Posto je HŠK Zrinjski bio zabranjen bio je prisiljen da pocme karijeru u velezu.Fudbalsku karijeru počeo je [[1984]]. godine u omladinskom pogonu [[FK Velež]]a iz [[Mostar]]a. Sa 19 godina potpisao je prvi prosefionalni ugovor sa [[FK Velež]]om. Nakon povratka iz [[JNA|armije]] [[1991]]. godine, odlazi u posjetu rodbini u [[Njemačku|Njemačku]], te odlazi na trening [[Hannover 96|Hannovera]]. U [[Hannover 96|Hannoveru]] je impresionirao tadašnjeg trenera, te zbog teške političke situacije u [[Jugoslavija|Jugoslaviji]] odlučuje ostati u [[Hannover 96|Hannoveru]], te potpisuje ugovor [[1991]]. godine. U [[Hannover 96|Hannoveru]] ostaje sve do [[1993]]. godine, kada prelazi u [[1. FC Union Berlin|Union Berlin]] za koje je u 88 utakmica postigao 46 golova. Nakon odličnih igara u [[1. FC Union Berlin|Union Berlinu]], [[1996]]. godine prelazi u [[Hansa Rostock|Hansu Rostock]]. U [[Hansa Rostock|Hansi]] provodi dvije solidne sezone, te [[1998]]. godine za 1.100.000 € prelazi u [[Borussia Dortmund|Borussiu Dortmund]]. Međutim nakon dolaska [[Michael Skibbe]]a na trenersko mjesto [[Borussia Dortmund|Dortmunda]], Barbarez pada u drugi plan. Zbog toga [[2000]]. godine odlazi u [[Hamburger SV]] za 1.800.000 €. U [[Hamburger SV|HSV-u]] postaje standardan igrač te u sezoni 2000/2001. postaje najbolji strijelac [[Fußball-Bundesliga|njemačke Bundeslige]]. U [[Hamburger SV|HSV-u]] ostaje šest godina, i stječe velike simpatije kod domaće publike. U periodu od [[2000]]. do [[2006]]. godine za [[Hamburger SV|HSV]] odigrao je 174 ligaške utakmice, te postigao 65 golova. U ljeto [[2006]]. godine prelazi u [[Bayer 04 Leverkusen]], gdje ostaje sve do [[2008]]. godine, odnosno do kraja svoje igračke karijere. U 330 [[Fußball-Bundesliga|bundesligaških]] utakmica postigao je 95 golova, dobio 85 žutih, te 4 crvena kartona.
