Razlika između verzija stranice "Proteinska banka podataka"

[pregledana izmjena][pregledana izmjena]
Uklonjeni sadržaj Dodani sadržaj
m →‎Historija: datumi: ispravljam "D. Mjesec GGGG" u "D. M. GGGG"
m ISBN magic link > {{ISBN}}; razne ispravke
Red 13:
|format = [[Protein Data Bank (file format)|PDB]]
|url = {{Plainlist|
* http://www.wwPDB.org/<br>
*http://www.pdbe.org<br>
* {{URL|https://web.archive.org/web/20080828002005/http://www.rcsb.org./pdb<br>
*http://www.pdbj.org<br>
}}
'''Proteinska banka podataka''', ([[engleski jezik|eng.]] Protein Data Bank – '''PDB'''), je kolekcija 3D podataka o strukturi velikih bioloških molekula, kao što su [[protein]]i i [[nukleinske kiseline]]. Podaci su tipski dobijeni [[Rendgenska strukturna analiza|rendgenskom strukturnom analizom]] ili [[Proteinska nuklearno magnetna rezonantna spektroskopija| proteinskom nuklearnom magnetnom rezonantnom spektroskopijom]] (NMR) . Stvaranju ove zbirke doprinose [[biologija|biolozi]] i [[biohemija|biohemičari]] širom svijeta. PDB je slobodno dostupan na [[Internet]]u, pod nadzorom organizacije pod nazivom ''Svjetska proteinska banka podataka'' ([[engleski jezik|eng.]] Worldwide Protein Data Bank -{'''wwPDB'''}-).<ref>Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, {{ISBN |9958-9344-1-8}}.</ref><ref>Kapur Pojskić L., Ed. (2014): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, 2. izdanje. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, {{ISBN |978-9958-9344-8-3}}.</ref>
 
Proteinska baza podataka je ključni resurs u oblastima [[strukturna biologija|strukturne biologije]], kao što je [[strukturna genomika]]. Većina vodećih naučnih časopisa i pojedine agencije za finansiranje, kao što je [[NIH]] u [[SAD]], zahtevaju od istraživača da unesu svoje podatke o strukturi proteina podatke u PDB. Njen sadržaj se smatra primarnim izvorom, a postoje stotine izvedenih baza podataka koje kategorizuju podatke na razne načine. Naprimjer, [[Strukturna klasifikacija proteina|-{SCOP}-]] i -{[[CATH]]}- kategorizuju strukture proteina na temelju strukturnog tipa i pretpostavljenih evolucijskih odnosa, a [[Ontologija gena]] (GO) klasificira strukture na osnovu [[gen]]a.<ref name = "Historical">{{cite journal | first = H. M. | last = Berman | authorlink = | coauthors = | year = 2008 | month = January | date = | title = The Protein Data Bank: a historical perspective | quotes = | pmid = 18156675| journal = Acta Crystallographica Section A: Foundations of Crystallography | volume = A64 | issue = 1 | pages = 88–95 | doi = 10.1107/S0108767307035623 | id = | url = http://journals.iucr.org/a/issues/2008/01/00/sc5004/sc5004.pdf }}</ref>
Red 84:
 
[[Kategorija:Biološke baze podataka]]
[[Kategorija:Medicinske baze podataka]]