SNAI3-AS1
Antisensna RNK SNAI3 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SNAI3-AS1.[3] SNAI3 je član porodice gena SNAIL, nazvan po snail genu Drosophila, koji ima ulogu u mezodermnoj formaciji tokom embriogeneze.
SNAI3-AS1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | SNAI3-AS1 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | GeneCards: SNAI3-AS1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
| ||||||||||||||||||||||||
Ensembl |
| ||||||||||||||||||||||||
UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) |
| ||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 16: 88.66 – 88.69 Mb | n/a | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [2] | n/a | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Kloniranje i ekspresija uredi
Analizom baze podataka koristeći mišji Snai3 kao upit, Katoh i Katoh (2003) identificirali su ljudski SNAI3. Izvedeni protein od 292 aminokiseline ima N-terminalni SNAG domen i pet C2H2 tipova domena cinkovih prstiju. SNAI3 ima 41,2% i 48,0% aminokiselinskih identiteta sa SNAI1 (604238), odnosno SNAI2 (602150). Analiza baze podataka EST pokazala je ekspresiju u melanotskom melanomu ljudske kože, udruženu s plućnim i slezenskim epidermoidnom karcinomom pluća i tkivima tumora zametnih ćelija.[4]
Struktura gena uredi
Katoh i Katoh (2003) utvrdili su da gen SNAI3 sadrži najmanje tri egzona.
Reference uredi
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000260630 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: SNAI3 antisense RNA 1". Pristupljeno 29. 4. 2016.
- ^ Katoh, M., Katoh, M. Identification and characterization of human SNAIL3 (SNAI3) gene in silico. Int. J. Molec. Med. 11: 383-388, 2003. PubMed: 12579345