Nesinonimna supstitucija
Nesinonimna supstitucija je nukleotidna mutacija koja mijenj sekvencu aminokiselina nekog proteina. Razlikuje se od sinonimnih, koje ne menjaju sekvence aminokiselina i jesu (ponekad) tihe mutacije. Kako nesinonimne supstitucije rezultiraju biološkom promjenom u organizmu, podliježu prirodnoj selekciji.
Nesinonimske zamjene na određenim lokusima mogu se uporediti sa sinonimnim zamjenama na tom lokusu da bi se dobi o omjer Ka/Ks. Taj omjer koristi se za mjerenje brzine evolucije genskih sekvenci.[1] Ako gen ima niže razine nesinonimnih nego sinonimimnih supstitucija nukleotida, onda se može zaključiti da je funkcionalan, jer omjer Ka/Ks < 1 označava sekvence koje su ograničena na kodiranje proteina.[2] Nesinonimna supstitucija se također referira i kao zamjenska mutacija.
Tipovi
urediPostoji nekoliko uobičajenih tipovaa nesinonimnih supstitucija.[3] Misens mutacije su nesinonimnom supstitucijom koja proizilaze iz tačkastih mutacija , mutacija na jednom nukleotidu, jedne aminokiseline što rezultira promjenama u kodiranom protenu. Nonsens mutacije nisu nesinonimne supstitucije koje nastaju kada mutacije u sekvenci DNK uzrokuju prijevremeni prekid sinteze proteina promjenom originalne aminokiseline u stop kodonu. Drugi tip mutacije koja se bavi stop kodonima poznata je kao nonstop mutacija ili ponovna mutacija, koja se događa kada se stop kodon zmijeni u kodon aminokiseline, uzrokujući da protein bude duži od specificiranog.[3]
Također pogledajte
urediReference
uredi- ^ Ting Hu and Wolfgang Banzhaf. "Nonsynonymous to Synonymous Substitution Ratio ka/ks: Measurement for Rate of Evolution in Evolutionary Computation" (PDF). journal zahtijeva
|journal=(pomoć) - ^ 1962-, Herron, Jon C. (2014). Evolutionary analysis. Freeman, Scott, 1955-, Hodin, Jason A., 1969-, Miner, Brooks Erin,, Sidor, Christian A. (Fifth izd.). Boston. ISBN 978-0321616678. OCLC 859267755.CS1 održavanje: numerička imena: authors list (link)
- ^ a b Nature encyclopedia of the human genome. Cooper, David N. (David Neil), 1957-, Nature Publishing Group. London: Nature Pub. Group. 2003. ISBN 978-0333803868. OCLC 51668320.CS1 održavanje: others (link)