SHC SH2 domen-vezujuči protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SHCBP1.

SHCBP1
Identifikatori
AliasiSHCBP1
Vanjski ID-jeviOMIM: 611027 MGI: 1338802 HomoloGene: 32123 GeneCards: SHCBP1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 16 (čovjek)
Hrom.Hromosom 16 (čovjek)[1]
Hromosom 16 (čovjek)
Genomska lokacija za SHCBP1
Genomska lokacija za SHCBP1
Bend16q11.2Početak46,578,591 bp[1]
Kraj46,621,379 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za SHCBP1
Genomska lokacija za SHCBP1
Bend8|8 A1.1Početak4,785,976 bp[2]
Kraj4,829,567 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija SH2 domain binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta citoskelet
citoplazma
Diobeno vreteno
midbody
Biološki proces regulation of neural precursor cell proliferation
fibroblast growth factor receptor signaling pathway
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_024745
NM_001324318
NM_001324319

NM_011369

RefSeq (bjelančevina)

NP_001311247
NP_001311248
NP_079021

NP_035499

Lokacija (UCSC)Chr 16: 46.58 – 46.62 MbChr 8: 4.79 – 4.83 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Međunarodni konzorcij za radijacijsko hibridno mapiranje lociralo je je gen SHCBP1 na hromosom 16 (RH78742).[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 673 aminokiseline, a molekulska težina 75.690 Da.[7]

1020304050
MADGSLTGGGLEAAAMAPERMGWAVEQELASLEKGLFQDEDSCSDCSYRD
KPGSSLQSFMPEGKTFFPEIFQTNQLLFYERFRAYQDYILADCKASEVQE
FTAEFLEKVLEPSGWRAVWHTNVFKVLVEITDVDFAALKAVVRLAEPYLC
DSQVSTFTMECMKELLDLKEHRLPLQELWVVFDDSGVFDQTALAIEHVRF
FYQNIWRSWDEEEEDEYDYFVRCVEPRLRLHYDILEDRVPSGLIVDYHNL
LSQCEESYRKFLNLRSSLSNCNSDSEQENISMVEGLKLYSEMEQLKQKLK
LIENPLLRYVFGYQKNSNIQAKGVRSSGQKITHVVSSTMMAGLLRSLLTD
RLCQEPGEEEREIQFHSDPLSAINACFEGDTVIVCPGHYVVHGTFSIADS
IELEGYGLPDDIVIEKRGKGDTFVDCTGADIKISGIKFVQHDAVEGILIV
HRGKTTLENCVLQCETTGVTVRTSAEFLMKNSDLYGAKGAGIEIYPGSQC
TLSDNGIHHCKEGILIKDFLDEHYDIPKISMVNNIIHNNEGYGVVLVKPT
IFSDLQENAEDGTEENKALKIQTSGEPDVAERVDLEELIECATGKMELCA
RTDPSEQVEGNCEIVNELIAASTQKGQIKKKRLSELGITQADDNLMSQEM
FVGIVGNQFKWNGKGSFGTFLF
Simboli

Funkcija gena

uredi

Studijama koimunoprecipitacije na mišjima Shcbp1 i Shc, Schmandt et al. (1999) pokazali su da se Shcbp1 povezuje s izoformama p52 i p46 Shc. Studije padavina pokazale su da je povezanost Shcbp1 i Shc posredovana preko SH2 domena Shc i da je ta interakcija neovisna od fosforilacije tirozina.[8]

Kloniranje i ekspresija

uredi

2-hibridnim skriningom kvačeve biblioteka mišjih T-ćelija i embrionske cDNK s p52 SHC (SHC1) kao sondom, Schmandt et al. (1999) klonirali su Shcbp1, koji su nazvali Pal. Izvedeni mišji protein od 668 aminokiselina ima predviđenu molekulskuu masu od 75 kD i sadrži 23 ostatka tirozina, od kojih se nekoliko nalazi u motivima dobrog konsenzusa za domene SH2. Izolirali su ljudski SHCBP1, koji dijeli 78,2% aminokiselinskog identiteta sa svojim mišjim homologom. Northern blot analizom mišjih tkiva otkrivena je snažna ekspresija u sjemenicima i niža ekspresija u slezeni, plućima i srcu. Ekspresija iRNK Shcbp1 uočena je u mišićima u svim fazama razvoja embriona, a ekspresija iRNK Shcbp1 i proteina ograničena je na tkiva koja sadrže aktivno dijeleće ćelije i proliferirajuće ćelije u kulturi

Interakcije

uredi

Dokazano je da SHCBP1 ima interakcije sa SHC1.[5]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000171241 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022322 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b Schmandt R, Liu SK, McGlade CJ (Mar 1999). "Cloning and characterization of mPAL, a novel Shc SH2 domain-binding protein expressed in proliferating cells". Oncogene. 18 (10): 1867–1879. doi:10.1038/sj.onc.1202507. PMID 10086341.
  6. ^ "Entrez Gene: SHCBP1 SHC SH2-domain binding protein 1".
  7. ^ "UniProt, Q8NEM2". Pristupljeno 9. 7. 2021.
  8. ^ Schmandt, R., Liu, S. K., McGlade, C. J. Cloning and characterization of mPAL, a novel Shc SH2 domain-binding protein expressed in proliferating cells. Oncogene 18: 1867-1879, 1999. [ PubMed: 10086341

Dopunska literatura

uredi