ST6GALNAC1
Alfa-N-acetilgalaktosaminid alfa-2,6-sijaltransferaza 1 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom ST6GALNAC1.[5] Ovaj enzim dodaje N-acetilneuraminsku kiselinu (sijalna kiselina/Neu5Ac) u O-povezani N-acetilgalaktozamin (GalNAc) na peptide/proteine (koji se nazivaju i Tn antigen) sa α2-6 vezom da bi se dobio sijal-Tn antigen. Pokazalo se da enzim preferira Thr u odnosu na Ser koji sadrži ostatke GalNAc.[6][7]
Dužina polipeptidnog lanca je 600 aminokiselina, a molekulska težina 68.564.[8].
Aminokiselnska sekvenca uredi
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MRSCLWRCRH | LSQGVQWSLL | LAVLVFFLFA | LPSFIKEPQT | KPSRHQRTEN | ||||
| IKERSLQSLA | KPKSQAPTRA | RRTTIYAEPV | PENNALNTQT | QPKAHTTGDR | ||||
| GKEANQAPPE | EQDKVPHTAQ | RAAWKSPEKE | KTMVNTLSPR | GQDAGMASGR | ||||
| TEAQSWKSQD | TKTTQGNGGQ | TRKLTASRTV | SEKHQGKAAT | TAKTLIPKSQ | ||||
| HRMLAPTGAV | STRTRQKGVT | TAVIPPKEKK | PQATPPPAPF | QSPTTQRNQR | ||||
| LKAANFKSEP | RWDFEEKYSF | EIGGLQTTCP | DSVKIKASKS | LWLQKLFLPN | ||||
| LTLFLDSRHF | NQSEWDRLEH | FAPPFGFMEL | NYSLVQKVVT | RFPPVPQQQL | ||||
| LLASLPAGSL | RCITCAVVGN | GGILNNSHMG | QEIDSHDYVF | RLSGALIKGY | ||||
| EQDVGTRTSF | YGFTAFSLTQ | SLLILGNRGF | KNVPLGKDVR | YLHFLEGTRD | ||||
| YEWLEALLMN | QTVMSKNLFW | FRHRPQEAFR | EALHMDRYLL | LHPDFLRYMK | ||||
| NRFLRSKTLD | GAHWRIYRPT | TGALLLLTAL | QLCDQVSAYG | FITEGHERFS | ||||
| DHYYDTSWKR | LIFYINHDFK | LEREVWKRLH | DEGIIRLYQR | PGPGTAKAKN | ||||
Glikozilacija proteina utiče na interakciju ćelija-ćelija, interakcije s matricom i funkcije unutarćelijskih molekula. ST6GALNAC1 prenosi sijalnu kiselinu, N-acetilneuraminsku kiselinu (NeuAc), u alfa-2,6 vezu na ostatke GalNAc vezane za O. Sijal-Tn (sTn) antigen povezan s rakom nastaje sialilacijom ostataka GalNAc, na mucinama kataliziranog sa ST6GALNAC1 (Ikehara et al., 1999; Sewell et al., 2006).
Kloniranje i ekspresija uredi
RT-PCR RNK dobijene iz ljudskihih pilornih sluznica sa intestinalnom metaplazijom, koja obilno eksprimira sTn antigen, Ikehara et al. (1999) klonirali su dvije varijante prerade ST6GalNAc I, koje su označili kao STYI-L i STYI-S. STYI-L kodira izvedeni membranski protein tipa 600 aminokiselina, sa citoplazmatskim N-krajem, praćen transmembranskim domenom, regijom dugog stabla i katalitskom regijom. U poređenju sa STYI-L, u katalitskoj regiji STYI-S nedostaje 78 aminokiselina. Northern blot analizom otkriven je transkript od 2,5 kb u sluznici pilorusa, sluznici fundusne žlijezde s teškom crijevnom metaplazijom i normalnoj sluznici duodenuma, ali ne u normalnoj slezeni, mozgu ili gušterači.
