS1
Identifikatori
Aliasi	PSMB8-AS1
Vanjski ID-jevi	GeneCards: PSMB8-AS1
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	100507463	n/a
Ensembl	ENSG00000204261	n/a
UniProt	n a	n/a
RefSeq (mRNK)	n/a	n/a
RefSeq (bjelančevina)	n/a	n/a
Lokacija (UCSC)	n/a	n/a
PubMed pretraga		n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

U jednoj studiju iz 2021., grupa autora proučavala je ovu RNK na primjeru sistemske skleroze (SSc). To je hronična autoimunska bolest koja uglavnom pogađa vezivno tkivo. Kod pacijenata sa SSc, monociti su povećani u cirkulaciji pa se infiltriraju se u zahvaćena tkiva i pokazuju status proupalne aktivacije, uključujući znake interferona (IFN). Ranije su pokazali da je disregulacija IFN odgovora u monocitima pacijenata sa SSc održavana promijenjenim epigenetičkim faktorima, kao i povećanom regulacijom dugolančane nekodirajuće RNK (lncRNK) NRIR. Uzimajući u obzir enormno različite molekulne funkcije lncRNK u imunoskoj regulaciji, ova studija proučavala je profil genomske lncRNK u SSc monocitima, s ciljem daljnjeg otkrivanja njihove moguće uloge u disregulaciji monocita i patogenezi bolesti. Transkriptomski podaci iz dvije nezavisne kohorte pacijenata sa SSc identificirali su 886 lncRNK sa izmenjenom ekspresijom u monocitima SSc. Diferencijalno izražene lncRNK korelirane su sa susjednim genima koji kodiraju proteine uključene u regulaciju IFN odgovora i apoptoznu signalizaciju u SSc monocitima.

Paralelno, analizom mreže koekspresije gena identifikovana je lncRNK PSMB8-AS1 kao gen sa najvišim rangom u modulima koekspresije koji su uključeni u aktivaciju ćelija i odgovor na virusne i eksterne stimulanse. Funkcionalna karakterizacija PSMB8-AS1 u monocitima pokazala je da je ova lncRNK uključena u lučenje IL-6 i TNFα, dva ključna proupalna citokina izmijenjena u cirkulaciji pacijenata sa SSc i povezana s fibrozom i težinom bolesti. Sveukupno, dovbijeni rezultati pokazali su da su lncRNK povezane s disregulacijom monocita u SSc, te utiču na njihov potencijalni doprinos patogenezi bolesti

Zaključno, dubinska bioinformatička analiza otkrila je brojne lncRNK-e neregulirane u monocitima osoba sa SSc i istaknula važan regulatorni potencijal ovih molekula, kako u imunskoj aktivaciji, tako i u patogenezi bolesti. Među njima su posebno otkrili da povećana regulacija PSMB8-AS1 može modulirati izlučivanje proupalnih citokina u monocitima, čime potencijalno doprinosi povećanoj aktivaciji ovih ćelija u SSc. Detaljnije razumijevanje lncRNA i njihov doprinos patogenezi bolesti moglo bi pružiti odskočne daske za identifikaciju novih molekulskih ciljeva za manipulaciju monocitnom aktivnošću u SSc, kako bi se kontrastirao početak i progresija bolesti.

Dopunska literatura

• Talmud PJ, Drenos F, Shah S, Shah T, Palmen J, Verzilli C, Gaunt TR, Pallas J, Lovering R, Li K, Casas JP, Sofat R, Kumari M, Rodriguez S, Johnson T, Newhouse SJ, Dominiczak A, Samani NJ, Caulfield M, Sever P, Stanton A, Shields DC, Padmanabhan S, Melander O, Hastie C, Delles C, Ebrahim S, Marmot MG, Smith GD, Lawlor DA, Munroe PB, Day IN, Kivimaki M, Whittaker J, Humphries SE, Hingorani AD (2009). "Gene-centric association signals for lipids and apolipoproteins identified via the HumanCVD BeadChip". Am. J. Hum. Genet. 85 (5): 628–42. doi:10.1016/j.ajhg.2009.10.014. PMC 2775832. PMID 19913121.