Antisensna RNK SNAI3 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SNAI3-AS1.[3] SNAI3 je član porodice gena SNAIL, nazvan po snail genu Drosophila, koji ima ulogu u mezodermnoj formaciji tokom embriogeneze.

SNAI3-AS1
Identifikatori
AliasiSNAI3-AS1
Vanjski ID-jeviGeneCards: SNAI3-AS1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 16 (čovjek)
Hrom.Hromosom 16 (čovjek)[1]
Hromosom 16 (čovjek)
Genomska lokacija za SNAI3-AS1
Genomska lokacija za SNAI3-AS1
Bend16q24.2Početak88,663,298 bp[1]
Kraj88,687,282 bp[1]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_144986

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 16: 88.66 – 88.69 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Kloniranje i ekspresija uredi

Analizom baze podataka koristeći mišji Snai3 kao upit, Katoh i Katoh (2003) identificirali su ljudski SNAI3. Izvedeni protein od 292 aminokiseline ima N-terminalni SNAG domen i pet C2H2 tipova domena cinkovih prstiju. SNAI3 ima 41,2% i 48,0% aminokiselinskih identiteta sa SNAI1 (604238), odnosno SNAI2 (602150). Analiza baze podataka EST pokazala je ekspresiju u melanotskom melanomu ljudske kože, udruženu s plućnim i slezenskim epidermoidnom karcinomom pluća i tkivima tumora zametnih ćelija.[4]

Struktura gena uredi

Katoh i Katoh (2003) utvrdili su da gen SNAI3 sadrži najmanje tri egzona.

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000260630 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Entrez Gene: SNAI3 antisense RNA 1". Pristupljeno 29. 4. 2016.
  4. ^ Katoh, M., Katoh, M. Identification and characterization of human SNAIL3 (SNAI3) gene in silico. Int. J. Molec. Med. 11: 383-388, 2003. PubMed: 12579345