DEAH-kutijska helikaza 8: razlika između verzija

m
razne ispravke
(Nova stranica: {{Infokutija gen}} '''DEAH-kujtijska helikaza 8''', jest protein/enzim koji je kod ljudi kodiran genom '''DHX8''' sa hromosoma 17. Ovaj protein je član porodice polipepti DEAH-kutije. Glavna karakteristika ove grupe je njihov konzervirani motiv DEAH (Asp- Glu- Ala- His).<ref>{{cite web|url=https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=DHX8|title=DHX8 Gene - GeneCards {{!}} DHX8 Protein {{!}...)
oznaka: linkovi ka čvor-člancima
 
m (razne ispravke)
 
{{Infokutija gen}}
'''DEAH-kujtijska [[helikaza]] 8''', jest [[protein]]/[[enzim]] koji je kod [[ljudi]] [[kodon|kodiran]] [[gen]]om '''DHX8''' sa [[hromosom 17|hromosoma 17]]. Ovaj protein je član porodice polipepti [[DEAD/DEAH-kutijska helikaza|DEAH-kutije]]. Glavna karakteristika ove grupe je njihov konzervirani motiv DEAH (Asp- Glu- Ala- His).<ref>{{cite web|url=https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=DHX8|title=DHX8 Gene - GeneCards {{!}} DHX8 Protein {{!}} DHX8 Antibody|website=www.genecards.org|access-date=2019-10-20. 10. 2019}}</ref> Širok spektar [[RNK]]-[[helikaza]] pripada ovoj porodici. Konkretno, DHX8 djeluje kao [[ATP]]-zavisna RNK-helikaza, uključena u [[splajsing]] i regulaciju oslobađanja prerađenih i[[RNK]] iz [[splajsosom]]a iz jedra.<ref>{{cite web |url= https://www.uniprot.org/uniprot/Q14562 |title=DHX8 - ATP-dependent RNA helicase DHX8 - Homo sapiens (Human) - DHX8 gene & protein| work = UniProt |access-date=2019-10-20. 10. 2019 }}</ref> Objavljene studije su pokazale posljedice [[mutacija]] DHX8, aneke od njih su kritične za biološke procese kao što je [[hematopoeza]] i povezane su s nekim bolestima..<ref name = "English_2012">{{cite journal | vauthors = English MA, Lei L, Blake T, Wincovitch SM, Sood R, Azuma M, Hickstein D, Liu PP | display-authors = 6 | title = Incomplete splicing, cell division defects, and hematopoietic blockage in dhx8 mutant zebrafish | journal = Developmental Dynamics | volume = 241 | issue = 5 | pages = 879–89 | date = Maymaj 2012 | pmid = 22411201 | pmc = 3328592 | doi = 10.1002/dvdy.23774 }}</ref><ref name = "Dziuba_2012">{{cite journal | vauthors = Dziuba N, Ferguson MR, O'Brien WA, Sanchez A, Prussia AJ, McDonald NJ, Friedrich BM, Li G, Shaw MW, Sheng J, Hodge TW, Rubin DH, Murray JL | display-authors = 6 | title = Identification of cellular proteins required for replication of human immunodeficiency virus type 1 | journal = AIDS Research and Human Retroviruses | volume = 28 | issue = 10 | pages = 1329–39 | date = Octoberoktobar 2012 | pmid = 22404213 | pmc = 3448097 | doi = 10.1089/aid.2011.0358 }}</ref>
 
==Aminokiselinska sekvenca==
Dužina [[polipeptid]]nog lanca je 1.220 [[aminokiselina]], a [[molekularna masa|molekulska težina]] 139.315 [[Dalton (jedinica)|Da]]. <ref name="UniProt">{{cite web|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q14562#sequences |title=UniProt, Q14562 |language=en |accessdateaccess-date=7. 1. 2022-01-07}}</ref>
{{legenda aminokiselina}}
<table style="font-family:monospace;">
<tr style="background-color: #eee;"><td>LYNRYEEPNA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>WRISRAFRRR</td></tr>
</table>
 
 
== Struktura ==
 
[[slika:Protein Sequence.jpg|thumb|left|Aminokiselinska sekvenca DHX8 i njegova [[sekundarna struktura]].<ref name="Felisberto-Rodrigues_2019"/>]]
 
