Razlika između izmjena na stranici "Koljeno (biologija)"

Uklonjena 782 bajta ,  prije 4 godine
nema sažetka izmjene
((review))
'''Koljeno''' ([[latinski jezik|lat.]] φῦλον - ''phylumphylon'' = rasa, grana u vez,i sa φυλή - ''phyle' = pleme , klan) je [[taksonomski rang]] u [[biosistematika|biosistematici]]: u [[botanika|botanici]], [[zoologija|zoologiji]] i [[bakteriologija|bakteriologiji]]. Ponekad se dijeli na potkoljena (''subphyla'', jednina ''subphylum''). Više koljena, u nekim slučajevima, se povezuje u natkoljeno (''superphylum''), taksonomski rang koji tada obuhvata sva pripadajuća koljena.
 
[[Takson]] koljeno nalazi se između [[carstvo (biologija)|carstva]] i [[razred (biologija)|razreda]].<ref name=“Sofradzija“>{{cite book|author=Sofradžija A., Šoljan D., Hadžiselimović R. |year= 2004|title= Biologija 1.|publisher= Svjetlost, Sarajevo|isbn=9958-10-686-8}}</ref>
* U nekim sistematikama [[životinje|životinjsko]] carstvo se prvo dijeli na [[odjeljak (biologija)|odjeljke]], koji se zatim dijele na koljena. [[Bilateralne životinje]] se tako dijelom prikazuju kao odjeljak.
* U [[botanika|botanici]] i [[mikologija|mikologiji]] je, uz koljeno (''phylum''), kao sinonim dozvoljen i pojam divizija (''divisio'').
* U [[bakteriologija|bakteriologiji]] se dozvoljava korištenje pojma "koljeno" i za [[klonklan]]ove., ćešće grupa sojeva.<ref> {{cite bbook
In biology, a '''phylum''' ({{IPAc-en|ˈ|f|aɪ|l|əm}}; [[plural]]: '''phyla''')<ref group=note>The term was coined by [[Ernst Haeckel|Haeckel]] from Greek φῦλον ''phylon'', "race, stock," related to φυλή ''phyle'', "tribe, clan."</ref> is a [[taxonomic rank]] below [[Kingdom (biology)|kingdom]] and above [[Class (biology)|class]]. Traditionally, in [[botany]] the term '''division''' was used instead of "phylum", although from 1993 the [[International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants]] accepted the designation "phylum".<ref>{{cite book
|title=The American Heritage New Dictionary of Cultural Literacy
|url=http://dictionary.reference.com/browse/phylum
|publisher=Houghton Mifflin Company
|chapter=Life sciences
|quote=Phyla in the plant kingdom are frequently called divisions.}}</ref><ref name="Berg2007">{{cite book|last=Berg|first=Linda R.|title=Introductory Botany: Plants, People, and the Environment|url=https://books.google.com/books?id=I71WWH9ZmfsC&pg=PA15|accessdate=23 July 2012|edition=2|date=2007-03-02|publisher=Cengage Learning|isbn=9780534466695|page=15}}</ref> Carstvo [[Animalia]]i ([[životinje]]) obuhvata približno 35 koljena, [[Plantae]] ([[biljke]]) 12, a [[Fungi]] ([[gljive]]) oko 7.
 
Carstvo [[Animalia]]i ([[životinje]]) obuhvata približno 35 koljena, [[Plantae]] ([[biljke]]) 12, a [[Fungi]] ([[gljive]]) oko 7.
Novija [[filogenetika|filogenetička]] istraživanja odnosa u ovom [[taksonomski rang|taksonomskom rangu]], svrstavaju ih u veće [[kladus|grane]], kao što su [[Ecdysozoa]] i [[Embryophyta]].
 
 
Neformalno, koljeno se može smatrati grupiranjem organizama na osnovu općeg i specijaliziranog plana tijelesne građe.<ref>{{cite book |last=Valentine |first=James W. |year=2004 |title=On the Origin of Phyla
|publisher=University Of Chicago Press|location=Chicago |isbn=0-226-84548-6 |page=7 |</ref=harv|quote= >Klasifikacije organizama u hijerarhijskihijerarhijske sistemisisteme, bile su bili u upotrebi od XVII i XVIII stoljeća. Obično su organizmi bili grupirani u skladu sa njihovim morfološkim sličnostima, kako su ih vidjeli tihti rani akteri, a te grupe su zatim grupiranipovezivane prema njihovim sličnostima, i tako dalje, da se formira hijerarhijahijerarhijska vertikala. Na najosnovnijoj razini, koljeno se može se definirati na dva načina: kao grupa organizama sa određenim stepenom morfoloških ili razvojnih sličnosti ( u [[fenetika|fenetičkoj]] definiciji), ili grupa organizama sa određenim stepenom evolucijske povezanosti (u [[filogeneza|filogenetskoj].<ref name="Budd2000">{{cite journal|author=Budd, G.E. |author2=Jensen, S. |year=2000 |title=A critical reappraisal of the fossil record of the bilaterian phyla |journal=Biological Reviews |volume=75 |issue=2 |pages=253–295 |doi=10.1111/j.1469-185X.1999.tb00046.x |url=http://www.journals.cambridge.org/abstract_S000632310000548X|accessdate=2007-05-26 |pmid=10881389}}</ref> Bilo je pokušaja da se definira nivo [[Linneova taksonomija | Linneove hijerarhije]] bez koje su odnosi (evolucijske) srodnosti nezadovoljavajući, ali fenetička definicija je korisna kada se bavi pitanjima morfološke prirode, kao što su koliko su uspješni drugačiji planovi tijelesne građe.
 
