Kod pasivnih hekikaza, postoje značajne aktivacijske barijere (označene kao '''''B''''' >k<sub>B</sub> T, gdje je k<sub>B</sub> [[Boltzmannova konstanta]], a T je temperatura sistema). Zog ovih značajnih barijera, na njihovu progresijuuveliko utiču sekvence nukleinskih kiselina u neopruženim molekulama i prisustvo destabilizirajućih snaga koje utiču na replikacijsku viljušku. Određene kominacije nukleinskih kiselina će smanjivati stopu neopružanja ([[guanin]]a i [[citozin]]a), dok je različite destabilizirajuće sile mogu povećati. U pasivnim sistemima , stopa neopružanja (V<sub>un</sub>) je manje od rate premještanje (V<sub>trans</sub> - duž jednolančane nukleinske kiseline: ssNA). Još jedan način prikaza djelovanja pasivne helikaze je na osnovu prolazne razgradnje baznih parova na replikacijskoj viljuški. kako bi se odredila stopa opuštanja.
Kod aktivnih helikaza, '''''B''''' < k<sub>B</sub>T, gdje sistem ne poseduje značajnu prepreku, helikaza može destabilizirati nukleinske kiseline, odmotavanje dvostruke spirale teče konstantnom brzinom, bez obzira na sekvence nukleinske kiseline.