Funkcija gena uredi
Koristeći RT-PCR, Ikehara et al. (1999) otkrili su da ljudske ćelijske linije koje eksprimiraju antigen sTn eksprimiraju STYI-L, ali ne i STYI-S, dok ćelijske linije koje ne izražavaju sTn izražavaju STYI-S, ali ne i STYI-L. Hibridizacija in situ otkrila je STYI u ćelijama karcinoma želuca koji luče sTn-pozitivne mucine. Pronašli su recipročnu ekspresiju sialil Lewis x i sTn antigena.[9]
Transficirane ćelije ljudskog kolorektumskog karcinoma koje stabilno eksprimiraju STYI-L sTn epitope na O-glikanima. Lizati ovih ćelija pokazali su snažnu aktivnost prenosa NeuAc prema fetuinu (AHSG), asialofetuinu, agalaktoaziolofetuinu, asialo-BSM (goveđi podmaksilni mucin) i azija-glikoforinu. STYI-L je pokazao slabu aktivnost prema BSM-u i nikakvu aktivnost prema ostalim ispitanim akceptorskim podlogama. Polimeri od dvije do sedam jedinica ala-thr (GalNAc-alfa-1) -ala također su bili dobra akceptorska podloga. Tretman sijalidazom otkrio je da su ostaci NeuAc ugrađeni u GalNAc ostatke O-glikana, preko alfa-2,6 veze. Za razliku od STYI-L, STYI-S je pokazao vrlo nisku aktivnost sialiltransferaze samo prema fetuinu, što sugerira da nije aktivni enzim.
Julien et al. (2001) otkrili su da ćelije raka dojke koje prekomjerno eksprimiraju sTn antigen, zbog prekomerne ekspresije ST6GalNAc I pokazuju morfološke promjene, smanjen rast i povećanu migraciju.[10] U karcinomima dojke, Sewell et al. (2006) pronašli su potpunu korelacija između ekspresije iRNK ST6GalNAc I i ekspresije sTn. Endogena ili egzogena ekspresija ST6GalNAc I, ali ne i ST6GalNAc II (ST6GALNAC2; 610137), uvijek je rezultirala ekspresijom sTn, koja je prekinula produženje lanca. Ova sposobnost nadjačavanja puteva core1/core 2 O-glikozilacije bila je posljedica lokalizacije ST6GalNAc I kroz Golgijeve nakupine.[11]
Hartz (2006) je mapirala je gen ST6GALNAC1 na hromosomskoj poziciji 17q25.1, na osnovu poravnanja sekvence ST6GALNAC1 (GenBank AY09600) sa genomskom sekvencom.
Reference uredi
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000070526 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009588 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: ST6GALNAC1 ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1,3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1".
- ^ Mehta AY, Veeraiah RK, Dutta S, Goth CK, Hanes MS, Gao C, et al. (juni 2020). "Parallel Glyco-SPOT Synthesis of Glycopeptide Libraries". Cell Chemical Biology. 27 (9): 1207–1219.e9. doi:10.1016/j.chembiol.2020.06.007. PMID 32610041.
- ^ Yoshimura Y, Denda-Nagai K, Takahashi Y, Nagashima I, Shimizu H, Kishimoto T, et al. (novembar 2019). "Products of Chemoenzymatic Synthesis Representing MUC1 Tandem Repeat Unit with T-, ST- or STn-antigen Revealed Distinct Specificities of Anti-MUC1 Antibodies". Scientific Reports. 9 (1): 16641. doi:10.1038/s41598-019-53052-1. PMC 6851390. PMID 31719620.
- ^ "UniProt, Q9NSC7". Pristupljeno 12. 6. 2021.