=== Definicija na temelju genetičkih odnosa ===
Najvažniji cilj mjera u genetičkoj definicija je "određeni stupanj" i kako nevezani da organizmi moraju biti pripadnici različitih koljena. Minimalni uvjet je da bi svi organizmi u ovom taksonomskom rangu trebalo da budu jasno uže međusobno povezani, nego bilo koja druga grupa. Čak i ovo je problematično, jer ovisi o poznavanju odnosa organizama. Kako postaje dostupno više podataka, posebno iz molekulskih istraživanja, pružaju se bolje mogućnosti za prosuđivanje odnosa između grupa. Tako se koljena filuma mogu spojiti ili podijeliti, ako postane jasno da su oni međusobno srodniji ili ne. Na primjer, [[Siboglinidae | bradati crvi]] (''Siboglinidae'') su opisani kao novo koljeno (u [[Pogonophora]]), sredinom 20. stoljeća, ali molekulska istraživanja., rad gotovo pola stoljeća kasnije utvrdila su da su oni grupa [[annelidaAnnelida]], tako da su sada mekadašnji filum bradatih crva spojen sa annelidima (kao [[porodica (biologija) | porodica]]).<ref>{{cite journal | author=Rouse G.W. |title=A cladistic analysis of Siboglinidae Caullery, 1914 (Polychaeta, Annelida): formerly the phyla Pogonophora and Vestimentifera | journal=Zoological Journal of the Linnean Society | volume=132 | issue=1| year=2001 | pages=55–80 | doi = 10.1006/zjls.2000.0263}}</ref> Na drugoj strani, visoko [[parazit]]sko koljeno [[Mesozoa]] je ipodijeljeno u dva kolljena, [[Orthonectida]] i [[Rhombozoa]], kada je otkriveno da su Orthonectida vjerovatno [[deuterostomi]], a Rhombozoa [[protostomi]].<ref>{{cite journal |author=Pawlowski J, Montoya-Burgos JI, Fahrni JF, Wüest J, Zaninetti L |title=Origin of the Mesozoa inferred from 18S rRNA gene sequences |journal=Mol. Biol. Evol. |volume=13 |issue=8 |pages=1128–32 |date=October 1996 |pmid=8865666 |doi= 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025675|url=http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=8865666}}</ref>
 
Ovaj smjenjivost filuma je navela neke biologe da pozovu na a koncept napuštanja ranga koljena u korist [[Kladistika|kladistike]], načina na koji su grupe postavljene
 
===Definicija na osnovu plana tjelesne građe===
Definiciju koljena koja je zasnovan na planu građe tijele su predložili paleontologzi [[Graham Budd]] i [[Sören Jensen]] (kao što je Haeckel je učinio stoljeće ranije). Definicija je postavio jer izumrli organizmi su najteži za klasifikaciju: oni mogu biti ogranci koji su se odvojili od linije, a koljeno pred znakove koji definiraju moderne koljeno je sve stečene. Po Buddovoj i Jensenovoj definiciji, koljeno je definirano skup znakova koje dijele svi današnji predstavnici.
 
Ovaj pristup donosi neke male probleme, jere predačke oznake kod većine članova koljeno možda su samo izgubljene od strane nekih članova. Također, ova definicija se zasniva na proizvoljnom trenutku sadašnjosti. Međutim, kao što je obilježne bazno, lako ga je primijeniti na fosilnim ostacima. Veći problem je u tome što se oslanja na subjektivne odluke o tome koje grupe organizama treba smatrati koljenima.<ref name=Budd2000/> Furthermore, organisms in the stem group of a phylum can possess the "body plan" of the phylum without all the characteristics necessary to fall within it.{{clarify|How is that possible when the definition of the phylum is simply having the body plan?|date=May 2015}} This weakens the idea that each of the phyla represents a distinct body plan.<ref name=Budd1998>{{Cite journal | author = Budd, G. E. | year = 1998 | journal = Lethaia | title = Arthropod body-plan evolution in the Cambrian with an example from anomalocaridid muscle | volume = 31 | issue = 3 | pages = 197–210 | url = http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1502-3931.1998.tb00508.x | publisher = Blackwell Synergy | doi = 10.1111/j.1502-3931.1998.tb00508.x}}</ref>
 
Klasifikacija pomoću ove definicije može biti snažno pogođena šansom za opstanak rijetkih grupa, koje mogu napraviti mnogo raznovrsnije koljeno nego što bi bilo inače. Predstavnici mnogih modernih filuma se nije pojavio do dugo ''nakon'' [[kambrij]]a.<ref name="Briggs2005">{{Cite journal |year=2005 |title=Wonderful strife: systematics, stem groups, and the phylogenetic signal of the Cambrian radiation |journal=Paleobiology |volume=31 |issue=2 (Suppl) |pages=94–112 |doi=10.1666/0094-8373(2005)031[0094:WSSSGA]2.0.CO;2 |author1=Briggs, D. E. G. |authorlink = Derek Briggs|author2=Fortey, R. A.|authorlink2 = Richard Fortey}}</ref>
 
23.119

izmjena