Vojnu akademiju je završio [[1975]], a [[1990]]. dvogodišnju školu za komandni kadar. [[JNA]] napušta [[1991]]. u činu [[major]]a bijegom iz Komandno-štabne škole u Beogradu. Resor državne bezbjednosti Srbije za njih raspisuje potjernicu i izdaje nalog za njegovo hapšenje.<ref Kao član [[Patriotska liga|Patriotske Lige]] [[Republika Bosna i Hercegovina|RBiH]] bio je autor name="[[Direktiveicty zapress odbranu suvereniteta i teritorijalnog integriteta RBiH]]release">{{cite uweb|date=16. kojoj10. je2007.<!-- daosmjernice11:51 za odbranu RBiH od agresije sa istoka, ali i sa zapada kako je tada procijenio Halilović što se i obistinilo napadom [[HVO]]GMT-a->|url i [[HV]] na nezavisnu Republiku= BiHhttp://www.icty.org/x/cases/halilovic/tjug/en/071016_Halilovic_summary_en.pdf|title SeferHalilovićautor=SUMMARY jeOF konceptaTHE odbraneAPPEALS SarajevaJUDGEMENT odPROSECUTOR agresora koji je na sastanku decembra 1991V. uSEFER [[HrasnicaHALILOVIĆ|Hrasnici]]publisher odobrio= [[AlijaICTY| Izetbegović]]accessdate i= po17. tom10. Halilovićevom2007. konceptu| urađenalast=|quote=}} je šema odbrane Republike BiH od agresije. Isto tako,{{en}}</ref> Sefer Halilović autor je inicijativeobavljao dai sefunkciju člana [[JNA]]Ratno ipredsjedništvo sveRBIH|Ratnog njihovepredsjedništva kasarne napadnu u BiH u isto vrijeme, da se u isto vrijeme sruše svi mostovi i tuneli prema [[Srbija|SrbijiRBiH]] ido da se sa srbijanskim vojnim i paramiliternim jedinicama onemogući da vojno interveniše i napadne nezavisnu Republiku BiH8. Taj plan, međutim, po naredbi Alije Izetbegovića nije proveden6.1993.
Sefer Halilović bio je prvi šef Armije RBiH koju je uredio kao vojnu silu od preko 220.000 vojnika, 5 korpusa, nekoliko operativnih grupa i desetinama brigada, bataljona i specijalnih jedinica. Struktura ARBiH se do kraja rata nije bitno mjenjala.
Sefer Halilović je obavljao i funkciju člana [[Ratno predsjedništvo RBIH|Ratnog predsjedništva RBiH]] do 8.6.1993.
Osnivač je i predsjednik Bosanskohercegovačke patriotske stranke ([[Bosanskohercegovačka patriotska stranka - Sefer Halilović|BPS]]). Obavljao je funkciju Ministra za izbjeglice i raseljena lica u Vladi [[FBiH]]. Bio je i zastupnik u [[Parlament BiH|Parlamentu BiH]] od 2006-10. godine
Na [[Opći izbori u Bosni i Hercegovini 2014.|Općim izborima u Bosni i Hercegovini 2014.]] godine kandidat je [[Bosanskohercegovačka patriotska stranka - Sefer Halilović|BPS]] za člana [[Predsjedništvo Bosne i Hercegovine|Predsjedništva Bosne i Hercegovine]] iz reda [[Bošnjaci|bošnjačkog naroda]].<ref name="B">[http://www.izbori.ba/Utvrdjeni2014/Finalni/PredsjednistvoBiH/Default.aspx Rezultati općih izbora na stranici Centralne izborne komisije Bosne i Hercegovine]</ref>
==Suđenje==
Jedini je general Armije RBiH koji je oslobođen pred sudom [[Međunarodni krivični sud za bivšu Jugoslaviju|Međunarodnim krivičnim sudom za bivšu Jugoslaviju u Den Haagu]].<ref name="icty press release"/>
==Bibliografija==
Autor je knjige "[[Lukava strategija]]" i knjige "[[Nije kriv - priča o montiranoj optužnici i haškom suđenju]]".<ref uname="hdmagazine">{{in kojojlang|bs}} je sumirao- čitav{{cite rad političkoweb|year=2007|url=http://www.hdmagazine.com/bosnia/war/sefer-obavještajno2b.html|title=IZBOR iTEKSTOVA diplomatskogI podzemlja,STUDIJA kojiO suRATU upleteniPROTIV uDRZAVE pokušajI daNARODA|publisher=Povratak seNaslovna njegovimstranica|accessdate=26 eventualnimSeptember osuđivanjem2007|url-status=dead|archiveurl=https://web.archive.org/web/20070927010618/http://www.hdmagazine.com/bosnia/war/sefer-2b.html|archivedate=27 falsifikujeSeptember historija.2007}}</ref>