- ^ Ikehara, Y., Kojima, N., Kurosawa, N., Kudo, T., Kono, M., Nishihara, S., Issiki, S., Morozumi, K., Itzkowitz, S., Tsuda, T., Nishimura, S.-I., Tsuji, S., Narimatsu, H. Cloning and expression of a human gene encoding an N-acetylgalactosamine-alpha-2,6-sialyltransferase (ST6GalNAc I): a candidate for synthesis of cancer-associated sialyl-Tn antigens. Glycobiology 9: 1213-1224, 1999. PubMed: 10536037
- ^ Julien, S., Krzewinski-Recchi, M.-A., Harduin-Lepers, A., Gouyer, V., Huet, G., Le Bourhis, X., Delannoy, P. Expression of sialyl-Tn antigen in breast cancer cells transfected with the human CMP-Neu5Ac:GalNAc alpha-2,6-sialyltransferase (ST6GalNAc I) cDNA. Glycoconjugate J. 18: 883-893, 2001.
- ^ Sewell, R., Backstrom, M., Dalziel, M., Gschmeissner, S., Karlsson, H., Noll, T., Gatgens, J., Clausen, H., Hansson, G. C., Burchell, J., Taylor-Papadimitriou, J. The ST6GalNAc-I sialyltransferase localizes throughout the Golgi and is responsible for the synthesis of the tumor-associated sialyl-Tn O-glycan in human breast cancer. J. Biol. Chem. 281: 3586-3594, 2006. [PubMed]: 16319059
Dopunska literatura uredi
- Lee YC, Kaufmann M, Kitazume-Kawaguchi S, Kono M, Takashima S, Kurosawa N, Liu H, Pircher H, Tsuji S (april 1999). "Molecular cloning and functional expression of two members of mouse NeuAcalpha2,3Galbeta1,3GalNAc GalNAcalpha2,6-sialyltransferase family, ST6GalNAc III and IV". The Journal of Biological Chemistry. 274 (17): 11958–67. doi:10.1074/jbc.274.17.11958. PMID 10207017.
- Ikehara Y, Kojima N, Kurosawa N, Kudo T, Kono M, Nishihara S, Issiki S, Morozumi K, Itzkowitz S, Tsuda T, Nishimura SI, Tsuji S, Narimatsu H (novembar 1999). "Cloning and expression of a human gene encoding an N-acetylgalactosamine-alpha2,6-sialyltransferase (ST6GalNAc I): a candidate for synthesis of cancer-associated sialyl-Tn antigens". Glycobiology. 9 (11): 1213–24. doi:10.1093/glycob/9.11.1213. PMID 10536037.
- Donadio S, Dubois C, Fichant G, Roybon L, Guillemot JC, Breton C, Ronin C (2004). "Recognition of cell surface acceptors by two human alpha-2,6-sialyltransferases produced in CHO cells". Biochimie. 85 (3–4): 311–21. doi:10.1016/S0300-9084(03)00080-4. PMID 12770770.
- Julien S, Krzewinski-Recchi MA, Harduin-Lepers A, Gouyer V, Huet G, Le Bourhis X, Delannoy P (2003). "Expression of sialyl-Tn antigen in breast cancer cells transfected with the human CMP-Neu5Ac: GalNAc alpha2,6-sialyltransferase (ST6GalNac I) cDNA". Glycoconjugate Journal. 18 (11–12): 883–93. doi:10.1023/A:1022200525695. PMID 12820722. S2CID 21051703.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q, Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (oktobar 2003). "The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment". Genome Research. 13 (10): 2265–70. doi:10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
- Sewell R, Bäckström M, Dalziel M, Gschmeissner S, Karlsson H, Noll T, Gätgens J, Clausen H, Hansson GC, Burchell J, Taylor-Papadimitriou J (februar 2006). "The ST6GalNAc-I sialyltransferase localizes throughout the Golgi and is responsible for the synthesis of the tumor-associated sialyl-Tn O-glycan in human breast cancer". The Journal of Biological Chemistry. 281 (6): 3586–94. doi:10.1074/jbc.M511826200. PMID 16319059.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (novembar 2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.