Protein DHX8 je dio [[proteinski kompleks|proteinskog kompleksa]] zvanog [[splajsosom]], koji je zadužen za preradu pre-iRNK. Splajsosom ima osam glavnih funkcionalnih stanja, svako sa različitim sastavom i strukturom; pet od osam stanje je strukturno okarakterisano.<ref>{{cite journal | vauthors = Zhang X, Zhan X, Yan C, Zhang W, Liu D, Lei J, Shi Y | title = Structures of the human spliceosomes before and after release of the ligated exon | journal = Cell Research | volume = 29 | issue = 4 | pages = 274–285 | date = Aprilapril 2019 | pmid = 30728453 | pmc = 6461851 | doi = 10.1038/s41422-019-0143-x }}</ref>
 
DHX8 ima različite domene: [[S1-domen|S1-RNK vezujući domen]] (DEAD/DEAH kutija), helikazni konzervirani [[C-terminal]]ni domen, domen povezan s helikazom (HA2) i [[oligonukleotid]]/[[oligosaharid]]-vezujući OB)- preklopni domen (svaki prerađen sa unutrašnje poremećenim regijana).<ref>{{cite web |url= http://pfam.xfam.org/protein/Q14562 |title=Protein: DHX8_HUMAN (Q14562) |work=Pfam }}</ref>
 
== Funkcija ==
DHX8 je lokalizovan u ćelijskom jedu i stimuliran prisustvom [[RNK]]. Ovaj protein je komponenta splajsosoma, tako da učestvuje u [[prerada RNK|pereradipre-iRNK]].<ref name="Felisberto-Rodrigues_2019">{{PDB|6HYU}}; {{cite journal | vauthors = Felisberto-Rodrigues C, Thomas JC, McAndrew C, Le Bihan YV, Burke R, Workman P, van Montfort RL | title = Structural and functional characterisation of human RNA helicase DHX8 provides insights into the mechanism of RNA-stimulated ADP release | journal = The Biochemical Journal | volume = 476 | issue = 18 | pages = 2521–2543 | date = Septemberseptembar 2019 | pmid = 31409651 | doi = 10.1042/BCJ20190383 | doi-access = free }}</ref> Splajsing je proces spajanja [[egzon]]a iz [[primarni transkript|primarnih transkripata]] [[iRNK]] i eliminacije [[intron]]skih sekvenci, pomoću splajsosomnog mehanizma, tako da je proizvedena iRNK bez introna, koja se sastoji isključivo od spojenih egzona.<ref>{{cite web|url=https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/term/GO:0000398|title=mRNA splicing, via spliceosome |url-status=live | work = Gene Ontology and GO Annotations | publisher = European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)}}</ref> Prerada se završava rastavljanjem splajsosomnog kompleksa i oslobađanjem rezultirajućih zrelih RNK-a do vanjskog dijela jedra, ovisno o [[ATP]]-u.<ref>{{cite web |url= https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/term/GO:0000390 |title=Spliceosomal Complex Disassembly |url-status=live | work = Gene Ontology and GO Annotations | publisher = European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) }}</ref> Splajsosom zahtijeva konformacijske promjene da bi mogao katalizirati reakcije spajanja i kasnije zrelih iRNK koje se oslobađaju na vanjski dio jedra. Jedna od ATP-ovisnih helikaza potrebnih za ove konformacijske promjene je DHX8. Nadalje, DHX8 ima ključnu ulogu u oslobađanju, olakšavanju jedarnog eksporta prerađene iRNK. Karakterizacija proteina je pokazala da DHX8 ima prednost vezanja za RNK bogate [[adenin]]om. Ovo vezivanje je praćeno hidrolizom ATP-a i time oslobađanjem [[ADP]]-a.<ref name="Felisberto-Rodrigues_2019" />{{clear}}
 
== Reference ==
* {{PDBe-KB2|Q14562|ATP-dependent RNA helicase DHX8}}
{{enzimi}}
 
[[Kategorija:Geni na hromosomu 17]]
[[Kategorija:Enzimi]]
[[Kategorija:Ljudski proteini]]
[[Kategorija:Proteomika]]