Uobičajeni nazivi ligaznih enzima često uključuju riječ "ligaza", kao što je [[DNK ligaza]], enzim koji se obično koristi u laboratorijama koje za [[molekulska biologija|molekulskobiološke]] analize, za spajanje fragmenata [[DNK]]. Drugi česti nazivi za ligaze uključuju naziv '''sintetaza''', jer se koriste za [[Biosinteza | sintetizu]] novih molekula.
Pritom treba imati na umu da, izvorno, biohemijska nomenklatura koristi termine sintetaza i [[sintaza]] . Prema prvobitnoj definiciji, sintaze ''ne koriste'' energiju iz [[nukleozid trifosfatatrifosfat]]a (kao što su [[ATP]], GTP, CTP, TTP, i UTP), dok ih sintetaza u iste svrhe ''koristi''. Ona je također govori da je sintaze jedna od [[lijaza]] (a lijaza je enzim koji katalizira razgradnju raznih hemijskih veza, osim hidrolize i oksidacije, često formirajući nove dvostruke veze ili strukture novog prstena) čemu nije potrebna nikakva energija. Sintetaze su ligaze (a ligaze je enzimi koji vezuju dva hemijska jedinjenja) koje zahtijevaju energiju. Međutim, [[Zajedničke komisija za biohemijsku nomenklaturu]] (''JCBN'') nalaže da se naziv "sintaze" može koristiti za bilo koji enzim koji katalizira sintezu (bez obzira da li ili ne koristi nukleozid trifosfate), dok se "sintetaze" koriste kao sinonimi.<ref>http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/newsletter/misc/synthase.html, Synthases and ligases |work=chem.qmul.ac.uk.</ref>
