Protomera
Protomera – u strukturnoj biologiji – je strukturna jedinica oligomernog proteina. To je najmanja jedinica koja je sastavljena od najmanje dva različita proteinska lanca koji formiraju heterooligomer putem spajanja dvije ili više kopija ove jedinice.
Termin protomer je uveo Četverin[1] za nomenklaturu u nedvosmislenosti Na/K-ATPaza. Na/K sadrži α- i β-podjedinicu (plus proteolipid, zvani γ-podjedinica). U to vrijeme nije bilo jasno koliko svaka id njih djeluje zajedno. Osim toga, kada se govorilo o dimerima, da li se odnose na αβ ili (αβ)2, Četverin je predložio da je αβ protomer, a (αβ)2 diprotomer.
Protomeri obično imaju obično cikličnu simetriju za formiranje zatvorenih simetrija grupe tačaka.
Primjeri
urediHemoglobin je heterotetramer koji je sastavljen od četiri podjedinice (po dvije α i β). Međutim, strukturno i funkcijski, hemoglobin je opisan boljim u (αβ)2, kada se kaže da je dimer dva αβ-protomera, tj. diprotomer.[2]
Aspartat karbamoiltransferaza ima kompoziciju α6β6 podjedinica. Šest αβ-protomera se aranžiraju u simetriju D3.
Virusne kapride često su načinjene od protomera.
Također pogledajte
urediReference
uredi- ^ Chetverin, A.B. (1986). "Evidence for a diprotomeric structure of Na, K-ATPase: Accurate determination of protein concentration and quantitative end-group analysis". FEBS Lett. 196: 121–125. doi:10.1016/0014-5793(86)80225-3. PMID 3002859.
- ^ Buxbaum, E. (2007). Fundamentals of protein structure and function. New York: Springer. str. 105–120. ISBN 978-0-387-26352-6.
