Ideja o postojanju i pojmu tzv. "molekulskog sata" se pripisuje [[Emile Zuckerkandl|Emilu Zuckerlandlu]] i [[Linus Pauling|Linusu Paulingu]] koji su, [[1962]]. godine, primijetili je da se broj razlika u [[aminokiselina]]ma [[hemoglobin]]a između različitih biološkihg loza mijenja otprilike [[linearna funkcija | linearno].] s vremenom, prema procjenama na osnovu fosilnih dokaza.<ref name=Zuckerkand62"Zuckerkand">{{cite book | author = Emile Zuckerkandl|Zuckerkandl, and Linus Pauling| year = 1962 | title = Horizons in Biochemistry | chapter = Molecular disease, evolution, and genic heterogeneity | editor = Kasha, M. and Pullman, B (editors) | pages = 189–225 | publisher = Academic Press, New York}}</ref> Oni su generalizirali ovo zapažanje tvrdnjom da je stopa [[evolucija|evolucijske]] promjene bilo kojeg određenog [[protein]]a otprilike konstantna kroz vrijeme i preko različitih loza (na osnovu '''hipoteze molekulskog sata''' '''[[MCH]]'''.<ref name="Hadžiselimović-<pojskić">{{cite book|author=Hadžiselimović R., Pojskić N.|year=2005|title= Uvod u humanu imunogenetiku.|publisher= Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo|isbn=9958-9344-3-4}}</ref>
Fenomen ''genetičke ekvidistance'' je prvi put naveo [[Emanuel Margoliash]], u [[1963]]., koji je napisao:
